RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297316.4

SOX17-201, Transcript of SRY-box 17, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SOX17, Length 2,342 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX17-201ENST00000297316 TDGQ13569 410 aa20.64■□□□□ 0.89
SOX17-201ENST00000297316 DOC2AQ14183 400 aa20.64■□□□□ 0.89
SOX17-201ENST00000297316 USP30Q70CQ3 517 aa20.64■□□□□ 0.89
SOX17-201ENST00000297316 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
SOX17-201ENST00000297316 SLC13A3Q8WWT9 602 aa20.64■□□□□ 0.89
SOX17-201ENST00000297316 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
SOX17-201ENST00000297316 VCX3BQ9H321 246 aa20.64■□□□□ 0.89
SOX17-201ENST00000297316 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa20.64■□□□□ 0.89
SOX17-201ENST00000297316 CLMPQ9H6B4 373 aa20.64■□□□□ 0.89
SOX17-201ENST00000297316 SCOCQ9UIL1 159 aa20.64■□□□□ 0.89
SOX17-201ENST00000297316 CA14Q9ULX7 337 aa20.64■□□□□ 0.89
SOX17-201ENST00000297316 A0A1W2PPC1 479 aa20.64■□□□□ 0.89
SOX17-201ENST00000297316 DYTNA2CJ06 578 aa20.64■□□□□ 0.89
SOX17-201ENST00000297316 SLC7A1P30825 629 aa20.64■□□□□ 0.89
SOX17-201ENST00000297316 CLCNKAP51800 687 aa20.64■□□□□ 0.89
SOX17-201ENST00000297316 OR52E8Q6IFG1 317 aa20.64■□□□□ 0.89
SOX17-201ENST00000297316 HMBOX1Q6NT76 420 aa20.64■□□□□ 0.89
SOX17-201ENST00000297316 HID1Q8IV36 788 aa20.64■□□□□ 0.89
SOX17-201ENST00000297316 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
SOX17-201ENST00000297316 HLA-CQ95604 372 aa20.64■□□□□ 0.89
SOX17-201ENST00000297316 NEIL2Q969S2 332 aa20.64■□□□□ 0.89
SOX17-201ENST00000297316 ZUFSPQ96AP4 578 aa20.64■□□□□ 0.89
SOX17-201ENST00000297316 CAAP1Q9H8G2 361 aa20.64■□□□□ 0.89
SOX17-201ENST00000297316 VCANP13611 3396 aa20.63■□□□□ 0.89
SOX17-201ENST00000297316 DFNA5O60443 496 aa20.63■□□□□ 0.89
SOX17-201ENST00000297316 B3GALT4O96024 378 aa20.63■□□□□ 0.89
SOX17-201ENST00000297316 IL9P15248 144 aa20.63■□□□□ 0.89
SOX17-201ENST00000297316 TEAD1P28347 426 aa20.63■□□□□ 0.89
SOX17-201ENST00000297316 MAPK9P45984 424 aa20.63■□□□□ 0.89
SOX17-201ENST00000297316 PHC1P78364 1004 aa20.63■□□□□ 0.89
SOX17-201ENST00000297316 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
SOX17-201ENST00000297316 BNIP2Q12982 314 aa20.63■□□□□ 0.89
SOX17-201ENST00000297316 FBXO43Q4G163 708 aa20.63■□□□□ 0.89
SOX17-201ENST00000297316 TPRG1LQ5T0D9 272 aa20.63■□□□□ 0.89
SOX17-201ENST00000297316 LCN8Q6JVE9 175 aa20.63■□□□□ 0.89
SOX17-201ENST00000297316 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa20.63■□□□□ 0.89
SOX17-201ENST00000297316 GTF2H4Q92759 462 aa20.63■□□□□ 0.89
SOX17-201ENST00000297316 TSSK3Q96PN8 268 aa20.63■□□□□ 0.89
SOX17-201ENST00000297316 CGREF1Q99674 301 aa20.63■□□□□ 0.89
SOX17-201ENST00000297316 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
SOX17-201ENST00000297316 VAPAQ9P0L0 249 aa20.63■□□□□ 0.89
SOX17-201ENST00000297316 CAPNS1P04632 268 aa20.62■□□□□ 0.89
SOX17-201ENST00000297316 GLULP15104 373 aa20.62■□□□□ 0.89
SOX17-201ENST00000297316 PRPH2P23942 346 aa20.62■□□□□ 0.89
SOX17-201ENST00000297316 OR4D2P58180 307 aa20.62■□□□□ 0.89
SOX17-201ENST00000297316 TAP2Q03519 686 aa20.62■□□□□ 0.89
SOX17-201ENST00000297316 PWP1Q13610 501 aa20.62■□□□□ 0.89
SOX17-201ENST00000297316 WDR20Q8TBZ3 569 aa20.62■□□□□ 0.89
SOX17-201ENST00000297316 GATA6Q92908 595 aa20.62■□□□□ 0.89
SOX17-201ENST00000297316 CMTM7Q96FZ5 175 aa20.62■□□□□ 0.89
SOX17-201ENST00000297316 EGLN2Q96KS0 407 aa20.62■□□□□ 0.89
SOX17-201ENST00000297316 APOLD1Q96LR9 279 aa20.62■□□□□ 0.89
SOX17-201ENST00000297316 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
SOX17-201ENST00000297316 ZBTB18Q99592 522 aa20.62■□□□□ 0.89
SOX17-201ENST00000297316 FGF22Q9HCT0 170 aa20.62■□□□□ 0.89
SOX17-201ENST00000297316 ACTR3BQ9P1U1 418 aa20.62■□□□□ 0.89
SOX17-201ENST00000297316 GON4LQ3T8J9 2241 aa20.62■□□□□ 0.89
SOX17-201ENST00000297316 SDC1P18827 310 aa20.62■□□□□ 0.89
SOX17-201ENST00000297316 OXTRP30559 389 aa20.62■□□□□ 0.89
SOX17-201ENST00000297316 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
SOX17-201ENST00000297316 CATSPEREQ5SY80 951 aa20.62■□□□□ 0.89
SOX17-201ENST00000297316 LIPJQ5W064 366 aa20.62■□□□□ 0.89
SOX17-201ENST00000297316 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
SOX17-201ENST00000297316 PGBD3Q8N328 593 aa20.62■□□□□ 0.89
SOX17-201ENST00000297316 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
SOX17-201ENST00000297316 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa20.62■□□□□ 0.89
SOX17-201ENST00000297316 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa20.62■□□□□ 0.89
SOX17-201ENST00000297316 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa20.62■□□□□ 0.89
SOX17-201ENST00000297316 GPSM3Q9Y4H4 160 aa20.62■□□□□ 0.89
SOX17-201ENST00000297316 TIPRLO75663 272 aa20.61■□□□□ 0.89
SOX17-201ENST00000297316 NPPAP01160 153 aa20.61■□□□□ 0.89
SOX17-201ENST00000297316 PGRP06401 933 aa20.61■□□□□ 0.89
SOX17-201ENST00000297316 NPPBP16860 134 aa20.61■□□□□ 0.89
SOX17-201ENST00000297316 AMD1P17707 334 aa20.61■□□□□ 0.89
SOX17-201ENST00000297316 RPA4Q13156 261 aa20.61■□□□□ 0.89
SOX17-201ENST00000297316 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
SOX17-201ENST00000297316 SF1Q15637 639 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
SOX17-201ENST00000297316 RNF220Q5VTB9 566 aa20.61■□□□□ 0.89
SOX17-201ENST00000297316 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
SOX17-201ENST00000297316 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
SOX17-201ENST00000297316 AMIGO2Q86SJ2 522 aa20.61■□□□□ 0.89
SOX17-201ENST00000297316 MSRB3Q8IXL7 192 aa20.61■□□□□ 0.89
SOX17-201ENST00000297316 EBPLQ9BY08 206 aa20.61■□□□□ 0.89
SOX17-201ENST00000297316 PPT2Q9UMR5 302 aa20.61■□□□□ 0.89
SOX17-201ENST00000297316 CROCCQ5TZA2 2017 aa20.61■□□□□ 0.89
SOX17-201ENST00000297316 MAGEA13PA6NCF6 341 aa20.61■□□□□ 0.89
SOX17-201ENST00000297316 SH3BGRLO75368 114 aa20.61■□□□□ 0.89
SOX17-201ENST00000297316 PNLIPRP1P54315 467 aa20.61■□□□□ 0.89
SOX17-201ENST00000297316 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
SOX17-201ENST00000297316 GTDC1Q4AE62 458 aa20.61■□□□□ 0.89
SOX17-201ENST00000297316 UNC5DQ6UXZ4 953 aa20.61■□□□□ 0.89
SOX17-201ENST00000297316 TMPRSS11BQ86T26 416 aa20.61■□□□□ 0.89
SOX17-201ENST00000297316 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
SOX17-201ENST00000297316 TMEM126BQ8IUX1 230 aa20.61■□□□□ 0.89
SOX17-201ENST00000297316 BTBD1Q9H0C5 482 aa20.61■□□□□ 0.89
SOX17-201ENST00000297316 IKZF5Q9H5V7 419 aa20.61■□□□□ 0.89
SOX17-201ENST00000297316 SLC6A13Q9NSD5 602 aa20.61■□□□□ 0.89
SOX17-201ENST00000297316 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa20.61■□□□□ 0.89
SOX17-201ENST00000297316 AQP12BA6NM10 295 aa20.6■□□□□ 0.89
SOX17-201ENST00000297316 NPIPB8E9PQR5 432 aa20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 90.1 ms