RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587928.5

ILF3-208, Transcript of interleukin enhancer binding factor 3, human

TSL 2

Gene ILF3, Length 4,230 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ILF3-208	ENST00000587928	TRIM60	Q495X7	471 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ILF3-208	ENST00000587928	GPRC6A	Q5T6X5	926 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ILF3-208	ENST00000587928	CACHD1	Q5VU97	1274 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ILF3-208	ENST00000587928	GTF2IRD2B	Q6EKJ0	949 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ILF3-208	ENST00000587928	METTL3	Q86U44	580 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
ILF3-208	ENST00000587928	GTF2IRD2	Q86UP8	949 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ILF3-208	ENST00000587928	FIBCD1	Q8N539	461 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ILF3-208	ENST00000587928	OR4L1	Q8NH43	312 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ILF3-208	ENST00000587928	TWIST2	Q8WVJ9	160 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ILF3-208	ENST00000587928	ARL5B	Q96KC2	179 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ILF3-208	ENST00000587928	ZNF224	Q9NZL3	707 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ILF3-208	ENST00000587928	MRPS7	Q9Y2R9	242 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
ILF3-208	ENST00000587928		A0A1W2PP18	115 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ILF3-208	ENST00000587928		H3BMQ9	156 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ILF3-208	ENST00000587928	PRAMEF4	O60810	478 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ILF3-208	ENST00000587928	RASAL1	O95294	804 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ILF3-208	ENST00000587928	NKX2-5	P52952	324 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
ILF3-208	ENST00000587928	ZNF33B	Q06732	778 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ILF3-208	ENST00000587928		Q3ZCU0	254 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ILF3-208	ENST00000587928	PRAMEF9	Q5VWM5	478 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ILF3-208	ENST00000587928	TMEM199	Q8N511	208 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ILF3-208	ENST00000587928	TP53INP1	Q96A56	240 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ILF3-208	ENST00000587928	RHBDF1	Q96CC6	855 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ILF3-208	ENST00000587928	MAP6	Q96JE9	813 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ILF3-208	ENST00000587928	COG8	Q96MW5	612 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ILF3-208	ENST00000587928	MCCC1	Q96RQ3	725 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
ILF3-208	ENST00000587928	TRIM54	Q9BYV2	358 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ILF3-208	ENST00000587928	THG1L	Q9NWX6	298 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
ILF3-208	ENST00000587928	INSIG1	O15503	277 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ILF3-208	ENST00000587928	MAGEA2	P43356	314 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ILF3-208	ENST00000587928	CCL23	P55773	120 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ILF3-208	ENST00000587928	NME5	P56597	212 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ILF3-208	ENST00000587928	ERVPABLB-1	P60509	514 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ILF3-208	ENST00000587928	LCP2	Q13094	533 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ILF3-208	ENST00000587928	DNASE1L3	Q13609	305 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ILF3-208	ENST00000587928	CDH18	Q13634	790 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ILF3-208	ENST00000587928	LETMD1	Q6P1Q0	360 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ILF3-208	ENST00000587928	OR10Z1	Q8NGY1	313 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ILF3-208	ENST00000587928	TEX47	Q8TBZ9	253 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ILF3-208	ENST00000587928	PPA2	Q9H2U2	334 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ILF3-208	ENST00000587928	SARS2	Q9NP81	518 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
ILF3-208	ENST00000587928	SLAMF8	Q9P0V8	285 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ILF3-208	ENST00000587928	KLHL42	Q9P2K6	505 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ILF3-208	ENST00000587928	MYOF	Q9NZM1	2061 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ILF3-208	ENST00000587928		A8MX80	341 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ILF3-208	ENST00000587928		I3L521	148 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ILF3-208	ENST00000587928	BTN3A1	O00481	513 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ILF3-208	ENST00000587928	PLD2	O14939	933 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ILF3-208	ENST00000587928	SRP72	O76094	671 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
ILF3-208	ENST00000587928	PKNOX1	P55347	436 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ILF3-208	ENST00000587928	UBE3A	Q05086	875 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ILF3-208	ENST00000587928	PUDP	Q08623	228 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ILF3-208	ENST00000587928	INPP5A	Q14642	412 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ILF3-208	ENST00000587928	CROCC	Q5TZA2	2017 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ILF3-208	ENST00000587928	PAQR3	Q6TCH7	311 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ILF3-208	ENST00000587928	TMEM26	Q6ZUK4	368 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ILF3-208	ENST00000587928	CMTR2	Q8IYT2	770 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
ILF3-208	ENST00000587928	HOPX	Q9BPY8	73 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
ILF3-208	ENST00000587928	TWSG1	Q9GZX9	223 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ILF3-208	ENST00000587928	MUC13	Q9H3R2	512 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ILF3-208	ENST00000587928	RDH14	Q9HBH5	336 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ILF3-208	ENST00000587928	PKP3	Q9Y446	797 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ILF3-208	ENST00000587928	SNX13	Q9Y5W8	968 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ILF3-208	ENST00000587928		A0A1B0GW55	424 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ILF3-208	ENST00000587928	TSPAN11	A1L157	253 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ILF3-208	ENST00000587928	STMND1	H3BQB6	276 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ILF3-208	ENST00000587928		H3BUI4	141 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ILF3-208	ENST00000587928	HTR1A	P08908	422 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ILF3-208	ENST00000587928	DUX4L2	P0CJ85	424 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ILF3-208	ENST00000587928	DUX4L3	P0CJ86	424 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ILF3-208	ENST00000587928	DUX4L4	P0CJ87	422 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ILF3-208	ENST00000587928	DUX4L5	P0CJ88	424 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ILF3-208	ENST00000587928	DUX4L6	P0CJ89	424 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ILF3-208	ENST00000587928	DUX4L7	P0CJ90	424 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ILF3-208	ENST00000587928	GLUL	P15104	373 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ILF3-208	ENST00000587928	HTR1E	P28566	365 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ILF3-208	ENST00000587928	STX5	Q13190	355 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ILF3-208	ENST00000587928	NRF1	Q16656	503 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ILF3-208	ENST00000587928	PLEKHG6	Q3KR16	790 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ILF3-208	ENST00000587928	ANKRD26P1	Q6NSI1	321 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ILF3-208	ENST00000587928	DENND1C	Q8IV53	801 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ILF3-208	ENST00000587928	TTL	Q8NG68	377 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ILF3-208	ENST00000587928	GPR63	Q9BZJ6	419 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ILF3-208	ENST00000587928	OR51B5	Q9H339	312 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ILF3-208	ENST00000587928	ALG9	Q9H6U8	611 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ILF3-208	ENST00000587928	DUX4	Q9UBX2	424 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ILF3-208	ENST00000587928	GIMAP2	Q9UG22	337 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ILF3-208	ENST00000587928	MAN2B2	Q9Y2E5	1009 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ILF3-208	ENST00000587928	ZFP37	Q9Y6Q3	630 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
ILF3-208	ENST00000587928	MAU2	Q9Y6X3	613 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ILF3-208	ENST00000587928	TSPAN3	O60637	253 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ILF3-208	ENST00000587928	CLDN11	O75508	207 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ILF3-208	ENST00000587928	PTTG1	O95997	202 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ILF3-208	ENST00000587928	CYBB	P04839	570 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ILF3-208	ENST00000587928	ENO3	P13929	434 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
ILF3-208	ENST00000587928	DCK	P27707	260 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ILF3-208	ENST00000587928	OR2B6	P58173	313 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ILF3-208	ENST00000587928	DUSP7	Q16829	419 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ILF3-208	ENST00000587928	AAK1	Q2M2I8	961 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ILF3-208	ENST00000587928	ZRANB3	Q5FWF4	1079 aa		10.61	□□□□□ -0.71

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