RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532751.1

PTPRK-222, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRK, Length 563 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-222ENST00000532751 NFU1Q9UMS0 254 aa21.09■□□□□ 0.97
PTPRK-222ENST00000532751 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa21.09■□□□□ 0.97
PTPRK-222ENST00000532751 ZNF749O43361 778 aa21.08■□□□□ 0.97
PTPRK-222ENST00000532751 CCND1P24385 295 aa21.08■□□□□ 0.97
PTPRK-222ENST00000532751 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP21.08■□□□□ 0.97
PTPRK-222ENST00000532751 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa21.08■□□□□ 0.97
PTPRK-222ENST00000532751 MR1Q95460 341 aa21.08■□□□□ 0.97
PTPRK-222ENST00000532751 SLC45A3Q96JT2 553 aa21.08■□□□□ 0.97
PTPRK-222ENST00000532751 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.97
PTPRK-222ENST00000532751 ACSS3Q9H6R3 686 aa21.08■□□□□ 0.97
PTPRK-222ENST00000532751 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa21.08■□□□□ 0.97
PTPRK-222ENST00000532751 KCND3Q9UK17 655 aa21.08■□□□□ 0.97
PTPRK-222ENST00000532751 CROTQ9UKG9 612 aa21.08■□□□□ 0.97
PTPRK-222ENST00000532751 SRPK3Q9UPE1 567 aa21.08■□□□□ 0.97
PTPRK-222ENST00000532751 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
PTPRK-222ENST00000532751 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
PTPRK-222ENST00000532751 HCRTR1O43613 425 aa21.07■□□□□ 0.96
PTPRK-222ENST00000532751 FAM155BO75949 473 aa21.07■□□□□ 0.96
PTPRK-222ENST00000532751 ACSL3O95573 720 aa21.07■□□□□ 0.96
PTPRK-222ENST00000532751 TCN2P20062 427 aa21.07■□□□□ 0.96
PTPRK-222ENST00000532751 RAB10P61026 200 aa21.07■□□□□ 0.96
PTPRK-222ENST00000532751 TBPL1P62380 186 aa21.07■□□□□ 0.96
PTPRK-222ENST00000532751 GPS2Q13227 327 aa21.07■□□□□ 0.96
PTPRK-222ENST00000532751 TCTE1Q5JU00 501 aa21.07■□□□□ 0.96
PTPRK-222ENST00000532751 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa21.07■□□□□ 0.96
PTPRK-222ENST00000532751 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa21.07■□□□□ 0.96
PTPRK-222ENST00000532751 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa21.07■□□□□ 0.96
PTPRK-222ENST00000532751 DSELQ8IZU8 1212 aa21.07■□□□□ 0.96
PTPRK-222ENST00000532751 ANKRD49Q8WVL7 239 aa21.07■□□□□ 0.96
PTPRK-222ENST00000532751 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
PTPRK-222ENST00000532751 MED8Q96G25 268 aa21.07■□□□□ 0.96
PTPRK-222ENST00000532751 SELENOSQ9BQE4 189 aa21.07■□□□□ 0.96
PTPRK-222ENST00000532751 DERL2Q9GZP9 239 aa21.07■□□□□ 0.96
PTPRK-222ENST00000532751 ATG10Q9H0Y0 220 aa21.07■□□□□ 0.96
PTPRK-222ENST00000532751 SLC6A20Q9NP91 592 aa21.07■□□□□ 0.96
PTPRK-222ENST00000532751 SNX7Q9UNH6 387 aa21.07■□□□□ 0.96
PTPRK-222ENST00000532751 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
PTPRK-222ENST00000532751 OR2A25A4D2G3 310 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRK-222ENST00000532751 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRK-222ENST00000532751 C21orf140B9A014 251 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRK-222ENST00000532751 H3BMH7 237 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRK-222ENST00000532751 MEN1O00255 615 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRK-222ENST00000532751 CDC7O00311 574 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRK-222ENST00000532751 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
PTPRK-222ENST00000532751 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
PTPRK-222ENST00000532751 GUCA1CO95843 209 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRK-222ENST00000532751 MC1RQ01726 317 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRK-222ENST00000532751 RHDQ02161 417 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRK-222ENST00000532751 NAE1Q13564 534 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRK-222ENST00000532751 DNASE1L3Q13609 305 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRK-222ENST00000532751 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
PTPRK-222ENST00000532751 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
PTPRK-222ENST00000532751 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
PTPRK-222ENST00000532751 SBSNQ6UWP8 590 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRK-222ENST00000532751 RAPH1Q70E73 1250 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRK-222ENST00000532751 FRA10AC1Q70Z53 315 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRK-222ENST00000532751 RNF44Q7L0R7 432 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRK-222ENST00000532751 ADCK2Q7Z695 626 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRK-222ENST00000532751 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
PTPRK-222ENST00000532751 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
PTPRK-222ENST00000532751 SLC38A9Q8NBW4 561 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRK-222ENST00000532751 CT55Q8WUE5 264 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRK-222ENST00000532751 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
PTPRK-222ENST00000532751 FBXL8Q96CD0 374 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRK-222ENST00000532751 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRK-222ENST00000532751 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
PTPRK-222ENST00000532751 PLCD4Q9BRC7 762 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRK-222ENST00000532751 NDC1Q9BTX1 674 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRK-222ENST00000532751 FUT8Q9BYC5 575 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRK-222ENST00000532751 TXLNGQ9NUQ3 528 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRK-222ENST00000532751 PCMTD2Q9NV79 361 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRK-222ENST00000532751 SEC16AO15027 2179 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRK-222ENST00000532751 A0A0J9YVX5 310 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRK-222ENST00000532751 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP21.05■□□□□ 0.96
PTPRK-222ENST00000532751 CTSVO60911 334 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRK-222ENST00000532751 ANXA5P08758 320 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRK-222ENST00000532751 CCDC166P0CW27 439 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRK-222ENST00000532751 WT1P19544 449 aaPredicted RBP21.05■□□□□ 0.96
PTPRK-222ENST00000532751 AGXTP21549 392 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRK-222ENST00000532751 HRH2P25021 359 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRK-222ENST00000532751 RORAP35398 523 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRK-222ENST00000532751 ARSFP54793 590 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRK-222ENST00000532751 ATP6V0D1P61421 351 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRK-222ENST00000532751 RPS15P62841 145 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
PTPRK-222ENST00000532751 YBX1P67809 324 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
PTPRK-222ENST00000532751 TEX35Q5T0J7 233 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRK-222ENST00000532751 RHBDD2Q6NTF9 364 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRK-222ENST00000532751 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP21.05■□□□□ 0.96
PTPRK-222ENST00000532751 LCTLQ6UWM7 567 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRK-222ENST00000532751 PROKR1Q8TCW9 393 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRK-222ENST00000532751 GPR87Q9BY21 358 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRK-222ENST00000532751 IL17BQ9UHF5 180 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRK-222ENST00000532751 IKZF3Q9UKT9 509 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRK-222ENST00000532751 OARD1Q9Y530 152 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRK-222ENST00000532751 IKBKGQ9Y6K9 419 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRK-222ENST00000532751 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP21.04■□□□□ 0.96
PTPRK-222ENST00000532751 KATNA1O75449 491 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRK-222ENST00000532751 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP21.04■□□□□ 0.96
PTPRK-222ENST00000532751 CRABP2P29373 138 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRK-222ENST00000532751 CDKL1Q00532 357 aa21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms