RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590422.1

CTIF-208, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 412 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-208ENST00000590422 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
CTIF-208ENST00000590422 CNDP1Q96KN2 507 aa11.56□□□□□ -0.56
CTIF-208ENST00000590422 BIRC8Q96P09 236 aa11.56□□□□□ -0.56
CTIF-208ENST00000590422 AGAP4Q96P64 663 aa11.56□□□□□ -0.56
CTIF-208ENST00000590422 CRB3Q9BUF7 120 aa11.56□□□□□ -0.56
CTIF-208ENST00000590422 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa11.56□□□□□ -0.56
CTIF-208ENST00000590422 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
CTIF-208ENST00000590422 GNPTGQ9UJJ9 305 aa11.56□□□□□ -0.56
CTIF-208ENST00000590422 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
CTIF-208ENST00000590422 KLK4Q9Y5K2 254 aa11.56□□□□□ -0.56
CTIF-208ENST00000590422 LRBAP50851 2863 aa11.56□□□□□ -0.56
CTIF-208ENST00000590422 CSMD1Q96PZ7 3565 aa11.55□□□□□ -0.56
CTIF-208ENST00000590422 TARM1B6A8C7 271 aa11.55□□□□□ -0.56
CTIF-208ENST00000590422 GOLGA8KD6RF30 607 aa11.55□□□□□ -0.56
CTIF-208ENST00000590422 GOLGA8TH3BQL2 631 aa11.55□□□□□ -0.56
CTIF-208ENST00000590422 NIPSNAP2O75323 286 aa11.55□□□□□ -0.56
CTIF-208ENST00000590422 KLHL18O94889 574 aa11.55□□□□□ -0.56
CTIF-208ENST00000590422 F7P08709 466 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
CTIF-208ENST00000590422 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
CTIF-208ENST00000590422 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP11.55□□□□□ -0.56
CTIF-208ENST00000590422 TSFMP43897 325 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
CTIF-208ENST00000590422 CDC16Q13042 620 aa11.55□□□□□ -0.56
CTIF-208ENST00000590422 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
CTIF-208ENST00000590422 GBX1Q14549 363 aa11.55□□□□□ -0.56
CTIF-208ENST00000590422 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
CTIF-208ENST00000590422 PCID2Q5JVF3 399 aa11.55□□□□□ -0.56
CTIF-208ENST00000590422 MEI1Q5TIA1 1274 aa11.55□□□□□ -0.56
CTIF-208ENST00000590422 CES3Q6UWW8 571 aa11.55□□□□□ -0.56
CTIF-208ENST00000590422 LINC00696Q6ZRV3 163 aa11.55□□□□□ -0.56
CTIF-208ENST00000590422 OTOAQ7RTW8 1153 aa11.55□□□□□ -0.56
CTIF-208ENST00000590422 AMER2Q8N7J2 671 aa11.55□□□□□ -0.56
CTIF-208ENST00000590422 CCDC89Q8N998 374 aa11.55□□□□□ -0.56
CTIF-208ENST00000590422 CATSPER1Q8NEC5 780 aa11.55□□□□□ -0.56
CTIF-208ENST00000590422 HMGCLL1Q8TB92 370 aa11.55□□□□□ -0.56
CTIF-208ENST00000590422 DNAJB14Q8TBM8 379 aa11.55□□□□□ -0.56
CTIF-208ENST00000590422 STT3BQ8TCJ2 826 aa11.55□□□□□ -0.56
CTIF-208ENST00000590422 LPGAT1Q92604 370 aa11.55□□□□□ -0.56
CTIF-208ENST00000590422 ZUFSPQ96AP4 578 aa11.55□□□□□ -0.56
CTIF-208ENST00000590422 RAD51AP1Q96B01 352 aa11.55□□□□□ -0.56
CTIF-208ENST00000590422 MFSD3Q96ES6 412 aa11.55□□□□□ -0.56
CTIF-208ENST00000590422 PANX3Q96QZ0 392 aa11.55□□□□□ -0.56
CTIF-208ENST00000590422 ACAT2Q9BWD1 397 aa11.55□□□□□ -0.56
CTIF-208ENST00000590422 LHPPQ9H008 270 aa11.55□□□□□ -0.56
CTIF-208ENST00000590422 ZNF160Q9HCG1 818 aa11.55□□□□□ -0.56
CTIF-208ENST00000590422 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
CTIF-208ENST00000590422 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa11.55□□□□□ -0.56
CTIF-208ENST00000590422 SEMA3GQ9NS98 782 aa11.55□□□□□ -0.56
CTIF-208ENST00000590422 SYBUQ9NX95 663 aa11.55□□□□□ -0.56
CTIF-208ENST00000590422 PAK5Q9P286 719 aa11.55□□□□□ -0.56
CTIF-208ENST00000590422 ANAPC5Q9UJX4 755 aa11.55□□□□□ -0.56
CTIF-208ENST00000590422 FAM169AQ9Y6X4 670 aa11.55□□□□□ -0.56
CTIF-208ENST00000590422 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa11.54□□□□□ -0.56
CTIF-208ENST00000590422 OR2A25A4D2G3 310 aa11.54□□□□□ -0.56
CTIF-208ENST00000590422 ARHGEF33A8MVX0 844 aa11.54□□□□□ -0.56
CTIF-208ENST00000590422 NDUFS3O75489 264 aa11.54□□□□□ -0.56
CTIF-208ENST00000590422 FKBP9O95302 570 aa11.54□□□□□ -0.56
CTIF-208ENST00000590422 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
CTIF-208ENST00000590422 ZGLP1P0C6A0 271 aa11.54□□□□□ -0.56
CTIF-208ENST00000590422 ACPPP15309 386 aa11.54□□□□□ -0.56
CTIF-208ENST00000590422 MGAT1P26572 445 aa11.54□□□□□ -0.56
CTIF-208ENST00000590422 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
CTIF-208ENST00000590422 GNG11P61952 73 aa11.54□□□□□ -0.56
CTIF-208ENST00000590422 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
CTIF-208ENST00000590422 BASP1P80723 227 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
CTIF-208ENST00000590422 PRTGQ2VWP7 1150 aa11.54□□□□□ -0.56
CTIF-208ENST00000590422 VWA2Q5GFL6 755 aa11.54□□□□□ -0.56
CTIF-208ENST00000590422 LAPTM4BQ86VI4 370 aa11.54□□□□□ -0.56
CTIF-208ENST00000590422 SLC35F6Q8N357 371 aa11.54□□□□□ -0.56
CTIF-208ENST00000590422 MPP5Q8N3R9 675 aa11.54□□□□□ -0.56
CTIF-208ENST00000590422 OTUD6BQ8N6M0 293 aa11.54□□□□□ -0.56
CTIF-208ENST00000590422 GSDMBQ8TAX9 411 aa11.54□□□□□ -0.56
CTIF-208ENST00000590422 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
CTIF-208ENST00000590422 DPH7Q9BTV6 452 aa11.54□□□□□ -0.56
CTIF-208ENST00000590422 ZNF304Q9HCX3 659 aa11.54□□□□□ -0.56
CTIF-208ENST00000590422 GALPQ9UBC7 116 aa11.54□□□□□ -0.56
CTIF-208ENST00000590422 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
CTIF-208ENST00000590422 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
CTIF-208ENST00000590422 C3orf18Q9UK00 162 aa11.54□□□□□ -0.56
CTIF-208ENST00000590422 OSGIN2Q9Y236 505 aa11.54□□□□□ -0.56
CTIF-208ENST00000590422 MYO7BQ6PIF6 2116 aa11.54□□□□□ -0.56
CTIF-208ENST00000590422 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa11.53□□□□□ -0.56
CTIF-208ENST00000590422 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa11.53□□□□□ -0.56
CTIF-208ENST00000590422 ESPNB1AK53 854 aa11.53□□□□□ -0.56
CTIF-208ENST00000590422 H0YGG7 62 aa11.53□□□□□ -0.56
CTIF-208ENST00000590422 MAP2K7O14733 419 aa11.53□□□□□ -0.56
CTIF-208ENST00000590422 LRRTM2O43300 516 aa11.53□□□□□ -0.56
CTIF-208ENST00000590422 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP11.53□□□□□ -0.56
CTIF-208ENST00000590422 VAPBO95292 243 aa11.53□□□□□ -0.56
CTIF-208ENST00000590422 MATN4O95460 622 aa11.53□□□□□ -0.56
CTIF-208ENST00000590422 HPP00738 406 aa11.53□□□□□ -0.56
CTIF-208ENST00000590422 CELA2AP08217 269 aa11.53□□□□□ -0.56
CTIF-208ENST00000590422 ERGP11308 486 aa11.53□□□□□ -0.56
CTIF-208ENST00000590422 COX6A1P12074 109 aa11.53□□□□□ -0.56
CTIF-208ENST00000590422 FBLP22087 321 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
CTIF-208ENST00000590422 FMO4P31512 558 aa11.53□□□□□ -0.56
CTIF-208ENST00000590422 EFNA3P52797 238 aa11.53□□□□□ -0.56
CTIF-208ENST00000590422 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP11.53□□□□□ -0.56
CTIF-208ENST00000590422 ETF1P62495 437 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
CTIF-208ENST00000590422 MFAP5Q13361 173 aa11.53□□□□□ -0.56
CTIF-208ENST00000590422 TLR1Q15399 786 aa11.53□□□□□ -0.56
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