RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000054666.10

VAMP3-201, Transcript of vesicle associated membrane protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VAMP3, Length 2,205 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3-201ENST00000054666 NELFEP18615 380 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
VAMP3-201ENST00000054666 CD22P20273 847 aa8□□□□□ -1.13
VAMP3-201ENST00000054666 PDHA2P29803 388 aa8□□□□□ -1.13
VAMP3-201ENST00000054666 TRPC1P48995 793 aa8□□□□□ -1.13
VAMP3-201ENST00000054666 METAP1P53582 386 aa8□□□□□ -1.13
VAMP3-201ENST00000054666 TUBA4AP68366 448 aa8□□□□□ -1.13
VAMP3-201ENST00000054666 PHEXP78562 749 aa8□□□□□ -1.13
VAMP3-201ENST00000054666 DPTQ07507 201 aa8□□□□□ -1.13
VAMP3-201ENST00000054666 MTAPQ13126 283 aa8□□□□□ -1.13
VAMP3-201ENST00000054666 SLC36A3Q495N2 470 aa8□□□□□ -1.13
VAMP3-201ENST00000054666 CCSMST1Q4G0I0 132 aa8□□□□□ -1.13
VAMP3-201ENST00000054666 KCTD21Q4G0X4 260 aa8□□□□□ -1.13
VAMP3-201ENST00000054666 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
VAMP3-201ENST00000054666 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
VAMP3-201ENST00000054666 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
VAMP3-201ENST00000054666 MED27Q6P2C8 311 aa8□□□□□ -1.13
VAMP3-201ENST00000054666 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa8□□□□□ -1.13
VAMP3-201ENST00000054666 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
VAMP3-201ENST00000054666 GPR149Q86SP6 731 aa8□□□□□ -1.13
VAMP3-201ENST00000054666 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa8□□□□□ -1.13
VAMP3-201ENST00000054666 RIMKLAQ8IXN7 391 aa8□□□□□ -1.13
VAMP3-201ENST00000054666 ZNF786Q8N393 782 aa8□□□□□ -1.13
VAMP3-201ENST00000054666 SNX19Q92543 992 aa8□□□□□ -1.13
VAMP3-201ENST00000054666 FGF13Q92913 245 aa8□□□□□ -1.13
VAMP3-201ENST00000054666 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
VAMP3-201ENST00000054666 PANX1Q96RD7 426 aa8□□□□□ -1.13
VAMP3-201ENST00000054666 INPP5KQ9BT40 448 aa8□□□□□ -1.13
VAMP3-201ENST00000054666 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
VAMP3-201ENST00000054666 MAGIXQ9H6Y5 334 aa8□□□□□ -1.13
VAMP3-201ENST00000054666 TRIM39Q9HCM9 518 aa8□□□□□ -1.13
VAMP3-201ENST00000054666 SERHLQ9NQF3 203 aa8□□□□□ -1.13
VAMP3-201ENST00000054666 HPS4Q9NQG7 708 aa8□□□□□ -1.13
VAMP3-201ENST00000054666 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
VAMP3-201ENST00000054666 OBP2AQ9NY56 170 aa8□□□□□ -1.13
VAMP3-201ENST00000054666 DNAJB9Q9UBS3 223 aa8□□□□□ -1.13
VAMP3-201ENST00000054666 ZNF639Q9UID6 485 aa8□□□□□ -1.13
VAMP3-201ENST00000054666 FADS3Q9Y5Q0 445 aa8□□□□□ -1.13
VAMP3-201ENST00000054666 FPGTO14772 594 aa7.99□□□□□ -1.13
VAMP3-201ENST00000054666 VEGFDO43915 354 aa7.99□□□□□ -1.13
VAMP3-201ENST00000054666 MMP20O60882 483 aa7.99□□□□□ -1.13
VAMP3-201ENST00000054666 CREG1O75629 220 aa7.99□□□□□ -1.13
VAMP3-201ENST00000054666 SOD1P00441 154 aa7.99□□□□□ -1.13
VAMP3-201ENST00000054666 HPRP00739 348 aa7.99□□□□□ -1.13
VAMP3-201ENST00000054666 CST1P01037 141 aa7.99□□□□□ -1.13
VAMP3-201ENST00000054666 ALDH3A2P51648 485 aa7.99□□□□□ -1.13
VAMP3-201ENST00000054666 ARSFP54793 590 aa7.99□□□□□ -1.13
VAMP3-201ENST00000054666 PHC1P78364 1004 aa7.99□□□□□ -1.13
VAMP3-201ENST00000054666 PCDH1Q08174 1060 aa7.99□□□□□ -1.13
VAMP3-201ENST00000054666 EPS8Q12929 822 aa7.99□□□□□ -1.13
VAMP3-201ENST00000054666 DAG1Q14118 895 aa7.99□□□□□ -1.13
VAMP3-201ENST00000054666 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
VAMP3-201ENST00000054666 DUOXA1Q1HG43 343 aa7.99□□□□□ -1.13
VAMP3-201ENST00000054666 PYCR3Q53H96 274 aa7.99□□□□□ -1.13
VAMP3-201ENST00000054666 FAM46CQ5VWP2 391 aa7.99□□□□□ -1.13
VAMP3-201ENST00000054666 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa7.99□□□□□ -1.13
VAMP3-201ENST00000054666 DOK6Q6PKX4 331 aa7.99□□□□□ -1.13
VAMP3-201ENST00000054666 CRTC3Q6UUV7 619 aa7.99□□□□□ -1.13
VAMP3-201ENST00000054666 ENPP6Q6UWR7 440 aa7.99□□□□□ -1.13
VAMP3-201ENST00000054666 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
VAMP3-201ENST00000054666 NLRP8Q86W28 1048 aa7.99□□□□□ -1.13
VAMP3-201ENST00000054666 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
VAMP3-201ENST00000054666 YAF2Q8IY57 180 aa7.99□□□□□ -1.13
VAMP3-201ENST00000054666 EID3Q8N140 333 aa7.99□□□□□ -1.13
VAMP3-201ENST00000054666 GALNT15Q8N3T1 639 aa7.99□□□□□ -1.13
VAMP3-201ENST00000054666 SVOPLQ8N434 492 aa7.99□□□□□ -1.13
VAMP3-201ENST00000054666 RNF175Q8N4F7 328 aa7.99□□□□□ -1.13
VAMP3-201ENST00000054666 VPS37AQ8NEZ2 397 aa7.99□□□□□ -1.13
VAMP3-201ENST00000054666 FOXJ1Q92949 421 aa7.99□□□□□ -1.13
VAMP3-201ENST00000054666 TMBIM1Q969X1 311 aa7.99□□□□□ -1.13
VAMP3-201ENST00000054666 RAB7BQ96AH8 199 aa7.99□□□□□ -1.13
VAMP3-201ENST00000054666 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
VAMP3-201ENST00000054666 EGLN2Q96KS0 407 aa7.99□□□□□ -1.13
VAMP3-201ENST00000054666 OR4K3Q96R72 315 aa7.99□□□□□ -1.13
VAMP3-201ENST00000054666 EFCAB11Q9BUY7 163 aa7.99□□□□□ -1.13
VAMP3-201ENST00000054666 OLAHQ9NV23 265 aa7.99□□□□□ -1.13
VAMP3-201ENST00000054666 DZANK1Q9NVP4 752 aa7.99□□□□□ -1.13
VAMP3-201ENST00000054666 GDE1Q9NZC3 331 aa7.99□□□□□ -1.13
VAMP3-201ENST00000054666 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
VAMP3-201ENST00000054666 A0A087WXM4 84 aa7.99□□□□□ -1.13
VAMP3-201ENST00000054666 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa7.99□□□□□ -1.13
VAMP3-201ENST00000054666 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa7.99□□□□□ -1.13
VAMP3-201ENST00000054666 MGAT4DA6NG13 374 aa7.99□□□□□ -1.13
VAMP3-201ENST00000054666 MAGEB17A8MXT2 336 aa7.99□□□□□ -1.13
VAMP3-201ENST00000054666 K7ESM1 405 aa7.99□□□□□ -1.13
VAMP3-201ENST00000054666 PLK4O00444 970 aa7.99□□□□□ -1.13
VAMP3-201ENST00000054666 PLOD2O00469 737 aa7.99□□□□□ -1.13
VAMP3-201ENST00000054666 DLGAP1O14490 977 aa7.99□□□□□ -1.13
VAMP3-201ENST00000054666 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
VAMP3-201ENST00000054666 E2F6O75461 281 aa7.99□□□□□ -1.13
VAMP3-201ENST00000054666 PRKD3O94806 890 aa7.99□□□□□ -1.13
VAMP3-201ENST00000054666 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
VAMP3-201ENST00000054666 OR6B1O95007 311 aa7.99□□□□□ -1.13
VAMP3-201ENST00000054666 SERPINA1P01009 418 aa7.99□□□□□ -1.13
VAMP3-201ENST00000054666 EPHX1P07099 455 aa7.99□□□□□ -1.13
VAMP3-201ENST00000054666 EN2P19622 333 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
VAMP3-201ENST00000054666 CDKN2CP42773 168 aa7.99□□□□□ -1.13
VAMP3-201ENST00000054666 C21orf58P58505 322 aa7.99□□□□□ -1.13
VAMP3-201ENST00000054666 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
VAMP3-201ENST00000054666 MESP2Q0VG99 397 aa7.99□□□□□ -1.13
VAMP3-201ENST00000054666 DUSP6Q16828 381 aa7.99□□□□□ -1.13
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