RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627440.2

SNAP23-223, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5 BASIC

Gene SNAP23, Length 210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-223	ENST00000627440	TOR1AIP1	Q5JTV8	583 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	FNBP1L	Q5T0N5	605 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	MANEAL	Q5VSG8	457 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	SYPL2	Q5VXT5	272 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	OLFML2A	Q68BL7	652 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	SPOPL	Q6IQ16	392 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	LRRC31	Q6UY01	552 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	GLCCI1	Q86VQ1	547 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM109A	Q8N4B1	249 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	NETO2	Q8NC67	525 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	FBXO30	Q8TB52	745 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	M1AP	Q8TC57	530 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	ADAMTS15	Q8TE58	950 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	HTRA1	Q92743	480 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	SCAMP4	Q969E2	229 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	TADA1	Q96BN2	335 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	CDK5RAP3	Q96JB5	506 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	NTMT1	Q9BV86	223 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	TRIM62	Q9BVG3	475 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	SFXN3	Q9BWM7	321 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	PITPNM3	Q9BZ71	974 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	CARD9	Q9H257	536 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	PIGM	Q9H3S5	423 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	CYP3A43	Q9HB55	503 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM60A	Q9NP50	221 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	IMP3	Q9NV31	184 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	IL1RAPL1	Q9NZN1	696 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	TSPAN16	Q9UKR8	245 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	PCDHGC3	Q9UN70	934 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	MOK	Q9UQ07	419 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	SPEF1	Q9Y4P9	236 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	MAU2	Q9Y6X3	613 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	TRGV5	A0A0B4J1U4	118 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	ESYT3	A0FGR9	886 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	GTPBP10	A4D1E9	387 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	DNAJC9-AS1	A6NH13	148 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	LRRC14B	A6NHZ5	514 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440		A8MXE2	369 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440		H3BRJ5	948 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	PSMD11	O00231	422 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	KLF4	O43474	513 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	HCRTR1	O43613	425 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	PAGE1	O75459	146 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	FBXO21	O94952	628 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	SETSIP	P0DME0	302 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	PRDX3	P30048	256 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	CCKAR	P32238	428 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	VIPR1	P32241	457 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	PCGF2	P35227	344 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	CD79B	P40259	229 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	PIK3CA	P42336	1068 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	MAGEA5	P43359	124 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	PDLIM4	P50479	330 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	CYP24A1	Q07973	514 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	SNRNP35	Q16560	246 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	MUM1	Q2TAK8	710 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	NRN1L	Q496H8	165 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	GPR157	Q5UAW9	335 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	FOXB2	Q5VYV0	432 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	NSUN5P2	Q63ZY6	315 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	ACAD10	Q6JQN1	1059 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440		Q6ZUG5	572 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	HOOK3	Q86VS8	718 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	DRC7	Q8IY82	874 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	CAVIN3	Q969G5	261 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	ANKRD9	Q96BM1	317 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	TUBGCP5	Q96RT8	1024 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	CACNG6	Q9BXT2	260 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	TTTY12	Q9BZ98	90 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	GRIP2	Q9C0E4	1043 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	MIS12	Q9H081	205 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	CDCP1	Q9H5V8	836 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	ATP13A3	Q9H7F0	1226 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	TRIM45	Q9H8W5	580 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	TCF7L1	Q9HCS4	588 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	DDIT4	Q9NX09	232 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	SPRR3	Q9UBC9	169 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC23A2	Q9UGH3	650 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	DRG1	Q9Y295	367 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	WDR37	Q9Y2I8	494 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	PCDHA3	Q9Y5H8	950 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	NDUFS8	O00217	210 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	NDC80	O14777	642 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	CLOCK	O15516	846 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	SART1	O43290	800 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	GCNT3	O95395	438 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	CD8A	P01732	235 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	FES	P07332	822 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	RNASE1	P07998	156 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	RBMY1C	P0DJD4	496 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF7	P17097	686 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	ENDOU	P21128	410 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	APEX1	P27695	318 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	TPP2	P29144	1249 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	UGT2B10	P36537	528 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	BCL6	P41182	706 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	GABRA4	P48169	554 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	PCYT1A	P49585	367 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	HLCS	P50747	726 aa		5.74	□□□□□ -1.49

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