RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 SEL1L2Q5TEA6 688 aa23.79■■□□□ 1.4
PTPRF-216ENST00000617451 LINC00696Q6ZRV3 163 aa23.79■■□□□ 1.4
PTPRF-216ENST00000617451 RNF44Q7L0R7 432 aa23.79■■□□□ 1.4
PTPRF-216ENST00000617451 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP23.79■■□□□ 1.4
PTPRF-216ENST00000617451 MPP5Q8N3R9 675 aa23.79■■□□□ 1.4
PTPRF-216ENST00000617451 CCDC89Q8N998 374 aa23.79■■□□□ 1.4
PTPRF-216ENST00000617451 MIEF2Q96C03 454 aa23.79■■□□□ 1.4
PTPRF-216ENST00000617451 PAK5Q9P286 719 aa23.79■■□□□ 1.4
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP23.79■■□□□ 1.4
PTPRF-216ENST00000617451 A0A0J9YVX5 310 aa23.78■■□□□ 1.4
PTPRF-216ENST00000617451 NDUFS3O75489 264 aa23.78■■□□□ 1.4
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PTPRF-216ENST00000617451 CCNFP41002 786 aa23.78■■□□□ 1.4
PTPRF-216ENST00000617451 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP23.78■■□□□ 1.4
PTPRF-216ENST00000617451 CRADDP78560 199 aa23.78■■□□□ 1.4
PTPRF-216ENST00000617451 SNX1Q13596 522 aa23.78■■□□□ 1.4
PTPRF-216ENST00000617451 ATG9BQ674R7 924 aa23.78■■□□□ 1.4
PTPRF-216ENST00000617451 CATSPER1Q8NEC5 780 aa23.78■■□□□ 1.4
PTPRF-216ENST00000617451 FOPNLQ96NB1 174 aa23.78■■□□□ 1.4
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF160Q9HCG1 818 aa23.78■■□□□ 1.4
PTPRF-216ENST00000617451 C3orf18Q9UK00 162 aa23.78■■□□□ 1.4
PTPRF-216ENST00000617451 CROCCQ5TZA2 2017 aa23.77■■□□□ 1.4
PTPRF-216ENST00000617451 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa23.77■■□□□ 1.4
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PTPRF-216ENST00000617451 PER3P56645 1201 aa23.77■■□□□ 1.4
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PTPRF-216ENST00000617451 PRSS58Q8IYP2 241 aa23.77■■□□□ 1.4
PTPRF-216ENST00000617451 MAGEC3Q8TD91 643 aa23.77■■□□□ 1.4
PTPRF-216ENST00000617451 C8orf44Q96CB5 159 aa23.77■■□□□ 1.4
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PTPRF-216ENST00000617451 OR2A25A4D2G3 310 aa23.76■■□□□ 1.39
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PTPRF-216ENST00000617451 VWA2Q5GFL6 755 aa23.76■■□□□ 1.39
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PTPRF-216ENST00000617451 C1QL3Q5VWW1 255 aa23.76■■□□□ 1.39
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PTPRF-216ENST00000617451 SLC34A3Q8N130 599 aa23.76■■□□□ 1.39
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PTPRF-216ENST00000617451 H0YGG7 62 aa23.74■■□□□ 1.39
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PTPRF-216ENST00000617451 ERVK-10P10266 1014 aa23.74■■□□□ 1.39
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PTPRF-216ENST00000617451 CMPK1P30085 196 aa23.74■■□□□ 1.39
PTPRF-216ENST00000617451 NPY2RP49146 381 aa23.74■■□□□ 1.39
PTPRF-216ENST00000617451 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
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PTPRF-216ENST00000617451 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
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PTPRF-216ENST00000617451 LPGAT1Q92604 370 aa23.73■■□□□ 1.39
PTPRF-216ENST00000617451 CABS1Q96KC9 395 aa23.73■■□□□ 1.39
PTPRF-216ENST00000617451 KIFC1Q9BW19 673 aa23.73■■□□□ 1.39
PTPRF-216ENST00000617451 BFARQ9NZS9 450 aa23.73■■□□□ 1.39
PTPRF-216ENST00000617451 CDC14AQ9UNH5 594 aa23.73■■□□□ 1.39
PTPRF-216ENST00000617451 AP3B1O00203 1094 aa23.72■■□□□ 1.39
PTPRF-216ENST00000617451 ZG16O60844 167 aa23.72■■□□□ 1.39
PTPRF-216ENST00000617451 NIPSNAP2O75323 286 aa23.72■■□□□ 1.39
PTPRF-216ENST00000617451 VAPBO95292 243 aa23.72■■□□□ 1.39
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