RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557030.5

ATXN3-246, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 807 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-246ENST00000557030 FOLH1Q04609 750 aa4.65□□□□□ -1.67
ATXN3-246ENST00000557030 GAD2Q05329 585 aa4.65□□□□□ -1.67
ATXN3-246ENST00000557030 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
ATXN3-246ENST00000557030 PRKG1Q13976 671 aa4.65□□□□□ -1.67
ATXN3-246ENST00000557030 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
ATXN3-246ENST00000557030 KRT81Q14533 505 aa4.65□□□□□ -1.67
ATXN3-246ENST00000557030 HERC3Q15034 1050 aa4.65□□□□□ -1.67
ATXN3-246ENST00000557030 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
ATXN3-246ENST00000557030 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
ATXN3-246ENST00000557030 ZNF699Q32M78 642 aa4.65□□□□□ -1.67
ATXN3-246ENST00000557030 CCDC153Q494R4 210 aa4.65□□□□□ -1.67
ATXN3-246ENST00000557030 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
ATXN3-246ENST00000557030 CYP4A22Q5TCH4 519 aa4.65□□□□□ -1.67
ATXN3-246ENST00000557030 STEAP4Q687X5 459 aa4.65□□□□□ -1.67
ATXN3-246ENST00000557030 PDPK2PQ6A1A2 396 aa4.65□□□□□ -1.67
ATXN3-246ENST00000557030 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa4.65□□□□□ -1.67
ATXN3-246ENST00000557030 TANGO2Q6ICL3 276 aa4.65□□□□□ -1.67
ATXN3-246ENST00000557030 UGT2A3Q6UWM9 527 aa4.65□□□□□ -1.67
ATXN3-246ENST00000557030 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
ATXN3-246ENST00000557030 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
ATXN3-246ENST00000557030 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa4.65□□□□□ -1.67
ATXN3-246ENST00000557030 UEVLDQ8IX04 471 aa4.65□□□□□ -1.67
ATXN3-246ENST00000557030 HACE1Q8IYU2 909 aa4.65□□□□□ -1.67
ATXN3-246ENST00000557030 NRACQ8N912 160 aa4.65□□□□□ -1.67
ATXN3-246ENST00000557030 ASB12Q8WXK4 309 aa4.65□□□□□ -1.67
ATXN3-246ENST00000557030 HSPH1Q92598 858 aa4.65□□□□□ -1.67
ATXN3-246ENST00000557030 TMEM143Q96AN5 459 aa4.65□□□□□ -1.67
ATXN3-246ENST00000557030 HMCESQ96FZ2 354 aa4.65□□□□□ -1.67
ATXN3-246ENST00000557030 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
ATXN3-246ENST00000557030 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa4.65□□□□□ -1.67
ATXN3-246ENST00000557030 MPP4Q96JB8 637 aa4.65□□□□□ -1.67
ATXN3-246ENST00000557030 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
ATXN3-246ENST00000557030 RNF157Q96PX1 679 aa4.65□□□□□ -1.67
ATXN3-246ENST00000557030 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
ATXN3-246ENST00000557030 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
ATXN3-246ENST00000557030 C2orf40Q9H1Z8 148 aa4.65□□□□□ -1.67
ATXN3-246ENST00000557030 CYP3A43Q9HB55 503 aa4.65□□□□□ -1.67
ATXN3-246ENST00000557030 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
ATXN3-246ENST00000557030 NRBP2Q9NSY0 501 aa4.65□□□□□ -1.67
ATXN3-246ENST00000557030 ETNK2Q9NVF9 386 aa4.65□□□□□ -1.67
ATXN3-246ENST00000557030 HOXC10Q9NYD6 342 aa4.65□□□□□ -1.67
ATXN3-246ENST00000557030 STK39Q9UEW8 545 aa4.65□□□□□ -1.67
ATXN3-246ENST00000557030 VPS28Q9UK41 221 aa4.65□□□□□ -1.67
ATXN3-246ENST00000557030 KIAA1257Q9ULG3 409 aa4.65□□□□□ -1.67
ATXN3-246ENST00000557030 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa4.65□□□□□ -1.67
ATXN3-246ENST00000557030 LRRC37A2A6NM11 1700 aa4.64□□□□□ -1.67
ATXN3-246ENST00000557030 GXYLT2A0PJZ3 443 aa4.64□□□□□ -1.67
ATXN3-246ENST00000557030 MEI4A8MW99 385 aa4.64□□□□□ -1.67
ATXN3-246ENST00000557030 HACD1B0YJ81 288 aa4.64□□□□□ -1.67
ATXN3-246ENST00000557030 SLCO1B7G3V0H7 640 aa4.64□□□□□ -1.67
ATXN3-246ENST00000557030 H3BNX3 289 aa4.64□□□□□ -1.67
ATXN3-246ENST00000557030 KCNN4O15554 427 aa4.64□□□□□ -1.67
ATXN3-246ENST00000557030 PFDN1O60925 122 aa4.64□□□□□ -1.67
ATXN3-246ENST00000557030 KAT7O95251 611 aa4.64□□□□□ -1.67
ATXN3-246ENST00000557030 APOA4P06727 396 aa4.64□□□□□ -1.67
ATXN3-246ENST00000557030 CD63P08962 238 aa4.64□□□□□ -1.67
ATXN3-246ENST00000557030 FAM58BPP0C7Q3 252 aa4.64□□□□□ -1.67
ATXN3-246ENST00000557030 CSH1P0DML2 217 aa4.64□□□□□ -1.67
ATXN3-246ENST00000557030 CSH2P0DML3 217 aa4.64□□□□□ -1.67
ATXN3-246ENST00000557030 VDRP11473 427 aa4.64□□□□□ -1.67
ATXN3-246ENST00000557030 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
ATXN3-246ENST00000557030 COX4I1P13073 169 aa4.64□□□□□ -1.67
ATXN3-246ENST00000557030 PGAM1P18669 254 aa4.64□□□□□ -1.67
ATXN3-246ENST00000557030 ITGAXP20702 1163 aa4.64□□□□□ -1.67
ATXN3-246ENST00000557030 HDAC4P56524 1084 aa4.64□□□□□ -1.67
ATXN3-246ENST00000557030 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
ATXN3-246ENST00000557030 RPS13P62277 151 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
ATXN3-246ENST00000557030 HPCAP84074 193 aa4.64□□□□□ -1.67
ATXN3-246ENST00000557030 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
ATXN3-246ENST00000557030 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
ATXN3-246ENST00000557030 CAPSQ13938 189 aa4.64□□□□□ -1.67
ATXN3-246ENST00000557030 DPYSQ14117 519 aa4.64□□□□□ -1.67
ATXN3-246ENST00000557030 VGLL4Q14135 290 aa4.64□□□□□ -1.67
ATXN3-246ENST00000557030 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
ATXN3-246ENST00000557030 TAF5Q15542 800 aa4.64□□□□□ -1.67
ATXN3-246ENST00000557030 STXBP2Q15833 593 aa4.64□□□□□ -1.67
ATXN3-246ENST00000557030 TIGD6Q17RP2 521 aa4.64□□□□□ -1.67
ATXN3-246ENST00000557030 AAK1Q2M2I8 961 aa4.64□□□□□ -1.67
ATXN3-246ENST00000557030 SMTNL2Q2TAL5 461 aa4.64□□□□□ -1.67
ATXN3-246ENST00000557030 USP41Q3LFD5 358 aa4.64□□□□□ -1.67
ATXN3-246ENST00000557030 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa4.64□□□□□ -1.67
ATXN3-246ENST00000557030 CCDC14Q49A88 953 aa4.64□□□□□ -1.67
ATXN3-246ENST00000557030 PTPN20Q4JDL3 420 aa4.64□□□□□ -1.67
ATXN3-246ENST00000557030 SFT2D3Q587I9 215 aa4.64□□□□□ -1.67
ATXN3-246ENST00000557030 ZNF667Q5HYK9 610 aa4.64□□□□□ -1.67
ATXN3-246ENST00000557030 MDH1BQ5I0G3 518 aa4.64□□□□□ -1.67
ATXN3-246ENST00000557030 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
ATXN3-246ENST00000557030 ARMC3Q5W041 872 aa4.64□□□□□ -1.67
ATXN3-246ENST00000557030 DENND1BQ6P3S1 775 aa4.64□□□□□ -1.67
ATXN3-246ENST00000557030 ZNF793Q6ZN11 406 aa4.64□□□□□ -1.67
ATXN3-246ENST00000557030 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa4.64□□□□□ -1.67
ATXN3-246ENST00000557030 RFX8Q6ZV50 586 aa4.64□□□□□ -1.67
ATXN3-246ENST00000557030 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa4.64□□□□□ -1.67
ATXN3-246ENST00000557030 KBTBD6Q86V97 674 aa4.64□□□□□ -1.67
ATXN3-246ENST00000557030 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa4.64□□□□□ -1.67
ATXN3-246ENST00000557030 CROCCP3Q8IVE0 287 aa4.64□□□□□ -1.67
ATXN3-246ENST00000557030 LAS2Q8IYD9 372 aa4.64□□□□□ -1.67
ATXN3-246ENST00000557030 NRSN1Q8IZ57 195 aa4.64□□□□□ -1.67
ATXN3-246ENST00000557030 DEFB107AQ8IZN7 70 aa4.64□□□□□ -1.67
ATXN3-246ENST00000557030 GPC2Q8N158 579 aa4.64□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms