RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546248.5

TRDN-205, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,179 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-205ENST00000546248 PTPRRQ15256 657 aa5.36□□□□□ -1.55
TRDN-205ENST00000546248 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
TRDN-205ENST00000546248 ABHD17BQ5VST6 288 aa5.36□□□□□ -1.55
TRDN-205ENST00000546248 ZNF549Q6P9A3 640 aa5.36□□□□□ -1.55
TRDN-205ENST00000546248 LINGO4Q6UY18 593 aa5.36□□□□□ -1.55
TRDN-205ENST00000546248 ZYG11AQ6WRX3 759 aa5.36□□□□□ -1.55
TRDN-205ENST00000546248 RAPH1Q70E73 1250 aa5.36□□□□□ -1.55
TRDN-205ENST00000546248 CLNKQ7Z7G1 428 aa5.36□□□□□ -1.55
TRDN-205ENST00000546248 GALNT7Q86SF2 657 aa5.36□□□□□ -1.55
TRDN-205ENST00000546248 LCA5Q86VQ0 697 aa5.36□□□□□ -1.55
TRDN-205ENST00000546248 LMNTD2Q8IXW0 634 aa5.36□□□□□ -1.55
TRDN-205ENST00000546248 APCDD1Q8J025 514 aa5.36□□□□□ -1.55
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TRDN-205ENST00000546248 BBS5Q8N3I7 341 aa5.36□□□□□ -1.55
TRDN-205ENST00000546248 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa5.36□□□□□ -1.55
TRDN-205ENST00000546248 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
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TRDN-205ENST00000546248 CARNMT1Q8N4J0 409 aa5.36□□□□□ -1.55
TRDN-205ENST00000546248 KIF2BQ8N4N8 673 aa5.36□□□□□ -1.55
TRDN-205ENST00000546248 TTC30BQ8N4P2 665 aa5.36□□□□□ -1.55
TRDN-205ENST00000546248 SLC15A4Q8N697 577 aa5.36□□□□□ -1.55
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TRDN-205ENST00000546248 SVIPQ8NHG7 77 aa5.36□□□□□ -1.55
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TRDN-205ENST00000546248 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa5.36□□□□□ -1.55
TRDN-205ENST00000546248 SLC22A17Q8WUG5 538 aa5.36□□□□□ -1.55
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TRDN-205ENST00000546248 HEXDCQ8WVB3 486 aa5.36□□□□□ -1.55
TRDN-205ENST00000546248 ANKRD49Q8WVL7 239 aa5.36□□□□□ -1.55
TRDN-205ENST00000546248 PEX13Q92968 403 aa5.36□□□□□ -1.55
TRDN-205ENST00000546248 KLHL29Q96CT2 875 aa5.36□□□□□ -1.55
TRDN-205ENST00000546248 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
TRDN-205ENST00000546248 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa5.36□□□□□ -1.55
TRDN-205ENST00000546248 NSL1Q96IY1 281 aa5.36□□□□□ -1.55
TRDN-205ENST00000546248 ELMO2Q96JJ3 720 aa5.36□□□□□ -1.55
TRDN-205ENST00000546248 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
TRDN-205ENST00000546248 TMEM237Q96Q45 408 aa5.36□□□□□ -1.55
TRDN-205ENST00000546248 OLFM1Q99784 485 aa5.36□□□□□ -1.55
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TRDN-205ENST00000546248 FEM1AQ9BSK4 669 aa5.36□□□□□ -1.55
TRDN-205ENST00000546248 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
TRDN-205ENST00000546248 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
TRDN-205ENST00000546248 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
TRDN-205ENST00000546248 SMURF2Q9HAU4 748 aa5.36□□□□□ -1.55
TRDN-205ENST00000546248 SAR1AQ9NR31 198 aa5.36□□□□□ -1.55
TRDN-205ENST00000546248 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
TRDN-205ENST00000546248 STK39Q9UEW8 545 aa5.36□□□□□ -1.55
TRDN-205ENST00000546248 HAO1Q9UJM8 370 aa5.36□□□□□ -1.55
TRDN-205ENST00000546248 ACOT9Q9Y305 439 aa5.36□□□□□ -1.55
TRDN-205ENST00000546248 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa5.36□□□□□ -1.55
TRDN-205ENST00000546248 ARL5AQ9Y689 179 aa5.36□□□□□ -1.55
TRDN-205ENST00000546248 TET1Q8NFU7 2136 aa5.35□□□□□ -1.55
TRDN-205ENST00000546248 HIDE1A8MVS5 230 aa5.35□□□□□ -1.55
TRDN-205ENST00000546248 TMEM114B3SHH9 223 aa5.35□□□□□ -1.55
TRDN-205ENST00000546248 H0Y626 953 aa5.35□□□□□ -1.55
TRDN-205ENST00000546248 K7ERQ8 282 aa5.35□□□□□ -1.55
TRDN-205ENST00000546248 KPNA5O15131 536 aa5.35□□□□□ -1.55
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TRDN-205ENST00000546248 TMCC1O94876 653 aa5.35□□□□□ -1.55
TRDN-205ENST00000546248 CBX6O95503 412 aa5.35□□□□□ -1.55
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TRDN-205ENST00000546248 ESRRBO95718 433 aa5.35□□□□□ -1.55
TRDN-205ENST00000546248 C1RP00736 705 aa5.35□□□□□ -1.55
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TRDN-205ENST00000546248 APOA4P06727 396 aa5.35□□□□□ -1.55
TRDN-205ENST00000546248 KRT16P08779 473 aa5.35□□□□□ -1.55
TRDN-205ENST00000546248 ITGAMP11215 1152 aa5.35□□□□□ -1.55
TRDN-205ENST00000546248 MYL4P12829 197 aa5.35□□□□□ -1.55
TRDN-205ENST00000546248 STMN1P16949 149 aa5.35□□□□□ -1.55
TRDN-205ENST00000546248 CHRM3P20309 590 aa5.35□□□□□ -1.55
TRDN-205ENST00000546248 FDXRP22570 491 aa5.35□□□□□ -1.55
TRDN-205ENST00000546248 PTPN4P29074 926 aa5.35□□□□□ -1.55
TRDN-205ENST00000546248 MPLP40238 635 aa5.35□□□□□ -1.55
TRDN-205ENST00000546248 CCR10P46092 362 aa5.35□□□□□ -1.55
TRDN-205ENST00000546248 CLCN4P51793 760 aa5.35□□□□□ -1.55
TRDN-205ENST00000546248 CLCN5P51795 746 aa5.35□□□□□ -1.55
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TRDN-205ENST00000546248 CAMK1Q14012 370 aa5.35□□□□□ -1.55
TRDN-205ENST00000546248 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
TRDN-205ENST00000546248 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
TRDN-205ENST00000546248 MPP7Q5T2T1 576 aa5.35□□□□□ -1.55
TRDN-205ENST00000546248 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
TRDN-205ENST00000546248 ZNF470Q6ECI4 717 aa5.35□□□□□ -1.55
TRDN-205ENST00000546248 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa5.35□□□□□ -1.55
TRDN-205ENST00000546248 CYB5D1Q6P9G0 228 aa5.35□□□□□ -1.55
TRDN-205ENST00000546248 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa5.35□□□□□ -1.55
TRDN-205ENST00000546248 C11orf96Q7Z7L8 435 aa5.35□□□□□ -1.55
TRDN-205ENST00000546248 GLCCI1Q86VQ1 547 aa5.35□□□□□ -1.55
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