RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380221.7

TRAPPC10-202, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC10, Length 1,763 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-202ENST00000380221 ARL8BQ9NVJ2 186 aa26.75■■□□□ 1.87
TRAPPC10-202ENST00000380221 GPRC5BQ9NZH0 403 aa26.75■■□□□ 1.87
TRAPPC10-202ENST00000380221 SDHDO14521 159 aa26.74■■□□□ 1.87
TRAPPC10-202ENST00000380221 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
TRAPPC10-202ENST00000380221 CRCPO75575 148 aa26.74■■□□□ 1.87
TRAPPC10-202ENST00000380221 ATP5HO75947 161 aa26.74■■□□□ 1.87
TRAPPC10-202ENST00000380221 CLDN9O95484 217 aa26.74■■□□□ 1.87
TRAPPC10-202ENST00000380221 XKR6Q5GH73 641 aa26.74■■□□□ 1.87
TRAPPC10-202ENST00000380221 CATSPEREQ5SY80 951 aa26.74■■□□□ 1.87
TRAPPC10-202ENST00000380221 KANK2Q63ZY3 851 aa26.74■■□□□ 1.87
TRAPPC10-202ENST00000380221 HAUS8Q9BT25 410 aa26.74■■□□□ 1.87
TRAPPC10-202ENST00000380221 OR6C74A6NCV1 312 aa26.74■■□□□ 1.87
TRAPPC10-202ENST00000380221 CAPN14A8MX76 684 aa26.74■■□□□ 1.87
TRAPPC10-202ENST00000380221 TRIM38O00635 465 aa26.74■■□□□ 1.87
TRAPPC10-202ENST00000380221 CLGNO14967 610 aa26.74■■□□□ 1.87
TRAPPC10-202ENST00000380221 RETP07949 1114 aa26.74■■□□□ 1.87
TRAPPC10-202ENST00000380221 MYF5P13349 255 aa26.74■■□□□ 1.87
TRAPPC10-202ENST00000380221 IRF8Q02556 426 aa26.74■■□□□ 1.87
TRAPPC10-202ENST00000380221 NXNQ6DKJ4 435 aa26.74■■□□□ 1.87
TRAPPC10-202ENST00000380221 TMPRSS11BQ86T26 416 aa26.74■■□□□ 1.87
TRAPPC10-202ENST00000380221 MINDY1Q8N5J2 469 aa26.74■■□□□ 1.87
TRAPPC10-202ENST00000380221 OR2A1Q8NGT9 310 aa26.74■■□□□ 1.87
TRAPPC10-202ENST00000380221 OR10G6Q8NH81 332 aa26.74■■□□□ 1.87
TRAPPC10-202ENST00000380221 SLC5A11Q8WWX8 675 aa26.74■■□□□ 1.87
TRAPPC10-202ENST00000380221 TUBB6Q9BUF5 446 aa26.74■■□□□ 1.87
TRAPPC10-202ENST00000380221 PCBD2Q9H0N5 130 aa26.74■■□□□ 1.87
TRAPPC10-202ENST00000380221 TRIM33Q9UPN9 1127 aa26.74■■□□□ 1.87
TRAPPC10-202ENST00000380221 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa26.74■■□□□ 1.87
TRAPPC10-202ENST00000380221 WFS1O76024 890 aa26.73■■□□□ 1.87
TRAPPC10-202ENST00000380221 CAPN1P07384 714 aa26.73■■□□□ 1.87
TRAPPC10-202ENST00000380221 HGFP14210 728 aa26.73■■□□□ 1.87
TRAPPC10-202ENST00000380221 INHBCP55103 352 aa26.73■■□□□ 1.87
TRAPPC10-202ENST00000380221 TREML1Q86YW5 311 aa26.73■■□□□ 1.87
TRAPPC10-202ENST00000380221 FAM20CQ8IXL6 584 aa26.73■■□□□ 1.87
TRAPPC10-202ENST00000380221 METTL6Q8TCB7 284 aa26.73■■□□□ 1.87
TRAPPC10-202ENST00000380221 DUSP23Q9BVJ7 150 aa26.73■■□□□ 1.87
TRAPPC10-202ENST00000380221 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa26.73■■□□□ 1.87
TRAPPC10-202ENST00000380221 ISM1B1AKI9 464 aa26.72■■□□□ 1.87
TRAPPC10-202ENST00000380221 UROSP10746 265 aa26.72■■□□□ 1.87
TRAPPC10-202ENST00000380221 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
TRAPPC10-202ENST00000380221 CD22P20273 847 aa26.72■■□□□ 1.87
TRAPPC10-202ENST00000380221 VARSP26640 1264 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
TRAPPC10-202ENST00000380221 DOC2AQ14183 400 aa26.72■■□□□ 1.87
TRAPPC10-202ENST00000380221 TBCCQ15814 346 aa26.72■■□□□ 1.87
TRAPPC10-202ENST00000380221 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
TRAPPC10-202ENST00000380221 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa26.72■■□□□ 1.87
TRAPPC10-202ENST00000380221 L3MBTL4Q8NA19 623 aa26.72■■□□□ 1.87
TRAPPC10-202ENST00000380221 OR4C6Q8NH72 309 aa26.72■■□□□ 1.87
TRAPPC10-202ENST00000380221 NSL1Q96IY1 281 aa26.72■■□□□ 1.87
TRAPPC10-202ENST00000380221 SLC38A3Q99624 504 aa26.72■■□□□ 1.87
TRAPPC10-202ENST00000380221 TRPS1Q9UHF7 1281 aa26.72■■□□□ 1.87
TRAPPC10-202ENST00000380221 RNF215Q9Y6U7 377 aa26.72■■□□□ 1.87
TRAPPC10-202ENST00000380221 LNP1A1A4G5 178 aa26.71■■□□□ 1.87
TRAPPC10-202ENST00000380221 PIPSLA2A3N6 862 aa26.71■■□□□ 1.87
TRAPPC10-202ENST00000380221 ALPPL2P10696 532 aa26.71■■□□□ 1.87
TRAPPC10-202ENST00000380221 CDH1P12830 882 aa26.71■■□□□ 1.87
TRAPPC10-202ENST00000380221 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
TRAPPC10-202ENST00000380221 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP26.71■■□□□ 1.87
TRAPPC10-202ENST00000380221 ICE2Q659A1 982 aa26.71■■□□□ 1.87
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
TRAPPC10-202ENST00000380221 C17orf64Q86WR6 236 aa26.71■■□□□ 1.87
TRAPPC10-202ENST00000380221 TWIST2Q8WVJ9 160 aa26.71■■□□□ 1.87
TRAPPC10-202ENST00000380221 UCK1Q9HA47 277 aa26.71■■□□□ 1.87
TRAPPC10-202ENST00000380221 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
TRAPPC10-202ENST00000380221 LRIT1Q9P2V4 623 aa26.71■■□□□ 1.87
TRAPPC10-202ENST00000380221 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa26.71■■□□□ 1.87
TRAPPC10-202ENST00000380221 FAM221BA6H8Z2 402 aa26.71■■□□□ 1.87
TRAPPC10-202ENST00000380221 FFAR3O14843 346 aa26.71■■□□□ 1.87
TRAPPC10-202ENST00000380221 GPR42O15529 346 aa26.71■■□□□ 1.87
TRAPPC10-202ENST00000380221 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
TRAPPC10-202ENST00000380221 ENO1P06733 434 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
TRAPPC10-202ENST00000380221 TYRP1P17643 537 aa26.71■■□□□ 1.87
TRAPPC10-202ENST00000380221 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
TRAPPC10-202ENST00000380221 PCDH1Q08174 1060 aa26.71■■□□□ 1.87
TRAPPC10-202ENST00000380221 SF1Q15637 639 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
TRAPPC10-202ENST00000380221 CEP70Q8NHQ1 597 aa26.71■■□□□ 1.87
TRAPPC10-202ENST00000380221 ACTRT2Q8TDY3 377 aa26.71■■□□□ 1.87
TRAPPC10-202ENST00000380221 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
TRAPPC10-202ENST00000380221 C19orf60Q96EN9 201 aa26.71■■□□□ 1.87
TRAPPC10-202ENST00000380221 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
TRAPPC10-202ENST00000380221 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
TRAPPC10-202ENST00000380221 TWSG1Q9GZX9 223 aa26.71■■□□□ 1.87
TRAPPC10-202ENST00000380221 HRASLS2Q9NWW9 162 aa26.71■■□□□ 1.87
TRAPPC10-202ENST00000380221 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
TRAPPC10-202ENST00000380221 CACNA1HO95180 2353 aa26.7■■□□□ 1.87
TRAPPC10-202ENST00000380221 GSAPA4D1B5 854 aa26.7■■□□□ 1.86
TRAPPC10-202ENST00000380221 RHPN2P1A8MT19 583 aa26.7■■□□□ 1.86
TRAPPC10-202ENST00000380221 SIGLEC6O43699 453 aa26.7■■□□□ 1.86
TRAPPC10-202ENST00000380221 LIPJQ5W064 366 aa26.7■■□□□ 1.86
TRAPPC10-202ENST00000380221 NXPE4Q6UWF7 544 aa26.7■■□□□ 1.86
TRAPPC10-202ENST00000380221 EID2Q8N6I1 236 aa26.7■■□□□ 1.86
TRAPPC10-202ENST00000380221 RSC1A1Q92681 617 aa26.7■■□□□ 1.86
TRAPPC10-202ENST00000380221 FAM86C1Q9NVL1 165 aa26.7■■□□□ 1.86
TRAPPC10-202ENST00000380221 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa26.7■■□□□ 1.86
TRAPPC10-202ENST00000380221 GPR179Q6PRD1 2367 aa26.69■■□□□ 1.86
TRAPPC10-202ENST00000380221 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa26.69■■□□□ 1.86
TRAPPC10-202ENST00000380221 PCDHGA12O60330 932 aa26.69■■□□□ 1.86
TRAPPC10-202ENST00000380221 UGDHO60701 494 aa26.69■■□□□ 1.86
TRAPPC10-202ENST00000380221 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa26.69■■□□□ 1.86
TRAPPC10-202ENST00000380221 HMOX2P30519 316 aa26.69■■□□□ 1.86
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