RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502571.1

FBXO38-204, Transcript of F-box protein 38, human

TSL 2

Gene FBXO38, Length 605 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FBXO38-204	ENST00000502571	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	SUSD4	Q5VX71	490 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	NOTUM	Q6P988	496 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	NOA1	Q8NC60	698 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	KBTBD8	Q8NFY9	601 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	OR10V1	Q8NGI7	309 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	GDAP1	Q8TB36	358 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	TRAF3IP1	Q8TDR0	691 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	DNASE1L2	Q92874	299 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	VMP1	Q96GC9	406 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	GPATCH1	Q9BRR8	931 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	SHARPIN	Q9H0F6	387 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	MINDY3	Q9H8M7	445 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	COPS7B	Q9H9Q2	264 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	ARGLU1	Q9NWB6	273 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	WWOX	Q9NZC7	414 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	ZNF197	O14709	1029 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FBXO38-204	ENST00000502571	IKBKB	O14920	756 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FBXO38-204	ENST00000502571	STX6	O43752	255 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FBXO38-204	ENST00000502571	PRAF2	O60831	178 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FBXO38-204	ENST00000502571	DDHD2	O94830	711 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FBXO38-204	ENST00000502571	NGF	P01138	241 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FBXO38-204	ENST00000502571	ERVK-10	P10266	1014 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FBXO38-204	ENST00000502571	PSMB4	P28070	264 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FBXO38-204	ENST00000502571	TCF7	P36402	384 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
FBXO38-204	ENST00000502571	GCNT1	Q02742	428 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FBXO38-204	ENST00000502571	E2F5	Q15329	346 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FBXO38-204	ENST00000502571	MEP1B	Q16820	701 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FBXO38-204	ENST00000502571	SLC25A53	Q5H9E4	307 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FBXO38-204	ENST00000502571	MEX3B	Q6ZN04	569 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
FBXO38-204	ENST00000502571	OTOA	Q7RTW8	1153 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FBXO38-204	ENST00000502571	SLC16A9	Q7RTY1	509 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FBXO38-204	ENST00000502571	PIGZ	Q86VD9	579 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FBXO38-204	ENST00000502571	KLHL7	Q8IXQ5	586 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FBXO38-204	ENST00000502571	APCDD1	Q8J025	514 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FBXO38-204	ENST00000502571	NHLRC2	Q8NBF2	726 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FBXO38-204	ENST00000502571	ATAD1	Q8NBU5	361 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FBXO38-204	ENST00000502571	SEPT1	Q8WYJ6	367 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FBXO38-204	ENST00000502571	P2RX5	Q93086	422 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FBXO38-204	ENST00000502571	MAP3K3	Q99759	626 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FBXO38-204	ENST00000502571	CPVL	Q9H3G5	476 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FBXO38-204	ENST00000502571	INTS9	Q9NV88	658 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
FBXO38-204	ENST00000502571		A0A0G2JLW4	131 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FBXO38-204	ENST00000502571	PMS2P5	A8MQ11	134 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FBXO38-204	ENST00000502571		O00370	1275 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FBXO38-204	ENST00000502571	SLC30A4	O14863	429 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FBXO38-204	ENST00000502571	PPIP5K2	O43314	1243 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FBXO38-204	ENST00000502571	SELENOF	O60613	162 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FBXO38-204	ENST00000502571	DFFB	O76075	338 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FBXO38-204	ENST00000502571	NADK	O95544	446 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
FBXO38-204	ENST00000502571	APOH	P02749	345 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
FBXO38-204	ENST00000502571	SERPING1	P05155	500 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FBXO38-204	ENST00000502571	EDN1	P05305	212 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FBXO38-204	ENST00000502571	GP1BB	P13224	206 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FBXO38-204	ENST00000502571	DARS	P14868	501 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
FBXO38-204	ENST00000502571	EPOR	P19235	508 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FBXO38-204	ENST00000502571	CDX1	P47902	265 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
FBXO38-204	ENST00000502571	HERV-K104	P61576	105 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FBXO38-204	ENST00000502571	SQLE	Q14534	574 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FBXO38-204	ENST00000502571	PDLIM3	Q53GG5	364 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
FBXO38-204	ENST00000502571	SPOUT1	Q5T280	376 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
FBXO38-204	ENST00000502571	CYB5D1	Q6P9G0	228 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FBXO38-204	ENST00000502571	ZNF449	Q6P9G9	518 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FBXO38-204	ENST00000502571	AMIGO1	Q86WK6	493 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FBXO38-204	ENST00000502571	RIT1	Q92963	219 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FBXO38-204	ENST00000502571	PYCR2	Q96C36	320 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FBXO38-204	ENST00000502571	BSCL2	Q96G97	398 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
FBXO38-204	ENST00000502571	PARK7	Q99497	189 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
FBXO38-204	ENST00000502571	ACTL8	Q9H568	366 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FBXO38-204	ENST00000502571	CHST11	Q9NPF2	352 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FBXO38-204	ENST00000502571	SLC52A3	Q9NQ40	469 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FBXO38-204	ENST00000502571	ARMCX3	Q9UH62	379 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
FBXO38-204	ENST00000502571	ITGA11	Q9UKX5	1188 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FBXO38-204	ENST00000502571	CDH7	Q9ULB5	785 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FBXO38-204	ENST00000502571	KCNJ14	Q9UNX9	436 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FBXO38-204	ENST00000502571	TNN	Q9UQP3	1299 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FBXO38-204	ENST00000502571	CHKB	Q9Y259	395 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FBXO38-204	ENST00000502571	GIMAP1-GIMAP5	A0A087WTJ2	511 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FBXO38-204	ENST00000502571		A4D1N5	150 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FBXO38-204	ENST00000502571	OOEP	A6NGQ2	149 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FBXO38-204	ENST00000502571	FAM72C	H0Y354	149 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FBXO38-204	ENST00000502571	FLRT2	O43155	660 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FBXO38-204	ENST00000502571	PCDH7	O60245	1069 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FBXO38-204	ENST00000502571	CLPTM1	O96005	669 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FBXO38-204	ENST00000502571	PLG	P00747	810 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
FBXO38-204	ENST00000502571	RLN1	P04808	185 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FBXO38-204	ENST00000502571	GPI	P06744	558 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FBXO38-204	ENST00000502571	STAG3L1	P0CL83	205 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FBXO38-204	ENST00000502571	ANOS1	P23352	680 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FBXO38-204	ENST00000502571	ATP5D	P30049	168 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FBXO38-204	ENST00000502571	KCNJ1	P48048	391 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FBXO38-204	ENST00000502571	CDR2	Q01850	454 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FBXO38-204	ENST00000502571	YWHAH	Q04917	246 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
FBXO38-204	ENST00000502571	TRAP1	Q12931	704 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
FBXO38-204	ENST00000502571	NFE2L1	Q14494	772 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FBXO38-204	ENST00000502571	TYSND1	Q2T9J0	566 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FBXO38-204	ENST00000502571	ANKRD20A4	Q4UJ75	823 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FBXO38-204	ENST00000502571	ANKRD20A8P	Q5CZ79	823 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FBXO38-204	ENST00000502571	ANKRD20A2	Q5SQ80	823 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FBXO38-204	ENST00000502571	FAM72A	Q5TYM5	149 aa		4.56	□□□□□ -1.68

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