RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529893.5

GMDS-AS1-205, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene GMDS-AS1, Length 900 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-205ENST00000529893 KIRREL2Q6UWL6 708 aa16.01■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-205ENST00000529893 CUZD1Q86UP6 607 aa16.01■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-205ENST00000529893 HMGCLL1Q8TB92 370 aa16.01■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-205ENST00000529893 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-205ENST00000529893 SERPINB12Q96P63 405 aa16.01■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-205ENST00000529893 PANX3Q96QZ0 392 aa16.01■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-205ENST00000529893 SELENOSQ9BQE4 189 aa16.01■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-205ENST00000529893 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa16.01■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-205ENST00000529893 CTSFQ9UBX1 484 aa16.01■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-205ENST00000529893 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-205ENST00000529893 NTNG1Q9Y2I2 539 aa16.01■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-205ENST00000529893 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa16.01■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-205ENST00000529893 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa16.01■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-205ENST00000529893 CROCCQ5TZA2 2017 aa16.01■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-205ENST00000529893 CREBBPQ92793 2442 aa16■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-205ENST00000529893 MYO7BQ6PIF6 2116 aa16■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-205ENST00000529893 A0A1W2PPV9 198 aa16■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-205ENST00000529893 WIPF3A6NGB9 483 aa16■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-205ENST00000529893 VSTM2BA6NLU5 285 aa16■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-205ENST00000529893 KPNA5O15131 536 aa16■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-205ENST00000529893 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-205ENST00000529893 OR1D4P47884 311 aa16■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-205ENST00000529893 YBX1P67809 324 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-205ENST00000529893 TYSND1Q2T9J0 566 aa16■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-205ENST00000529893 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa16■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-205ENST00000529893 FRMPD2BQ6IN97 320 aa16■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-205ENST00000529893 CNSTQ6PJW8 725 aa16■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-205ENST00000529893 IGFL2Q6UWQ7 119 aa16■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-205ENST00000529893 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa16■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-205ENST00000529893 CENPUQ71F23 418 aa16■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-205ENST00000529893 OTOAQ7RTW8 1153 aa16■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-205ENST00000529893 LRRC6Q86X45 466 aa16■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-205ENST00000529893 ZADH2Q8N4Q0 377 aa16■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-205ENST00000529893 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-205ENST00000529893 OR2L3Q8NG85 312 aa16■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-205ENST00000529893 OR2A1Q8NGT9 310 aa16■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-205ENST00000529893 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-205ENST00000529893 CDC23Q9UJX2 597 aa16■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-205ENST00000529893 SNX12Q9UMY4 172 aa16■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-205ENST00000529893 CSAG2Q9Y5P2 127 aa16■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-205ENST00000529893 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa15.99■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-205ENST00000529893 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa15.99■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-205ENST00000529893 AP3B1O00203 1094 aa15.99■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-205ENST00000529893 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-205ENST00000529893 BANF1O75531 89 aa15.99■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-205ENST00000529893 MATN4O95460 622 aa15.99■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-205ENST00000529893 DDAH2O95865 285 aa15.99■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-205ENST00000529893 ITGA3P26006 1051 aa15.99■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-205ENST00000529893 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-205ENST00000529893 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-205ENST00000529893 GBX1Q14549 363 aa15.99■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-205ENST00000529893 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa15.99■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-205ENST00000529893 WASHC2DQ5SRD0 308 aa15.99■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-205ENST00000529893 MRNIPQ6NTE8 343 aa15.99■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-205ENST00000529893 TTC23LQ6PF05 361 aa15.99■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-205ENST00000529893 DENND6AQ8IWF6 608 aa15.99■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-205ENST00000529893 OR4N4Q8N0Y3 316 aa15.99■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-205ENST00000529893 NAT8LQ8N9F0 302 aa15.99■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-205ENST00000529893 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-205ENST00000529893 ACTRT1Q8TDG2 376 aa15.99■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-205ENST00000529893 TM9SF4Q92544 642 aa15.99■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-205ENST00000529893 SLC30A3Q99726 388 aa15.99■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-205ENST00000529893 MIPEPQ99797 713 aa15.99■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-205ENST00000529893 MESP1Q9BRJ9 268 aa15.99■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-205ENST00000529893 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-205ENST00000529893 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-205ENST00000529893 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-205ENST00000529893 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa15.98■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-205ENST00000529893 A1L4Q6 167 aa15.98■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-205ENST00000529893 HYKKA2RU49 373 aa15.98■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-205ENST00000529893 ZSCAN12O43309 604 aa15.98■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-205ENST00000529893 KIF5CO60282 957 aa15.98■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-205ENST00000529893 CCNFP41002 786 aa15.98■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-205ENST00000529893 SARNPP82979 210 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-205ENST00000529893 Q0VFX4 171 aa15.98■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-205ENST00000529893 CTBP1Q13363 440 aa15.98■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-205ENST00000529893 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-205ENST00000529893 HIF1AQ16665 826 aa15.98■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-205ENST00000529893 FAM214AQ32MH5 1076 aa15.98■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-205ENST00000529893 ACSBG2Q5FVE4 666 aa15.98■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-205ENST00000529893 ZNF470Q6ECI4 717 aa15.98■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-205ENST00000529893 NEPROQ6NW34 567 aa15.98■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-205ENST00000529893 RNF44Q7L0R7 432 aa15.98■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-205ENST00000529893 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-205ENST00000529893 LURAP1LQ8IV03 231 aa15.98■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-205ENST00000529893 OR11G2Q8NGC1 345 aa15.98■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-205ENST00000529893 GSDMBQ8TAX9 411 aa15.98■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-205ENST00000529893 CAPZA3Q96KX2 299 aa15.98■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-205ENST00000529893 SAMD15Q9P1V8 674 aa15.98■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-205ENST00000529893 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-205ENST00000529893 PYCARDQ9ULZ3 195 aa15.98■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-205ENST00000529893 MRFAP1Q9Y605 127 aa15.98■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-205ENST00000529893 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-205ENST00000529893 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa15.98■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-205ENST00000529893 MAU2Q9Y6X3 613 aa15.98■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-205ENST00000529893 CSMD1Q96PZ7 3565 aa15.97■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-205ENST00000529893 A0A0J9YVX5 310 aa15.97■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-205ENST00000529893 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa15.97■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-205ENST00000529893 SDR42E2A6NKP2 422 aa15.97■□□□□ 0.15
GMDS-AS1-205ENST00000529893 LDLRP01130 860 aa15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.9 ms