RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495517.5

RBM41-208, Transcript of RNA binding motif protein 41, human

TSL 2

Gene RBM41, Length 3,315 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM41-208	ENST00000495517	ZIC1	Q15915	447 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RBM41-208	ENST00000495517		Q6ZVL8	140 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RBM41-208	ENST00000495517	FAM129C	Q86XR2	697 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RBM41-208	ENST00000495517	TMPRSS6	Q8IU80	811 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RBM41-208	ENST00000495517	HDDC3	Q8N4P3	179 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RBM41-208	ENST00000495517	ARHGEF39	Q8N4T4	335 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RBM41-208	ENST00000495517	NAT16	Q8N8M0	369 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RBM41-208	ENST00000495517	FAM181A	Q8N9Y4	354 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RBM41-208	ENST00000495517	KDF1	Q8NAX2	398 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
RBM41-208	ENST00000495517	PUM2	Q8TB72	1066 aa	Known RBP eCLIP	6.68	□□□□□ -1.34
RBM41-208	ENST00000495517	DYDC1	Q8WWB3	177 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RBM41-208	ENST00000495517	SORCS1	Q8WY21	1168 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RBM41-208	ENST00000495517	MYLIP	Q8WY64	445 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RBM41-208	ENST00000495517	STARD8	Q92502	1023 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RBM41-208	ENST00000495517	UBE2E3	Q969T4	207 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RBM41-208	ENST00000495517	TESC	Q96BS2	214 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RBM41-208	ENST00000495517	REPS1	Q96D71	796 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RBM41-208	ENST00000495517	BMF	Q96LC9	184 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RBM41-208	ENST00000495517	ACOX2	Q99424	681 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RBM41-208	ENST00000495517	NMUR2	Q9GZQ4	415 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RBM41-208	ENST00000495517	EPHA6	Q9UF33	1036 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RBM41-208	ENST00000495517	MBD1	Q9UIS9	605 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
RBM41-208	ENST00000495517	ZNF225	Q9UK10	706 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RBM41-208	ENST00000495517	MAN2B2	Q9Y2E5	1009 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RBM41-208	ENST00000495517	TRIM64B	A6NI03	449 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RBM41-208	ENST00000495517	SDHD	O14521	159 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RBM41-208	ENST00000495517	ANKRD28	O15084	1053 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RBM41-208	ENST00000495517	NIPSNAP2	O75323	286 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RBM41-208	ENST00000495517	CDK14	O94921	469 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RBM41-208	ENST00000495517	BGN	P21810	368 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RBM41-208	ENST00000495517	PEX19	P40855	299 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RBM41-208	ENST00000495517	REEP5	Q00765	189 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RBM41-208	ENST00000495517	MTAP	Q13126	283 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RBM41-208	ENST00000495517	PWP1	Q13610	501 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RBM41-208	ENST00000495517	TMEM95	Q3KNT9	176 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RBM41-208	ENST00000495517	OGFRL1	Q5TC84	451 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
RBM41-208	ENST00000495517	PTRHD1	Q6GMV3	140 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
RBM41-208	ENST00000495517	BORA	Q6PGQ7	559 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RBM41-208	ENST00000495517	SFTPA1	Q8IWL2	248 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RBM41-208	ENST00000495517	FBXO39	Q8N4B4	442 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RBM41-208	ENST00000495517	SIDT2	Q8NBJ9	832 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
RBM41-208	ENST00000495517	RBM15B	Q8NDT2	890 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
RBM41-208	ENST00000495517	TTL	Q8NG68	377 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RBM41-208	ENST00000495517	GOT1L1	Q8NHS2	421 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
RBM41-208	ENST00000495517	PSMA8	Q8TAA3	256 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RBM41-208	ENST00000495517	ROPN1L	Q96C74	230 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RBM41-208	ENST00000495517	SIPA1	Q96FS4	1042 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RBM41-208	ENST00000495517	WDR92	Q96MX6	357 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RBM41-208	ENST00000495517	BOC	Q9BWV1	1114 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RBM41-208	ENST00000495517	TRIM54	Q9BYV2	358 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RBM41-208	ENST00000495517	C12orf65	Q9H3J6	166 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
RBM41-208	ENST00000495517	WDR26	Q9H7D7	661 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RBM41-208	ENST00000495517	ZNF395	Q9H8N7	513 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
RBM41-208	ENST00000495517	CAB39L	Q9H9S4	337 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RBM41-208	ENST00000495517	GALP	Q9UBC7	116 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RBM41-208	ENST00000495517	CENPF	P49454	3210 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RBM41-208	ENST00000495517	CHD7	Q9P2D1	2997 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RBM41-208	ENST00000495517	TRIM64	A6NGJ6	449 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RBM41-208	ENST00000495517	CACNB4	O00305	520 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
RBM41-208	ENST00000495517	FCHO1	O14526	889 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RBM41-208	ENST00000495517	FPGT	O14772	594 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RBM41-208	ENST00000495517	NME1	P15531	152 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
RBM41-208	ENST00000495517	MXRA7	P84157	204 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RBM41-208	ENST00000495517	DYNC1I2	Q13409	638 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
RBM41-208	ENST00000495517	ODF1	Q14990	250 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RBM41-208	ENST00000495517	DPY19L1	Q2PZI1	675 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RBM41-208	ENST00000495517	ZXDC	Q2QGD7	858 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
RBM41-208	ENST00000495517	TRMT5	Q32P41	509 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
RBM41-208	ENST00000495517	UAP1L1	Q3KQV9	507 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RBM41-208	ENST00000495517	DHRS4L2	Q6PKH6	230 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RBM41-208	ENST00000495517	REC114	Q7Z4M0	266 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RBM41-208	ENST00000495517	ARHGAP22	Q7Z5H3	698 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RBM41-208	ENST00000495517	NRROS	Q86YC3	692 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RBM41-208	ENST00000495517	MARVELD2	Q8N4S9	558 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RBM41-208	ENST00000495517	OR6C4	Q8NGE1	309 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RBM41-208	ENST00000495517	OR9A1P	Q8NGU1	263 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RBM41-208	ENST00000495517	RPLP0P6	Q8NHW5	317 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RBM41-208	ENST00000495517	RP9	Q8TA86	221 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
RBM41-208	ENST00000495517	FAM81A	Q8TBF8	368 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RBM41-208	ENST00000495517	TM4SF19	Q96DZ7	209 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RBM41-208	ENST00000495517	SLX1A	Q9BQ83	275 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RBM41-208	ENST00000495517	EFCAB11	Q9BUY7	163 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RBM41-208	ENST00000495517	OR6C2	Q9NZP2	312 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RBM41-208	ENST00000495517	PCDHB14	Q9Y5E9	798 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RBM41-208	ENST00000495517		A0A1W2PPV9	198 aa		6.67	□□□□□ -1.34
RBM41-208	ENST00000495517	TRIM64C	A6NLI5	447 aa		6.67	□□□□□ -1.34
RBM41-208	ENST00000495517	TK2	O00142	265 aa		6.67	□□□□□ -1.34
RBM41-208	ENST00000495517	SLITRK5	O94991	958 aa		6.67	□□□□□ -1.34
RBM41-208	ENST00000495517	SEMA4F	O95754	770 aa		6.67	□□□□□ -1.34
RBM41-208	ENST00000495517	CAT	P04040	527 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
RBM41-208	ENST00000495517	CSF2	P04141	144 aa		6.67	□□□□□ -1.34
RBM41-208	ENST00000495517	GK	P32189	559 aa		6.67	□□□□□ -1.34
RBM41-208	ENST00000495517	AHR	P35869	848 aa		6.67	□□□□□ -1.34
RBM41-208	ENST00000495517	PDE7A	Q13946	482 aa		6.67	□□□□□ -1.34
RBM41-208	ENST00000495517	GAS6	Q14393	721 aa		6.67	□□□□□ -1.34
RBM41-208	ENST00000495517	MYBPC3	Q14896	1274 aa		6.67	□□□□□ -1.34
RBM41-208	ENST00000495517	MAPRE2	Q15555	327 aa		6.67	□□□□□ -1.34
RBM41-208	ENST00000495517	EEF1AKMT2	Q5JPI9	291 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
RBM41-208	ENST00000495517	HP1BP3	Q5SSJ5	553 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
RBM41-208	ENST00000495517	SEL1L3	Q68CR1	1132 aa		6.67	□□□□□ -1.34

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