RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561395.5

TPM1-231, Transcript of tropomyosin 1, human

TSL 5

Gene TPM1, Length 673 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TPM1-231	ENST00000561395	CEP70	Q8NHQ1	597 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	CFAP61	Q8NHU2	1237 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	ATL1	Q8WXF7	558 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	KLHL29	Q96CT2	875 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	SLC7A6OS	Q96CW6	309 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	SCARF2	Q96GP6	870 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	MARK4	Q96L34	752 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	C3orf30	Q96M34	536 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	CCDC138	Q96M89	665 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	CATSPER2	Q96P56	530 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	CCT7	Q99832	543 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	TIMM29	Q9BSF4	260 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	APOO	Q9BUR5	198 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	NTMT1	Q9BV86	223 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	SLC29A3	Q9BZD2	475 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	BTBD1	Q9H0C5	482 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	OR52A5	Q9H2C5	316 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	TUBB1	Q9H4B7	451 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	IPPK	Q9H8X2	491 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	RMI1	Q9H9A7	625 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	ITM2C	Q9NQX7	267 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	TM7SF3	Q9NS93	570 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	MRGBP	Q9NV56	204 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	STOX2	Q9P2F5	926 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	SLC23A2	Q9UGH3	650 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	TRPS1	Q9UHF7	1281 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	TAGLN3	Q9UI15	199 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	BTRC	Q9Y297	605 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	SLC17A4	Q9Y2C5	497 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	TIMM22	Q9Y584	194 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	ANGPTL3	Q9Y5C1	460 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	PTGDR2	Q9Y5Y4	395 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	COPG1	Q9Y678	874 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	KNL1	Q8NG31	2342 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	PRR19	A6NJB7	356 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	PYCARD-AS1	I3L0S3	204 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	MYO1C	O00159	1063 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	LAT	O43561	262 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	CBFA2T3	O75081	653 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	NDUFS2	O75306	463 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	ZNF217	O75362	1048 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	WDR47	O94967	919 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	SEMA4F	O95754	770 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	CEACAM5	P06731	702 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	CAPN1	P07384	714 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	LINC00032	P0C843	101 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	EBLN1	P0CF75	366 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	HGF	P14210	728 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	NQO1	P15559	274 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	EPOR	P19235	508 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	HNRNPA2B1	P22626	353 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	PIK3R1	P27986	724 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	PTPN4	P29074	926 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	IMPA1	P29218	277 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	ADSL	P30566	484 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	ARL1	P40616	181 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	HTR6	P50406	440 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	ATP4B	P51164	291 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	CCR5	P51681	352 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	PFN3	P60673	137 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	RPL6	Q02878	288 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	DMPK	Q09013	629 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	SQLE	Q14534	574 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	SUZ12	Q15022	739 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	HERC3	Q15034	1050 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	PTCHD3	Q3KNS1	767 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	CCSMST1	Q4G0I0	132 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	GGTA1P	Q4G0N0	100 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	WDR45B	Q5MNZ6	344 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	METRNL	Q641Q3	311 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	AGTRAP	Q6RW13	159 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	RNF165	Q6ZSG1	346 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	MILR1	Q7Z6M3	343 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	GALNT13	Q8IUC8	556 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	KIF2B	Q8N4N8	673 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	DEFB119	Q8N690	84 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	DCBLD1	Q8N8Z6	715 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	METTL6	Q8TCB7	284 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	ATP6V1E2	Q96A05	226 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	CMTM5	Q96DZ9	223 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	CDK15	Q96Q40	435 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	PKP4	Q99569	1192 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	MYOC	Q99972	504 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	ZDHHC5	Q9C0B5	715 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	AKTIP	Q9H8T0	292 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	DNAJC11	Q9NVH1	559 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	POLG2	Q9UHN1	485 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	ZNHIT2	Q9UHR6	403 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	PCOLCE2	Q9UKZ9	415 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	CYP8B1	Q9UNU6	501 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	TEX15	Q9BXT5	2789 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	ATP6AP2	A0A1C7CYW4	349 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	PRSS38	A1L453	326 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	FAM149A	A5PLN7	773 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	POM121B	A6NF01	834 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	FPGT	O14772	594 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	UBD	O15205	165 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	KCNJ13	O60928	360 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	ATP6AP2	O75787	350 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	CLDN9	O95484	217 aa		7.28	□□□□□ -1.24

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