RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539804.1

PITX3-202, Transcript of paired like homeodomain 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PITX3, Length 1,187 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3-202ENST00000539804 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 ICE2Q659A1 982 aa23.26■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 FCRL6Q6DN72 434 aa23.26■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa23.26■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 SLC38A9Q8NBW4 561 aa23.26■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 ZNF480Q8WV37 535 aa23.26■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 CPNE1Q99829 537 aa23.26■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa23.26■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 DPH7Q9BTV6 452 aa23.26■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 PLAC1Q9HBJ0 212 aa23.26■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 CACNA1GO43497 2377 aa23.25■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 H3BMH7 237 aa23.25■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 IGHEP01854 428 aa23.25■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 EZRP15311 586 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 EMP3P54852 163 aa23.25■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 POU4F1Q01851 419 aa23.25■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 NAB1Q13506 487 aa23.25■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 NCF4Q15080 339 aa23.25■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 LINC00303Q3SY05 128 aa23.25■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 RNF44Q7L0R7 432 aa23.25■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 PLCD4Q9BRC7 762 aa23.25■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 TAC3Q9UHF0 121 aa23.25■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa23.24■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 A0A1B0GX78 115 aa23.24■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 CDC14CA4D256 554 aa23.24■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 OR2A25A4D2G3 310 aa23.24■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 CTAGE15A4D2H0 777 aa23.24■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 F7P08709 466 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 CTAGE8P0CG41 777 aa23.24■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 POLE2P56282 527 aa23.24■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 DEFB109BQ30KR1 87 aa23.24■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 PCSK4Q6UW60 755 aa23.24■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 SUSD1Q6UWL2 747 aa23.24■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 CTAGE6Q86UF2 777 aa23.24■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 RAB43Q86YS6 212 aa23.24■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 CTAGE4Q8IX94 777 aa23.24■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 FBXO25Q8TCJ0 367 aa23.24■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 ZNF285Q96NJ3 590 aa23.24■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 ACAT2Q9BWD1 397 aa23.24■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 TCFL5Q9UL49 500 aa23.24■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa23.24■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 IGSF10Q6WRI0 2623 aa23.24■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 FITM1A5D6W6 292 aa23.23■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 PSMB5P28074 263 aa23.23■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP23.23■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 KCNAB2Q13303 367 aa23.23■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa23.23■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 CCDC25Q86WR0 208 aa23.23■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 FAM20CQ8IXL6 584 aa23.23■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 MMGT1Q8N4V1 131 aa23.23■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 FKBP10Q96AY3 582 aa23.23■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 NACC2Q96BF6 587 aa23.23■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 VPS50Q96JG6 964 aa23.23■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 GBP5Q96PP8 586 aa23.23■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 HAUS8Q9BT25 410 aa23.23■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 ARL15Q9NXU5 204 aa23.23■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 PDE10AQ9Y233 779 aa23.23■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 KLHL20Q9Y2M5 609 aa23.23■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 DSCR3O14972 297 aa23.22■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP23.22■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 ALBP02768 609 aa23.22■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 ALAS2P22557 587 aa23.22■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 IMPA1P29218 277 aa23.22■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 GRK3P35626 688 aa23.22■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 GP5P40197 560 aa23.22■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 MAGEA4P43358 317 aa23.22■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 LY6DQ14210 128 aa23.22■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 MUM1Q2TAK8 710 aa23.22■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 PRMT9Q6P2P2 845 aa23.22■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 TBC1D19Q8N5T2 526 aa23.22■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 THAP11Q96EK4 314 aa23.22■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 SLC25A18Q9H1K4 315 aa23.22■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 CUTCQ9NTM9 273 aa23.22■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 TMEM184CQ9NVA4 438 aa23.22■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 CDC14AQ9UNH5 594 aa23.22■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 MGAQ8IWI9 3026 aa23.22■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa23.21■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 ITGAXP20702 1163 aa23.21■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 SSTR1P30872 391 aa23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms