RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000581467.1

TIMM21-205, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 21, human

TSL 2

Gene TIMM21, Length 579 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TIMM21-205	ENST00000581467	MRAS	O14807	208 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TIMM21-205	ENST00000581467	AIM2	O14862	343 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TIMM21-205	ENST00000581467	LSM1	O15116	133 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
TIMM21-205	ENST00000581467	AXIN1	O15169	862 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TIMM21-205	ENST00000581467	GSC2	O15499	205 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TIMM21-205	ENST00000581467	PRAMEF4	O60810	478 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TIMM21-205	ENST00000581467	SEC22B	O75396	215 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TIMM21-205	ENST00000581467	SLC22A3	O75751	556 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TIMM21-205	ENST00000581467	CIB2	O75838	187 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TIMM21-205	ENST00000581467	RSL1D1	O76021	490 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
TIMM21-205	ENST00000581467	WFS1	O76024	890 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TIMM21-205	ENST00000581467	PDYN	P01213	254 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TIMM21-205	ENST00000581467	TNF	P01375	233 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TIMM21-205	ENST00000581467	DCN	P07585	359 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
TIMM21-205	ENST00000581467	ALDOC	P09972	364 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
TIMM21-205	ENST00000581467	THEGL	P0DJG4	465 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TIMM21-205	ENST00000581467	C1GALT1C1L	P0DN25	315 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TIMM21-205	ENST00000581467	ERG	P11308	486 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TIMM21-205	ENST00000581467	PCNA	P12004	261 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TIMM21-205	ENST00000581467	CDH1	P12830	882 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TIMM21-205	ENST00000581467	HSD3B1	P14060	373 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TIMM21-205	ENST00000581467	CTSE	P14091	401 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TIMM21-205	ENST00000581467	SLC2A4	P14672	509 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TIMM21-205	ENST00000581467	PCSK2	P16519	638 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TIMM21-205	ENST00000581467	NPPB	P16860	134 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TIMM21-205	ENST00000581467	GPX3	P22352	226 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TIMM21-205	ENST00000581467	HSD3B2	P26439	372 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TIMM21-205	ENST00000581467	CD27	P26842	260 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TIMM21-205	ENST00000581467	MAPK1	P28482	360 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TIMM21-205	ENST00000581467	PKLR	P30613	574 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TIMM21-205	ENST00000581467	SHMT2	P34897	504 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TIMM21-205	ENST00000581467	CASP2	P42575	452 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TIMM21-205	ENST00000581467	PXN	P49023	591 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
TIMM21-205	ENST00000581467	MRPL19	P49406	292 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
TIMM21-205	ENST00000581467	NUDT2	P50583	147 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TIMM21-205	ENST00000581467	RAB28	P51157	221 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TIMM21-205	ENST00000581467	BLK	P51451	505 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TIMM21-205	ENST00000581467	NEK2	P51955	445 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TIMM21-205	ENST00000581467	NME5	P56597	212 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TIMM21-205	ENST00000581467	KCNK10	P57789	538 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TIMM21-205	ENST00000581467	RPL38	P63173	70 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
TIMM21-205	ENST00000581467	PHEX	P78562	749 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TIMM21-205	ENST00000581467	CTBS	Q01459	385 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TIMM21-205	ENST00000581467	HMGCS1	Q01581	520 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TIMM21-205	ENST00000581467	RPL6	Q02878	288 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
TIMM21-205	ENST00000581467	EMX2	Q04743	252 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TIMM21-205	ENST00000581467	GRIK2	Q13002	908 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TIMM21-205	ENST00000581467	MTAP	Q13126	283 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TIMM21-205	ENST00000581467	ART3	Q13508	389 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TIMM21-205	ENST00000581467	LAPTM5	Q13571	262 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TIMM21-205	ENST00000581467	DDX39B	Q13838	428 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
TIMM21-205	ENST00000581467	SLBP	Q14493	270 aa	Known RBP eCLIP	4.16	□□□□□ -1.74
TIMM21-205	ENST00000581467	CLCA4	Q14CN2	919 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TIMM21-205	ENST00000581467	TCEA2	Q15560	299 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TIMM21-205	ENST00000581467	RPE65	Q16518	533 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TIMM21-205	ENST00000581467	AP5B1	Q2VPB7	878 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TIMM21-205	ENST00000581467	MMEL1	Q495T6	779 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TIMM21-205	ENST00000581467	PDCD4	Q53EL6	469 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
TIMM21-205	ENST00000581467	USP39	Q53GS9	565 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
TIMM21-205	ENST00000581467	TPRG1L	Q5T0D9	272 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TIMM21-205	ENST00000581467	C10orf62	Q5T681	223 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
TIMM21-205	ENST00000581467	C6orf163	Q5TEZ5	329 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TIMM21-205	ENST00000581467	CACHD1	Q5VU97	1274 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TIMM21-205	ENST00000581467	IL23R	Q5VWK5	629 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TIMM21-205	ENST00000581467	PRAMEF9	Q5VWM5	478 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TIMM21-205	ENST00000581467	ATG9B	Q674R7	924 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TIMM21-205	ENST00000581467	DUS1L	Q6P1R4	473 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
TIMM21-205	ENST00000581467	MED27	Q6P2C8	311 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TIMM21-205	ENST00000581467	SLC30A9	Q6PML9	568 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TIMM21-205	ENST00000581467	BLOC1S3	Q6QNY0	202 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TIMM21-205	ENST00000581467	NXPE4	Q6UWF7	544 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TIMM21-205	ENST00000581467	SUSD1	Q6UWL2	747 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TIMM21-205	ENST00000581467	LCTL	Q6UWM7	567 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TIMM21-205	ENST00000581467	ABRAXAS1	Q6UWZ7	409 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TIMM21-205	ENST00000581467	C16orf89	Q6UX73	402 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TIMM21-205	ENST00000581467	TREML4	Q6UXN2	200 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TIMM21-205	ENST00000581467	WASH2P	Q6VEQ5	465 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TIMM21-205	ENST00000581467	SLCO4C1	Q6ZQN7	724 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TIMM21-205	ENST00000581467		Q6ZSR9	355 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TIMM21-205	ENST00000581467	PARG	Q86W56	976 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TIMM21-205	ENST00000581467	C17orf64	Q86WR6	236 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TIMM21-205	ENST00000581467	ZFAND4	Q86XD8	727 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TIMM21-205	ENST00000581467	TRIM48	Q8IWZ4	208 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TIMM21-205	ENST00000581467	C10orf67	Q8IYJ2	551 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TIMM21-205	ENST00000581467	PHACTR4	Q8IZ21	702 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TIMM21-205	ENST00000581467	RGL4	Q8IZJ4	473 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TIMM21-205	ENST00000581467	FAM9C	Q8IZT9	166 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TIMM21-205	ENST00000581467	KRT78	Q8N1N4	520 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TIMM21-205	ENST00000581467	C2orf73	Q8N5S3	287 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
TIMM21-205	ENST00000581467	FAM160A2	Q8N612	972 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
TIMM21-205	ENST00000581467	KY	Q8NBH2	561 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TIMM21-205	ENST00000581467	PCYOX1L	Q8NBM8	494 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TIMM21-205	ENST00000581467	RBM15B	Q8NDT2	890 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
TIMM21-205	ENST00000581467	OR2L8	Q8NGY9	312 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TIMM21-205	ENST00000581467	SLC5A11	Q8WWX8	675 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TIMM21-205	ENST00000581467	NEIL2	Q969S2	332 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TIMM21-205	ENST00000581467	UBE2E3	Q969T4	207 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TIMM21-205	ENST00000581467	TSACC	Q96A04	125 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
TIMM21-205	ENST00000581467	RCN3	Q96D15	328 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TIMM21-205	ENST00000581467	CXorf40B	Q96DE9	158 aa		4.16	□□□□□ -1.74

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