RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551137.5

CS-223, Transcript of citrate synthase, human

TSL 3

Gene CS, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-223	ENST00000551137	PLCD4	Q9BRC7	762 aa		11	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	EPN3	Q9H201	632 aa		11	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	PLAC1	Q9HBJ0	212 aa		11	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	CUTC	Q9NTM9	273 aa		11	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	IFT80	Q9P2H3	777 aa	Predicted RBP	11	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	TEX264	Q9Y6I9	313 aa		11	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	KRT87P	A6NCN2	255 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	ARGFX	A6NJG6	315 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	FANCG	O15287	622 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	ZBTB14	O43829	449 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	VPS26A	O75436	327 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	DNAJB5	O75953	348 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	SEC31A	O94979	1220 aa	Known RBP	10.99	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	AHSG	P02765	367 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	ERVK-10	P10266	1014 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	PSMB5	P28074	263 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	PNLIPRP1	P54315	467 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	MPP1	Q00013	466 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	PRTG	Q2VWP7	1150 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	WASHC2D	Q5SRD0	308 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	TEDDM1	Q5T9Z0	273 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	C1orf189	Q5VU69	101 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	FAM69B	Q5VUD6	431 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	MLIP	Q5VWP3	458 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	ICE2	Q659A1	982 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	CPZ	Q66K79	652 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	ZNF425	Q6IV72	752 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	TTLL10	Q6ZVT0	673 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	MRGPRE	Q86SM8	312 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	IGDCC3	Q8IVU1	814 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	CERS2	Q96G23	380 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	MIPEP	Q99797	713 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	ZFYVE21	Q9BQ24	234 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	DPH7	Q9BTV6	452 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	SLC25A23	Q9BV35	468 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	CLMP	Q9H6B4	373 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	SLC6A20	Q9NP91	592 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	ACSS2	Q9NR19	701 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	IARS2	Q9NSE4	1012 aa	Known RBP	10.99	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	UTP6	Q9NYH9	597 aa	Known RBP	10.99	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	TAS2R13	Q9NYV9	303 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	NDOR1	Q9UHB4	597 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	GPN3	Q9UHW5	284 aa	Predicted RBP	10.99	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	CORO1C	Q9ULV4	474 aa	Predicted RBP	10.99	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	PYCARD	Q9ULZ3	195 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	CNTRL	Q7Z7A1	2325 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	PTPN13	Q12923	2485 aa		10.99	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	MDC1	Q14676	2089 aa	Known RBP	10.98	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	LOC105369274	A0A096LPK9	316 aa		10.98	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	IGKV1-8	A0A0C4DH67	115 aa		10.98	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	LOC102723532	A0A0G2JNH3	316 aa		10.98	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	HYKK	A2RU49	373 aa		10.98	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	VSTM2B	A6NLU5	285 aa		10.98	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137		E7ESA3	106 aa		10.98	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	NDC80	O14777	642 aa		10.98	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	SLC16A5	O15375	505 aa		10.98	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	KLHL41	O60662	606 aa		10.98	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	CCNDBP1	O95273	360 aa		10.98	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	PDGFA	P04085	211 aa		10.98	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	UMOD	P07911	640 aa		10.98	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	ALAS2	P22557	587 aa		10.98	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	MMP11	P24347	488 aa		10.98	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	HRH2	P25021	359 aa		10.98	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	RPA3	P35244	121 aa	Predicted RBP	10.98	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	FOLR3	P41439	243 aa		10.98	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	PAFAH1B1	P43034	410 aa		10.98	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	CCL11	P51671	97 aa		10.98	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	PGD	P52209	483 aa		10.98	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	FOXK1	P85037	733 aa		10.98	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	SP140	Q13342	867 aa		10.98	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	CUL1	Q13616	776 aa		10.98	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	ATP1A4	Q13733	1029 aa		10.98	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	HIF1A	Q16665	826 aa		10.98	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	BBS9	Q3SYG4	887 aa		10.98	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	FRMPD2B	Q6IN97	320 aa		10.98	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	PRMT9	Q6P2P2	845 aa		10.98	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	SUSD1	Q6UWL2	747 aa		10.98	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	COX15	Q7KZN9	410 aa		10.98	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	PAQR7	Q86WK9	346 aa		10.98	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	KLHL7	Q8IXQ5	586 aa		10.98	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	OR4N4	Q8N0Y3	316 aa		10.98	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	TTC29	Q8NA56	475 aa	Predicted RBP	10.98	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	TEX19	Q8NA77	164 aa		10.98	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	SNF8	Q96H20	258 aa		10.98	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	CAPZA3	Q96KX2	299 aa		10.98	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	FER1L6-AS2	Q96M78	137 aa		10.98	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	OR2A5	Q96R48	311 aa		10.98	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	SMAD5	Q99717	465 aa	Known RBP	10.98	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	MRPS30	Q9NP92	439 aa	Known RBP	10.98	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	IRAK4	Q9NWZ3	460 aa		10.98	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	TRMT6	Q9UJA5	497 aa	Known RBP	10.98	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	NXT1	Q9UKK6	140 aa	Known RBP	10.98	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	PTRH2	Q9Y3E5	179 aa	Known RBP	10.98	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	PCSK5	Q92824	1860 aa		10.98	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	IGLV3-12	A0A075B6K2	115 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	KCNE1B	A0A087WTH5	132 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137		A0A0J9YVX5	310 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	TXNDC9	O14530	226 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	TTI1	O43156	1089 aa		10.97	□□□□□ -0.65
CS-223	ENST00000551137	BANF1	O75531	89 aa		10.97	□□□□□ -0.65

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