RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518681.5

MIB2-231, Transcript of mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene MIB2, Length 3,116 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MIB2-231	ENST00000518681	TMED10	P49755	219 aa	Known RBP	18.35	■□□□□ 0.53
MIB2-231	ENST00000518681	GZMM	P51124	257 aa		18.35	■□□□□ 0.53
MIB2-231	ENST00000518681	FKBP1B	P68106	108 aa		18.35	■□□□□ 0.53
MIB2-231	ENST00000518681	PRSS36	Q5K4E3	855 aa		18.35	■□□□□ 0.53
MIB2-231	ENST00000518681	NCCRP1	Q6ZVX7	275 aa	Predicted RBP	18.35	■□□□□ 0.53
MIB2-231	ENST00000518681	HIPK1	Q86Z02	1210 aa		18.35	■□□□□ 0.53
MIB2-231	ENST00000518681	AADAT	Q8N5Z0	425 aa		18.35	■□□□□ 0.53
MIB2-231	ENST00000518681	HEPH	Q9BQS7	1158 aa		18.35	■□□□□ 0.53
MIB2-231	ENST00000518681	KLHL25	Q9H0H3	589 aa		18.35	■□□□□ 0.53
MIB2-231	ENST00000518681	KRT84	Q9NSB2	600 aa		18.35	■□□□□ 0.53
MIB2-231	ENST00000518681	THG1L	Q9NWX6	298 aa	Known RBP	18.35	■□□□□ 0.53
MIB2-231	ENST00000518681	SLCO3A1	Q9UIG8	710 aa		18.35	■□□□□ 0.53
MIB2-231	ENST00000518681	SOBP	A7XYQ1	873 aa		18.34	■□□□□ 0.53
MIB2-231	ENST00000518681	CLIC1	O00299	241 aa		18.34	■□□□□ 0.53
MIB2-231	ENST00000518681	KPNA4	O00629	521 aa	Predicted RBP	18.34	■□□□□ 0.53
MIB2-231	ENST00000518681	FZD6	O60353	706 aa		18.34	■□□□□ 0.53
MIB2-231	ENST00000518681	RECQL5	O94762	991 aa	Predicted RBP	18.34	■□□□□ 0.53
MIB2-231	ENST00000518681	GBA	P04062	536 aa		18.34	■□□□□ 0.53
MIB2-231	ENST00000518681	ANXA5	P08758	320 aa		18.34	■□□□□ 0.53
MIB2-231	ENST00000518681	EBLN1	P0CF75	366 aa		18.34	■□□□□ 0.53
MIB2-231	ENST00000518681	ACPP	P15309	386 aa		18.34	■□□□□ 0.53
MIB2-231	ENST00000518681	MAD2L1	Q13257	205 aa	Predicted RBP	18.34	■□□□□ 0.53
MIB2-231	ENST00000518681	IRF5	Q13568	498 aa		18.34	■□□□□ 0.53
MIB2-231	ENST00000518681	SLC22A16	Q86VW1	577 aa		18.34	■□□□□ 0.53
MIB2-231	ENST00000518681	GPR156	Q8NFN8	814 aa		18.34	■□□□□ 0.53
MIB2-231	ENST00000518681	CNDP2	Q96KP4	475 aa	Known RBP	18.34	■□□□□ 0.53
MIB2-231	ENST00000518681	ROGDI	Q9GZN7	287 aa		18.34	■□□□□ 0.53
MIB2-231	ENST00000518681	BTBD3	Q9Y2F9	522 aa		18.34	■□□□□ 0.53
MIB2-231	ENST00000518681	LOC100506127	A0A0U1RQW1	187 aa		18.34	■□□□□ 0.53
MIB2-231	ENST00000518681	GJA1	P17302	382 aa		18.34	■□□□□ 0.53
MIB2-231	ENST00000518681	PTPN6	P29350	595 aa		18.34	■□□□□ 0.53
MIB2-231	ENST00000518681	POM121L1P	Q3SYA9	428 aa		18.34	■□□□□ 0.53
MIB2-231	ENST00000518681	C5orf22	Q49AR2	442 aa		18.34	■□□□□ 0.53
MIB2-231	ENST00000518681	COLEC12	Q5KU26	742 aa		18.34	■□□□□ 0.53
MIB2-231	ENST00000518681	CCSAP	Q6IQ19	270 aa	Predicted RBP	18.34	■□□□□ 0.53
MIB2-231	ENST00000518681	FAM180B	Q6P0A1	224 aa		18.34	■□□□□ 0.53
MIB2-231	ENST00000518681	TRIM46	Q7Z4K8	759 aa		18.34	■□□□□ 0.53
MIB2-231	ENST00000518681	SYT12	Q8IV01	421 aa		18.34	■□□□□ 0.53
MIB2-231	ENST00000518681	PLD3	Q8IV08	490 aa		18.34	■□□□□ 0.53
MIB2-231	ENST00000518681	SH3KBP1	Q96B97	665 aa		18.34	■□□□□ 0.53
MIB2-231	ENST00000518681	PDLIM5	Q96HC4	596 aa	Known RBP	18.34	■□□□□ 0.53
MIB2-231	ENST00000518681	C6orf62	Q9GZU0	229 aa	Predicted RBP	18.34	■□□□□ 0.53
MIB2-231	ENST00000518681	TRIT1	Q9H3H1	467 aa	Known RBP	18.34	■□□□□ 0.53
MIB2-231	ENST00000518681	AKIP1	Q9NQ31	210 aa		18.34	■□□□□ 0.53
MIB2-231	ENST00000518681	DNMT3B	Q9UBC3	853 aa	Known RBP	18.34	■□□□□ 0.53
MIB2-231	ENST00000518681	FAM220BP	B1ANY3	271 aa		18.34	■□□□□ 0.53
MIB2-231	ENST00000518681	RET	P07949	1114 aa		18.34	■□□□□ 0.53
MIB2-231	ENST00000518681	DBT	P11182	482 aa	Known RBP	18.34	■□□□□ 0.53
MIB2-231	ENST00000518681	POU2F1	P14859	743 aa		18.34	■□□□□ 0.53
MIB2-231	ENST00000518681	CD36	P16671	472 aa		18.34	■□□□□ 0.53
MIB2-231	ENST00000518681	NKX2-5	P52952	324 aa	Predicted RBP	18.34	■□□□□ 0.53
MIB2-231	ENST00000518681	GSTM4	Q03013	218 aa		18.34	■□□□□ 0.53
MIB2-231	ENST00000518681	SMG9	Q9H0W8	520 aa	Known RBP	18.34	■□□□□ 0.53
MIB2-231	ENST00000518681	RUBCNL	Q9H714	662 aa		18.34	■□□□□ 0.53
MIB2-231	ENST00000518681	MAGEE1	Q9HCI5	957 aa		18.34	■□□□□ 0.53
MIB2-231	ENST00000518681	TESMIN	Q9Y4I5	508 aa		18.34	■□□□□ 0.53
MIB2-231	ENST00000518681	TRBC1	P01850	177 aa		18.33	■□□□□ 0.53
MIB2-231	ENST00000518681	HOXA9	P31269	272 aa		18.33	■□□□□ 0.53
MIB2-231	ENST00000518681	OR1E2	P47887	323 aa		18.33	■□□□□ 0.53
MIB2-231	ENST00000518681	GABARAPL2	P60520	117 aa		18.33	■□□□□ 0.53
MIB2-231	ENST00000518681	EPS8	Q12929	822 aa		18.33	■□□□□ 0.53
MIB2-231	ENST00000518681	OXA1L	Q15070	435 aa		18.33	■□□□□ 0.53
MIB2-231	ENST00000518681	ATG9B	Q674R7	924 aa		18.33	■□□□□ 0.53
MIB2-231	ENST00000518681	RGMB	Q6NW40	437 aa		18.33	■□□□□ 0.53
MIB2-231	ENST00000518681	CERS6	Q6ZMG9	384 aa		18.33	■□□□□ 0.53
MIB2-231	ENST00000518681	CYP2U1	Q7Z449	544 aa		18.33	■□□□□ 0.53
MIB2-231	ENST00000518681	CALHM3	Q86XJ0	350 aa		18.33	■□□□□ 0.53
MIB2-231	ENST00000518681	HS6ST3	Q8IZP7	471 aa		18.33	■□□□□ 0.53
MIB2-231	ENST00000518681	GLB1L3	Q8NCI6	653 aa	Predicted RBP	18.33	■□□□□ 0.53
MIB2-231	ENST00000518681	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	18.33	■□□□□ 0.53
MIB2-231	ENST00000518681	ABHD8	Q96I13	439 aa		18.33	■□□□□ 0.53
MIB2-231	ENST00000518681	SCLY	Q96I15	445 aa		18.33	■□□□□ 0.53
MIB2-231	ENST00000518681	KCNH6	Q9H252	994 aa		18.33	■□□□□ 0.53
MIB2-231	ENST00000518681	MYO7A	Q13402	2215 aa		18.33	■□□□□ 0.52
MIB2-231	ENST00000518681	EVPLL	A8MZ36	301 aa		18.33	■□□□□ 0.52
MIB2-231	ENST00000518681	PCDHGA12	O60330	932 aa		18.33	■□□□□ 0.52
MIB2-231	ENST00000518681	COX7A2	P14406	83 aa		18.33	■□□□□ 0.52
MIB2-231	ENST00000518681	KIR3DL1	P43629	444 aa		18.33	■□□□□ 0.52
MIB2-231	ENST00000518681	SLC35A2	P78381	396 aa		18.33	■□□□□ 0.52
MIB2-231	ENST00000518681	B4GALNT1	Q00973	533 aa		18.33	■□□□□ 0.52
MIB2-231	ENST00000518681	LRRC66	Q68CR7	880 aa		18.33	■□□□□ 0.52
MIB2-231	ENST00000518681	SHQ1	Q6PI26	577 aa	Known RBP	18.33	■□□□□ 0.52
MIB2-231	ENST00000518681	NXPE1	Q8N323	547 aa		18.33	■□□□□ 0.52
MIB2-231	ENST00000518681	P2RY13	Q9BPV8	354 aa		18.33	■□□□□ 0.52
MIB2-231	ENST00000518681	TMEM121B	Q9BXQ6	578 aa	Predicted RBP	18.33	■□□□□ 0.52
MIB2-231	ENST00000518681	TMEM161A	Q9NX61	479 aa		18.33	■□□□□ 0.52
MIB2-231	ENST00000518681	SCN3B	Q9NY72	215 aa		18.33	■□□□□ 0.52
MIB2-231	ENST00000518681	CAB39	Q9Y376	341 aa	Predicted RBP	18.33	■□□□□ 0.52
MIB2-231	ENST00000518681	GRXCR2	A6NFK2	248 aa		18.32	■□□□□ 0.52
MIB2-231	ENST00000518681	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	18.32	■□□□□ 0.52
MIB2-231	ENST00000518681	ERN1	O75460	977 aa	Known RBP	18.32	■□□□□ 0.52
MIB2-231	ENST00000518681	IDH2	P48735	452 aa	Known RBP	18.32	■□□□□ 0.52
MIB2-231	ENST00000518681	ARHGDIA	P52565	204 aa		18.32	■□□□□ 0.52
MIB2-231	ENST00000518681	CLDN8	P56748	225 aa		18.32	■□□□□ 0.52
MIB2-231	ENST00000518681	TP53BP2	Q13625	1128 aa		18.32	■□□□□ 0.52
MIB2-231	ENST00000518681	USP7	Q93009	1102 aa		18.32	■□□□□ 0.52
MIB2-231	ENST00000518681	RDH12	Q96NR8	316 aa		18.32	■□□□□ 0.52
MIB2-231	ENST00000518681	RMND5A	Q9H871	391 aa		18.32	■□□□□ 0.52
MIB2-231	ENST00000518681	TMEM184C	Q9NVA4	438 aa		18.32	■□□□□ 0.52
MIB2-231	ENST00000518681	TAS2R16	Q9NYV7	291 aa		18.32	■□□□□ 0.52

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