RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367367.8

PTPRC-203, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 2,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-203ENST00000367367 EFCAB8A8MWE9 144 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-203ENST00000367367 GPR89AB7ZAQ6 455 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-203ENST00000367367 D6RAR5 112 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-203ENST00000367367 CCDC188H7C350 402 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-203ENST00000367367 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-203ENST00000367367 KMOO15229 486 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-203ENST00000367367 RAD51CO43502 376 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-203ENST00000367367 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-203ENST00000367367 VEGFDO43915 354 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-203ENST00000367367 COQ9O75208 318 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-203ENST00000367367 URI1O94763 535 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-203ENST00000367367 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-203ENST00000367367 VAPBO95292 243 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-203ENST00000367367 TRIM16O95361 564 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-203ENST00000367367 PGM3O95394 542 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-203ENST00000367367 TIAF1O95411 115 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-203ENST00000367367 TUBB4AP04350 444 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-203ENST00000367367 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-203ENST00000367367 GP1BAP07359 652 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-203ENST00000367367 C1QTNF9P0C862 333 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-203ENST00000367367 GPR89BP0CG08 455 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-203ENST00000367367 NEFHP12036 1026 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-203ENST00000367367 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-203ENST00000367367 GLB1P16278 677 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-203ENST00000367367 ITGB6P18564 788 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-203ENST00000367367 IVDP26440 423 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-203ENST00000367367 ALDH4A1P30038 563 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-203ENST00000367367 CSF2RBP32927 897 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-203ENST00000367367 MAGEA3P43357 314 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-203ENST00000367367 MAGEA6P43360 314 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-203ENST00000367367 RPL21P46778 160 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-203ENST00000367367 PRLHRP49683 370 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-203ENST00000367367 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-203ENST00000367367 BPIFB3P59826 476 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-203ENST00000367367 CDK16Q00536 496 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-203ENST00000367367 HHEXQ03014 270 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-203ENST00000367367 ACVR1Q04771 509 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-203ENST00000367367 CACNG1Q06432 222 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-203ENST00000367367 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-203ENST00000367367 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-203ENST00000367367 SPIDRQ14159 915 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-203ENST00000367367 CLCA4Q14CN2 919 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-203ENST00000367367 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-203ENST00000367367 AMZ1Q400G9 498 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-203ENST00000367367 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-203ENST00000367367 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-203ENST00000367367 PCID2Q5JVF3 399 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-203ENST00000367367 NKAIN2Q5VXU1 208 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-203ENST00000367367 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-203ENST00000367367 SLC22A25Q6T423 547 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-203ENST00000367367 AFTPHQ6ULP2 937 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-203ENST00000367367 C4orf22Q6V702 233 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-203ENST00000367367 FRMD7Q6ZUT3 714 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-203ENST00000367367 NEK10Q6ZWH5 1172 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-203ENST00000367367 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-203ENST00000367367 SPRED1Q7Z699 444 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-203ENST00000367367 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-203ENST00000367367 AMZ2Q86W34 360 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-203ENST00000367367 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-203ENST00000367367 ARL14Q8N4G2 192 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-203ENST00000367367 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-203ENST00000367367 GPR150Q8NGU9 434 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-203ENST00000367367 OR4L1Q8NH43 312 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-203ENST00000367367 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-203ENST00000367367 DTX3LQ8TDB6 740 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-203ENST00000367367 FAM136AQ96C01 138 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-203ENST00000367367 DCUN1D1Q96GG9 259 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-203ENST00000367367 KCNC2Q96PR1 638 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-203ENST00000367367 RANBP9Q96S59 729 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-203ENST00000367367 NUDT22Q9BRQ3 303 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-203ENST00000367367 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-203ENST00000367367 TIMM29Q9BSF4 260 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-203ENST00000367367 KIFC1Q9BW19 673 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-203ENST00000367367 DPH5Q9H2P9 285 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-203ENST00000367367 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-203ENST00000367367 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-203ENST00000367367 GPATCH2Q9NW75 528 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-203ENST00000367367 TMEM160Q9NX00 188 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-203ENST00000367367 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-203ENST00000367367 CLCA2Q9UQC9 943 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-203ENST00000367367 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-203ENST00000367367 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-203ENST00000367367 NUP210LQ5VU65 1888 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-203ENST00000367367 KALRNO60229 2985 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-203ENST00000367367 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-203ENST00000367367 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-203ENST00000367367 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-203ENST00000367367 PRR19A6NJB7 356 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-203ENST00000367367 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-203ENST00000367367 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-203ENST00000367367 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-203ENST00000367367 CSO75390 466 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-203ENST00000367367 POP7O75817 140 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-203ENST00000367367 MPOP05164 745 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-203ENST00000367367 RALBP11234 206 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-203ENST00000367367 VCLP18206 1134 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-203ENST00000367367 IDSP22304 550 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-203ENST00000367367 PDHA2P29803 388 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-203ENST00000367367 NSG1P42857 185 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-203ENST00000367367 FASLGP48023 281 aa3.05□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms