RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362869.1

RNU6-552P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 552, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-552P, Length 119 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-552P-201ENST00000362869 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP2.61□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 CALCOCO2Q13137 446 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 NPTX1Q15818 432 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 EXT1Q16394 746 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 MOGAT2Q3SYC2 334 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 ARMC4Q5T2S8 1044 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 ERMARDQ5T6L9 678 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR4A47Q6IF82 309 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 P2RY8Q86VZ1 359 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 SPEM1Q8N4L4 309 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC4A11Q8NBS3 891 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP2.61□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 NUP37Q8NFH4 326 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 KCNE4Q8WWG9 221 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 OMA1Q96E52 524 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 MUS81Q96NY9 551 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 SPAG5Q96R06 1193 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 FEVQ99581 238 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP2.61□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 MED20Q9H944 212 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 THEGQ9P2T0 379 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 KLK13Q9UKR3 277 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 CHKBQ9Y259 395 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP2.61□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP2.6□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 A0A1W2PPK0 400 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 MPTX1A8MV57 137 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 SOCS3O14543 225 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP2.6□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 IDH3BO43837 385 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 KRT33AO76009 404 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 ATP1B1P05026 303 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 AKR1B1P15121 316 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP2.6□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 ACADSP16219 412 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 EPCAMP16422 314 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 CD27P26842 260 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 MC5RP33032 325 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 XGP55808 180 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM50BP56557 158 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 CDH18Q13634 790 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 RAPSNQ13702 412 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 TRIM29Q14134 588 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM266Q2M3C6 531 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 CES4AQ5XG92 561 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 NOTUMQ6P988 496 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 KIF6Q6ZMV9 814 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 CATSPERDQ86XM0 798 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP2.6□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 Q8NBF4 154 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRSS33Q8NF86 280 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR7A2PQ8NGA2 310 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 PROX1Q92786 737 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP2.6□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP2.6□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 MAP3K3Q99759 626 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLF1Q9BQI6 1058 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC2A11Q9BYW1 496 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 NDE1Q9NXR1 346 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 PCNX3Q9H6A9 2034 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 CASTOR2A6NHX0 329 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 AP5Z1O43299 807 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 SNX3O60493 162 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 RPS6KA5O75582 802 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLCO2B1O94956 709 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 CELF2O95319 508 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 CSN3P07498 182 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 MYBL1P10243 752 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 IL11P20809 199 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 CPT2P23786 658 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 SHC1P29353 583 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 RAB28P51157 221 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 SGCGQ13326 291 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 NFATC2Q13469 925 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 MTF1Q14872 753 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM132DQ14C87 1099 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 TAB1Q15750 504 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 CRY2Q49AN0 593 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 GPR33Q49SQ1 333 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 FRRS1Q6ZNA5 592 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 FCRLAQ7L513 359 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 TLK2Q86UE8 772 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 XXYLT1Q8NBI6 393 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 AQP11Q8NBQ7 271 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 METTL21AQ8WXB1 218 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 ROBO4Q8WZ75 1007 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 HDAC11Q96DB2 347 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms