RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284957.9

RABGEF1-201, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-201ENST00000284957 YIPF3Q9GZM5 350 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 ASIC5Q9NY37 505 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 DMTF1Q9Y222 760 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 A6NCN8 305 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 MAGEB17A8MXT2 336 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 PSMB5P28074 263 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 RABIFP47224 123 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 MTTPP55157 894 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 ART3Q13508 389 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 NXPE4Q6UWF7 544 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 LCTLQ6UWM7 567 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 HPS6Q86YV9 775 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 SPEM1Q8N4L4 309 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF740Q8NDX6 193 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 HUS1BQ8NHY5 278 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 EHD1Q9H4M9 534 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 XKR8Q9H6D3 395 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 INVSQ9Y283 1065 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 MRASO14807 208 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 CCND1P24385 295 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 MMEL1Q495T6 779 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 C16orf89Q6UX73 402 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM129CQ86XR2 697 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 ARHGAP24Q8N264 748 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 DEFB119Q8N690 84 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 CDRT15Q96T59 188 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC39A3Q9BRY0 314 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 CD320Q9NPF0 282 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 SPATA7Q9P0W8 599 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 TAC3Q9UHF0 121 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 DYRK1BQ9Y463 629 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 DGKBQ9Y6T7 804 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 A0A1W2PP18 115 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 PIPSLA2A3N6 862 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 TOR1BO14657 336 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 RASGRP1O95267 797 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 BCKDHAP12694 445 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 CDH1P12830 882 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 AMD1P17707 334 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 JAK1P23458 1154 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 TACR1P25103 407 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF33BQ06732 778 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 TLR1Q15399 786 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 SNCBQ16143 134 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 PIGGQ5H8A4 983 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC30A9Q6PML9 568 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 WASH2PQ6VEQ5 465 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 HID1Q8IV36 788 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 LAS2Q8IYD9 372 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 FBXW8Q8N3Y1 598 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 LIX1Q8N485 282 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 OR52E1Q8NGJ3 308 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 CMTM7Q96FZ5 175 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 WASH6PQ9NQA3 447 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 ICKQ9UPZ9 632 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 A0A0C4DFX4 3053 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM234BA2RU67 622 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 BBIP1A8MTZ0 92 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 FXYD1O00168 92 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 DCNP07585 359 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 HSD17B2P37059 387 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 RAB28P51157 221 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 CEACAM7Q14002 265 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 FZD2Q14332 565 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 PAGE3Q5JUK9 113 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 WASHC2DQ5SRD0 308 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 MED27Q6P2C8 311 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 LAYNQ6UX15 382 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 UBALD2Q8IYN6 164 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 TSPEARQ8WU66 669 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 FCRL1Q96LA6 429 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC6A18Q96N87 628 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 EFCAB11Q9BUY7 163 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 TMEM45AQ9NWC5 275 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 MUTYHQ9UIF7 546 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 CEP192Q8TEP8 1941 aa9□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 CFLARO15519 480 aa9□□□□□ -0.97
RABGEF1-201ENST00000284957 THEGLP0DJG4 465 aa9□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.6 ms