RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519057.5

COPS5-208, Transcript of COP9 signalosome subunit 5, human

TSL 4

Gene COPS5, Length 566 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
COPS5-208	ENST00000519057	ZNF415	Q09FC8	603 aa		3.57	□□□□□ -1.84
COPS5-208	ENST00000519057	TAF10	Q12962	218 aa		3.57	□□□□□ -1.84
COPS5-208	ENST00000519057	HERC3	Q15034	1050 aa		3.57	□□□□□ -1.84
COPS5-208	ENST00000519057	RAB41	Q5JT25	222 aa		3.57	□□□□□ -1.84
COPS5-208	ENST00000519057	ELFN2	Q5R3F8	820 aa		3.57	□□□□□ -1.84
COPS5-208	ENST00000519057	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		3.57	□□□□□ -1.84
COPS5-208	ENST00000519057	SASS6	Q6UVJ0	657 aa		3.57	□□□□□ -1.84
COPS5-208	ENST00000519057	RSRC2	Q7L4I2	434 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
COPS5-208	ENST00000519057	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		3.57	□□□□□ -1.84
COPS5-208	ENST00000519057	ZSCAN30	Q86W11	494 aa		3.57	□□□□□ -1.84
COPS5-208	ENST00000519057	FBXO39	Q8N4B4	442 aa		3.57	□□□□□ -1.84
COPS5-208	ENST00000519057	OTUD6B	Q8N6M0	293 aa		3.57	□□□□□ -1.84
COPS5-208	ENST00000519057	C17orf47	Q8NEP4	570 aa		3.57	□□□□□ -1.84
COPS5-208	ENST00000519057	OR2L2	Q8NH16	312 aa		3.57	□□□□□ -1.84
COPS5-208	ENST00000519057	OR1L3	Q8NH93	324 aa		3.57	□□□□□ -1.84
COPS5-208	ENST00000519057	MIPOL1	Q8TD10	442 aa		3.57	□□□□□ -1.84
COPS5-208	ENST00000519057	GATAD1	Q8WUU5	269 aa		3.57	□□□□□ -1.84
COPS5-208	ENST00000519057	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		3.57	□□□□□ -1.84
COPS5-208	ENST00000519057	SAT2	Q96F10	170 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
COPS5-208	ENST00000519057	OLFM1	Q99784	485 aa		3.57	□□□□□ -1.84
COPS5-208	ENST00000519057	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		3.57	□□□□□ -1.84
COPS5-208	ENST00000519057	TBC1D17	Q9HA65	648 aa		3.57	□□□□□ -1.84
COPS5-208	ENST00000519057	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		3.57	□□□□□ -1.84
COPS5-208	ENST00000519057	OR6C2	Q9NZP2	312 aa		3.57	□□□□□ -1.84
COPS5-208	ENST00000519057	MBD5	Q9P267	1494 aa		3.57	□□□□□ -1.84
COPS5-208	ENST00000519057	WBP11	Q9Y2W2	641 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
COPS5-208	ENST00000519057	TSPOAP1	O95153	1857 aa		3.56	□□□□□ -1.84
COPS5-208	ENST00000519057	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		3.56	□□□□□ -1.84
COPS5-208	ENST00000519057	FANCA	O15360	1455 aa		3.56	□□□□□ -1.84
COPS5-208	ENST00000519057	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
COPS5-208	ENST00000519057	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
COPS5-208	ENST00000519057	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		3.56	□□□□□ -1.84
COPS5-208	ENST00000519057		A0A1W2PNU3	283 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
COPS5-208	ENST00000519057	OR2A25	A4D2G3	310 aa		3.56	□□□□□ -1.84
COPS5-208	ENST00000519057	PTGES3L	E9PB15	166 aa		3.56	□□□□□ -1.84
COPS5-208	ENST00000519057	MPHOSPH10	O00566	681 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
COPS5-208	ENST00000519057	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
COPS5-208	ENST00000519057	IGHV3-13	P01766	116 aa		3.56	□□□□□ -1.84
COPS5-208	ENST00000519057	KRTAP1-4	P0C5Y4	121 aa		3.56	□□□□□ -1.84
COPS5-208	ENST00000519057	DNAH10OS	P0CZ25	163 aa		3.56	□□□□□ -1.84
COPS5-208	ENST00000519057	LIMK2	P53671	638 aa		3.56	□□□□□ -1.84
COPS5-208	ENST00000519057	CSNK2B	P67870	215 aa		3.56	□□□□□ -1.84
COPS5-208	ENST00000519057	CBX1	P83916	185 aa		3.56	□□□□□ -1.84
COPS5-208	ENST00000519057	GUCY2D	Q02846	1103 aa		3.56	□□□□□ -1.84
COPS5-208	ENST00000519057	PAX8	Q06710	450 aa		3.56	□□□□□ -1.84
COPS5-208	ENST00000519057	CCDC173	Q0VFZ6	552 aa		3.56	□□□□□ -1.84
COPS5-208	ENST00000519057	ZKSCAN8	Q15776	578 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
COPS5-208	ENST00000519057	MOGAT2	Q3SYC2	334 aa		3.56	□□□□□ -1.84
COPS5-208	ENST00000519057	GORAB	Q5T7V8	394 aa		3.56	□□□□□ -1.84
COPS5-208	ENST00000519057	LCE3A	Q5TA76	89 aa		3.56	□□□□□ -1.84
COPS5-208	ENST00000519057	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		3.56	□□□□□ -1.84
COPS5-208	ENST00000519057		Q6ZR54	194 aa		3.56	□□□□□ -1.84
COPS5-208	ENST00000519057	CATSPERD	Q86XM0	798 aa		3.56	□□□□□ -1.84
COPS5-208	ENST00000519057	CCDC107	Q8WV48	283 aa		3.56	□□□□□ -1.84
COPS5-208	ENST00000519057	RASL10A	Q92737	203 aa		3.56	□□□□□ -1.84
COPS5-208	ENST00000519057	HDAC2	Q92769	488 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
COPS5-208	ENST00000519057	DHX58	Q96C10	678 aa		3.56	□□□□□ -1.84
COPS5-208	ENST00000519057	PAFAH2	Q99487	392 aa		3.56	□□□□□ -1.84
COPS5-208	ENST00000519057	URM1	Q9BTM9	101 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
COPS5-208	ENST00000519057	SMARCAD1	Q9H4L7	1026 aa		3.56	□□□□□ -1.84
COPS5-208	ENST00000519057	SUCLA2	Q9P2R7	463 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
COPS5-208	ENST00000519057	MUTYH	Q9UIF7	546 aa		3.56	□□□□□ -1.84
COPS5-208	ENST00000519057	CEP152	O94986	1710 aa		3.56	□□□□□ -1.84
COPS5-208	ENST00000519057	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		3.56	□□□□□ -1.84
COPS5-208	ENST00000519057	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
COPS5-208	ENST00000519057	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
COPS5-208	ENST00000519057	ATP7A	Q04656	1500 aa		3.55	□□□□□ -1.84
COPS5-208	ENST00000519057	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		3.55	□□□□□ -1.84
COPS5-208	ENST00000519057	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		3.55	□□□□□ -1.84
COPS5-208	ENST00000519057	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		3.55	□□□□□ -1.84
COPS5-208	ENST00000519057	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
COPS5-208	ENST00000519057	KIF16B	Q96L93	1317 aa		3.55	□□□□□ -1.84
COPS5-208	ENST00000519057	FSD2	A1L4K1	749 aa		3.55	□□□□□ -1.84
COPS5-208	ENST00000519057	ENO4	A6NNW6	628 aa		3.55	□□□□□ -1.84
COPS5-208	ENST00000519057	AGAP14	A8MT82	685 aa		3.55	□□□□□ -1.84
COPS5-208	ENST00000519057		A8MU10	97 aa		3.55	□□□□□ -1.84
COPS5-208	ENST00000519057	VILL	O15195	856 aa		3.55	□□□□□ -1.84
COPS5-208	ENST00000519057	AVIL	O75366	819 aa		3.55	□□□□□ -1.84
COPS5-208	ENST00000519057	CDK2AP2	O75956	126 aa		3.55	□□□□□ -1.84
COPS5-208	ENST00000519057	TOMM70	O94826	608 aa		3.55	□□□□□ -1.84
COPS5-208	ENST00000519057	ZNF853	P0CG23	659 aa		3.55	□□□□□ -1.84
COPS5-208	ENST00000519057	CDH3	P22223	829 aa		3.55	□□□□□ -1.84
COPS5-208	ENST00000519057	PRKACG	P22612	351 aa		3.55	□□□□□ -1.84
COPS5-208	ENST00000519057	RPL21	P46778	160 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
COPS5-208	ENST00000519057	ODF4	Q2M2E3	257 aa		3.55	□□□□□ -1.84
COPS5-208	ENST00000519057	KRT79	Q5XKE5	535 aa		3.55	□□□□□ -1.84
COPS5-208	ENST00000519057	FAAH2	Q6GMR7	532 aa		3.55	□□□□□ -1.84
COPS5-208	ENST00000519057	DHRS7B	Q6IAN0	325 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
COPS5-208	ENST00000519057	CCDC70	Q6NSX1	233 aa		3.55	□□□□□ -1.84
COPS5-208	ENST00000519057	CREBRF	Q8IUR6	639 aa		3.55	□□□□□ -1.84
COPS5-208	ENST00000519057	CDK20	Q8IZL9	346 aa		3.55	□□□□□ -1.84
COPS5-208	ENST00000519057	AFAP1	Q8N556	730 aa		3.55	□□□□□ -1.84
COPS5-208	ENST00000519057	NECTIN4	Q96NY8	510 aa		3.55	□□□□□ -1.84
COPS5-208	ENST00000519057	PANK3	Q9H999	370 aa		3.55	□□□□□ -1.84
COPS5-208	ENST00000519057		Q9N2K0	584 aa		3.55	□□□□□ -1.84
COPS5-208	ENST00000519057	ARHGEF38	Q9NXL2	777 aa		3.55	□□□□□ -1.84
COPS5-208	ENST00000519057	TNN	Q9UQP3	1299 aa		3.55	□□□□□ -1.84
COPS5-208	ENST00000519057	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		3.55	□□□□□ -1.84
COPS5-208	ENST00000519057	TRIM17	Q9Y577	477 aa		3.55	□□□□□ -1.84
COPS5-208	ENST00000519057	KIF1B	O60333	1816 aa		3.55	□□□□□ -1.84

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