RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 FDFT1P37268 417 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-211ENST00000590874 KCNK10P57789 538 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-211ENST00000590874 ARG2P78540 354 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-211ENST00000590874 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-211ENST00000590874 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-211ENST00000590874 TTC23LQ6PF05 361 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-211ENST00000590874 LAPTM4BQ86VI4 370 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-211ENST00000590874 KBTBD2Q8IY47 623 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-211ENST00000590874 HMGCLL1Q8TB92 370 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-211ENST00000590874 TAAR6Q96RI8 345 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-211ENST00000590874 PLA2G3Q9NZ20 509 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-211ENST00000590874 PTGFRNQ9P2B2 879 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-211ENST00000590874 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-211ENST00000590874 E7EVH7 732 aa24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-211ENST00000590874 USP1O94782 785 aa24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-211ENST00000590874 IFNB1P01574 187 aa24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-211ENST00000590874 STIP1P31948 543 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-211ENST00000590874 SOX11P35716 441 aa24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-211ENST00000590874 OASLQ15646 514 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-211ENST00000590874 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-211ENST00000590874 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-211ENST00000590874 PEX13Q92968 403 aa24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-211ENST00000590874 CHRAC1Q9NRG0 131 aa24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-211ENST00000590874 ANAPC5Q9UJX4 755 aa24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-211ENST00000590874 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A0U1RQJ8 604 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-211ENST00000590874 FFAR3O14843 346 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-211ENST00000590874 PCDH17O14917 1159 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-211ENST00000590874 GPR42O15529 346 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-211ENST00000590874 LIASO43766 372 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-211ENST00000590874 PRR35P0CG20 571 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-211ENST00000590874 ETS1P14921 441 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-211ENST00000590874 FBLP22087 321 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-211ENST00000590874 TTPAP49638 278 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-211ENST00000590874 TNFSF10P50591 281 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-211ENST00000590874 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-211ENST00000590874 CNSTQ6PJW8 725 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-211ENST00000590874 RAB42Q8N4Z0 105 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-211ENST00000590874 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-211ENST00000590874 GSDMBQ8TAX9 411 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-211ENST00000590874 RELTQ969Z4 430 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-211ENST00000590874 PANX3Q96QZ0 392 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-211ENST00000590874 SYNPO2LQ9H987 977 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-211ENST00000590874 RAB6BQ9NRW1 208 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-211ENST00000590874 COPG2Q9UBF2 871 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-211ENST00000590874 GNPTGQ9UJJ9 305 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-211ENST00000590874 DYTNA2CJ06 578 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-211ENST00000590874 OR2A25A4D2G3 310 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-211ENST00000590874 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-211ENST00000590874 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-211ENST00000590874 MUM1Q2TAK8 710 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-211ENST00000590874 PRTGQ2VWP7 1150 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-211ENST00000590874 FBXO42Q6P3S6 717 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-211ENST00000590874 NDUFAF7Q7L592 441 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-211ENST00000590874 KIAA1328Q86T90 577 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-211ENST00000590874 SYCE1Q8N0S2 351 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-211ENST00000590874 SIRT6Q8N6T7 355 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-211ENST00000590874 NR4A3Q92570 626 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-211ENST00000590874 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-211ENST00000590874 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-211ENST00000590874 F10P00742 488 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-211ENST00000590874 CELA2AP08217 269 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-211ENST00000590874 ERVK-10P10266 1014 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-211ENST00000590874 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-211ENST00000590874 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-211ENST00000590874 OTOAQ7RTW8 1153 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-211ENST00000590874 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-211ENST00000590874 HES6Q96HZ4 224 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-211ENST00000590874 CABS1Q96KC9 395 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-211ENST00000590874 DPH7Q9BTV6 452 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-211ENST00000590874 ACAT2Q9BWD1 397 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-211ENST00000590874 SPATA7Q9P0W8 599 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-211ENST00000590874 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-211ENST00000590874 TRAV17A0A0B4J275 112 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A1W2PQ72 361 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-211ENST00000590874 IDSB3KWA1 339 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-211ENST00000590874 H0YGG7 62 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-211ENST00000590874 SERPINA7P05543 415 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-211ENST00000590874 APRTP07741 180 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-211ENST00000590874 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-211ENST00000590874 GRNP28799 593 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-211ENST00000590874 EMP2P54851 167 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-211ENST00000590874 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-211ENST00000590874 CRADDP78560 199 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-211ENST00000590874 INAQ16352 499 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-211ENST00000590874 CTSL3PQ5NE16 218 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-211ENST00000590874 FAAH2Q6GMR7 532 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-211ENST00000590874 MCEMP1Q8IX19 187 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-211ENST00000590874 AMER2Q8N7J2 671 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-211ENST00000590874 HAS2Q92819 552 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-211ENST00000590874 TREX1Q9NSU2 369 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-211ENST00000590874 TRPC4Q9UBN4 977 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-211ENST00000590874 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-211ENST00000590874 MRFAP1Q9Y605 127 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-211ENST00000590874 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.5
CAPNS1-211ENST00000590874 KPNA5O15131 536 aa24.39■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 FDXRP22570 491 aa24.39■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP24.39■■□□□ 1.498e-7■■■■□ 23
CAPNS1-211ENST00000590874 CMPK1P30085 196 aa24.39■■□□□ 1.49
CAPNS1-211ENST00000590874 CCNFP41002 786 aa24.39■■□□□ 1.49
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