RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612229.4

PTPRT-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 11,285 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-209ENST00000612229 CHIAQ9BZP6 476 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 IPPKQ9H8X2 491 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 CMAHPQ9Y471 501 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 PIP5K1CO60331 668 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 STK16O75716 305 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 C7P10643 843 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 ATAD3CQ5T2N8 411 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 PAQR7Q86WK9 346 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 PLEKHO2Q8TD55 490 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 RNF128Q8TEB7 428 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 FEM1AQ9BSK4 669 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 C3P01024 1663 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 KLHL33A6NCF5 533 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 C2P06681 752 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 BMP6P22004 513 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 ABCG1P45844 678 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 SMSP52788 366 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 GK3PQ14409 553 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 GPR139Q6DWJ6 353 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 NIPAL3Q6P499 406 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 FIGNL1Q6PIW4 674 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 SLC22A15Q8IZD6 547 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 STON2Q8WXE9 905 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 MMP27Q9H306 513 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM45AQ9NWC5 275 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 DERAQ9Y315 318 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 CAPN3P20807 821 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 SLC2A5P22732 501 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 BDNFP23560 247 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF81P51508 661 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 HADHBP55084 474 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 FKBP1BP68106 108 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 DAG1Q14118 895 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 CYP1B1Q16678 543 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 SPIN4Q56A73 249 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 RAB39BQ96DA2 213 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 FAM84AQ96KN4 292 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 ANXA8P13928 327 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 MMP8P22894 467 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 CMPK1P30085 196 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 UQCRC1P31930 480 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 HMGN3Q15651 99 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 C2orf76Q3KRA6 126 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 IFI44LQ53G44 452 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 RAET1GQ6H3X3 334 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 SLC30A6Q6NXT4 461 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 GID4Q8IVV7 300 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 RIPOR3Q96MK2 946 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 RDH12Q96NR8 316 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 RAD9AQ99638 391 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 ITPKAP23677 461 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 CDKN2BP42772 138 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 DCCP43146 1447 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 CDH8P55286 799 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 JAM2P57087 298 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 PFKPQ01813 784 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 CACNG1Q06432 222 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 NOMO1Q15155 1222 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 LAS2Q8IYD9 372 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 AZIN2Q96A70 460 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 ARL5BQ96KC2 179 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 CORO1BQ9BR76 489 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 SLC5A7Q9GZV3 580 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 TIGARQ9NQ88 270 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 TAS2R10Q9NYW0 307 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 CFAP97Q9P2B7 532 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 UBE2Q2LH0YL09 131 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 SCGB1D2O95969 90 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 PRPH2P23942 346 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 RYKP34925 604 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 DPP6P42658 865 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 CXCR3P49682 368 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 CREB3L2Q70SY1 520 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 SLC15A3Q8IY34 581 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 LGMNQ99538 433 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 DUSP16Q9BY84 665 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 BIN3Q9NQY0 253 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 LRFN1Q9P244 771 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 ERVK-11Q9UQG0 969 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 DLGAP1O14490 977 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 DFNA5O60443 496 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 SLITRK5O94991 958 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 MT-ND5P03915 603 aa6.82□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms