RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495423.1

SIMC1-208, Transcript of SUMO interacting motifs containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene SIMC1, Length 913 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIMC1-208ENST00000495423 A0A1B0GUH1 482 aa22.17■■□□□ 1.14
SIMC1-208ENST00000495423 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
SIMC1-208ENST00000495423 SOCS6O14544 535 aa22.17■■□□□ 1.14
SIMC1-208ENST00000495423 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
SIMC1-208ENST00000495423 ALBP02768 609 aa22.17■■□□□ 1.14
SIMC1-208ENST00000495423 TPBGLP0DKB5 382 aa22.17■■□□□ 1.14
SIMC1-208ENST00000495423 ITGAXP20702 1163 aa22.17■■□□□ 1.14
SIMC1-208ENST00000495423 ACADLP28330 430 aa22.17■■□□□ 1.14
SIMC1-208ENST00000495423 ITGA8P53708 1063 aa22.17■■□□□ 1.14
SIMC1-208ENST00000495423 RIPPLY3P57055 190 aa22.17■■□□□ 1.14
SIMC1-208ENST00000495423 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
SIMC1-208ENST00000495423 SLC5A12Q1EHB4 618 aa22.17■■□□□ 1.14
SIMC1-208ENST00000495423 TSTD2Q5T7W7 516 aa22.17■■□□□ 1.14
SIMC1-208ENST00000495423 TBC1D21Q8IYX1 336 aa22.17■■□□□ 1.14
SIMC1-208ENST00000495423 CLDN19Q8N6F1 224 aa22.17■■□□□ 1.14
SIMC1-208ENST00000495423 DLG3Q92796 817 aa22.17■■□□□ 1.14
SIMC1-208ENST00000495423 LRRC1Q9BTT6 524 aa22.17■■□□□ 1.14
SIMC1-208ENST00000495423 SLC26A1Q9H2B4 701 aa22.17■■□□□ 1.14
SIMC1-208ENST00000495423 POLG2Q9UHN1 485 aa22.17■■□□□ 1.14
SIMC1-208ENST00000495423 SOX13Q9UN79 622 aa22.17■■□□□ 1.14
SIMC1-208ENST00000495423 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa22.17■■□□□ 1.14
SIMC1-208ENST00000495423 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa22.16■■□□□ 1.14
SIMC1-208ENST00000495423 CCL22O00626 93 aa22.16■■□□□ 1.14
SIMC1-208ENST00000495423 TP73O15350 636 aa22.16■■□□□ 1.14
SIMC1-208ENST00000495423 ALOX12BO75342 701 aa22.16■■□□□ 1.14
SIMC1-208ENST00000495423 AP2A2O94973 939 aa22.16■■□□□ 1.14
SIMC1-208ENST00000495423 CDC16Q13042 620 aa22.16■■□□□ 1.14
SIMC1-208ENST00000495423 TLR1Q15399 786 aa22.16■■□□□ 1.14
SIMC1-208ENST00000495423 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa22.16■■□□□ 1.14
SIMC1-208ENST00000495423 FCRL6Q6DN72 434 aa22.16■■□□□ 1.14
SIMC1-208ENST00000495423 OVCH1Q7RTY7 1134 aa22.16■■□□□ 1.14
SIMC1-208ENST00000495423 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
SIMC1-208ENST00000495423 OR5K2Q8NHB8 316 aa22.16■■□□□ 1.14
SIMC1-208ENST00000495423 SPSB2Q99619 263 aa22.16■■□□□ 1.14
SIMC1-208ENST00000495423 FAM114A2Q9NRY5 505 aa22.16■■□□□ 1.14
SIMC1-208ENST00000495423 IGSF5Q9NSI5 407 aa22.16■■□□□ 1.14
SIMC1-208ENST00000495423 IRAK4Q9NWZ3 460 aa22.16■■□□□ 1.14
SIMC1-208ENST00000495423 EURLQ9NYK6 297 aa22.16■■□□□ 1.14
SIMC1-208ENST00000495423 SAMD15Q9P1V8 674 aa22.16■■□□□ 1.14
SIMC1-208ENST00000495423 ASF1AQ9Y294 204 aa22.16■■□□□ 1.14
SIMC1-208ENST00000495423 SNX24Q9Y343 169 aa22.16■■□□□ 1.14
SIMC1-208ENST00000495423 A0A1B0GX78 115 aa22.15■■□□□ 1.14
SIMC1-208ENST00000495423 PRSS44E7EML9 344 aa22.15■■□□□ 1.14
SIMC1-208ENST00000495423 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP22.15■■□□□ 1.14
SIMC1-208ENST00000495423 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
SIMC1-208ENST00000495423 ARSFP54793 590 aa22.15■■□□□ 1.14
SIMC1-208ENST00000495423 ARL4CP56559 192 aa22.15■■□□□ 1.14
SIMC1-208ENST00000495423 KIR2DS3Q14952 304 aa22.15■■□□□ 1.14
SIMC1-208ENST00000495423 NKG7Q16617 165 aa22.15■■□□□ 1.14
SIMC1-208ENST00000495423 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
SIMC1-208ENST00000495423 KIRREL2Q6UWL6 708 aa22.15■■□□□ 1.14
SIMC1-208ENST00000495423 MCEMP1Q8IX19 187 aa22.15■■□□□ 1.14
SIMC1-208ENST00000495423 DENND1AQ8TEH3 1009 aa22.15■■□□□ 1.14
SIMC1-208ENST00000495423 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa22.15■■□□□ 1.14
SIMC1-208ENST00000495423 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
SIMC1-208ENST00000495423 SIGLEC10Q96LC7 697 aa22.15■■□□□ 1.14
SIMC1-208ENST00000495423 TRIM31Q9BZY9 425 aa22.15■■□□□ 1.14
SIMC1-208ENST00000495423 LHPPQ9H008 270 aa22.15■■□□□ 1.14
SIMC1-208ENST00000495423 TSPYL1Q9H0U9 437 aa22.15■■□□□ 1.14
SIMC1-208ENST00000495423 EPS8L2Q9H6S3 715 aa22.15■■□□□ 1.14
SIMC1-208ENST00000495423 RUBCNLQ9H714 662 aa22.15■■□□□ 1.14
SIMC1-208ENST00000495423 TREX1Q9NSU2 369 aa22.15■■□□□ 1.14
SIMC1-208ENST00000495423 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
SIMC1-208ENST00000495423 TTC4O95801 387 aa22.14■■□□□ 1.13
SIMC1-208ENST00000495423 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
SIMC1-208ENST00000495423 ALAS2P22557 587 aa22.14■■□□□ 1.13
SIMC1-208ENST00000495423 MGAT1P26572 445 aa22.14■■□□□ 1.13
SIMC1-208ENST00000495423 CEP128Q6ZU80 1094 aa22.14■■□□□ 1.13
SIMC1-208ENST00000495423 CNDP1Q96KN2 507 aa22.14■■□□□ 1.13
SIMC1-208ENST00000495423 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
SIMC1-208ENST00000495423 SYBUQ9NX95 663 aa22.14■■□□□ 1.13
SIMC1-208ENST00000495423 GRHL1Q9NZI5 618 aa22.14■■□□□ 1.13
SIMC1-208ENST00000495423 MED13LQ71F56 2210 aa22.13■■□□□ 1.13
SIMC1-208ENST00000495423 E7ESA3 106 aa22.13■■□□□ 1.13
SIMC1-208ENST00000495423 PRSS56P0CW18 603 aa22.13■■□□□ 1.13
SIMC1-208ENST00000495423 PAMP19021 973 aa22.13■■□□□ 1.13
SIMC1-208ENST00000495423 TUBB8Q3ZCM7 444 aa22.13■■□□□ 1.13
SIMC1-208ENST00000495423 FAM180AQ6UWF9 173 aa22.13■■□□□ 1.13
SIMC1-208ENST00000495423 TTLL10Q6ZVT0 673 aa22.13■■□□□ 1.13
SIMC1-208ENST00000495423 MICALCLQ6ZW33 695 aa22.13■■□□□ 1.13
SIMC1-208ENST00000495423 COX15Q7KZN9 410 aa22.13■■□□□ 1.13
SIMC1-208ENST00000495423 FJX1Q86VR8 437 aa22.13■■□□□ 1.13
SIMC1-208ENST00000495423 PIANPQ8IYJ0 282 aa22.13■■□□□ 1.13
SIMC1-208ENST00000495423 OR13J1Q8NGT2 312 aa22.13■■□□□ 1.13
SIMC1-208ENST00000495423 RELTQ969Z4 430 aa22.13■■□□□ 1.13
SIMC1-208ENST00000495423 CHRAC1Q9NRG0 131 aa22.13■■□□□ 1.13
SIMC1-208ENST00000495423 ENAMQ9NRM1 1142 aa22.13■■□□□ 1.13
SIMC1-208ENST00000495423 COPG2Q9UBF2 871 aa22.13■■□□□ 1.13
SIMC1-208ENST00000495423 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SIMC1-208ENST00000495423 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SIMC1-208ENST00000495423 CCDC78A2IDD5 438 aa22.12■■□□□ 1.13
SIMC1-208ENST00000495423 ISM1B1AKI9 464 aa22.12■■□□□ 1.13
SIMC1-208ENST00000495423 GOLGA8MH3BSY2 632 aa22.12■■□□□ 1.13
SIMC1-208ENST00000495423 QSOX1O00391 747 aa22.12■■□□□ 1.13
SIMC1-208ENST00000495423 DSCR3O14972 297 aa22.12■■□□□ 1.13
SIMC1-208ENST00000495423 KDM1AO60341 852 aa22.12■■□□□ 1.13
SIMC1-208ENST00000495423 AVILO75366 819 aa22.12■■□□□ 1.13
SIMC1-208ENST00000495423 USP1O94782 785 aa22.12■■□□□ 1.13
SIMC1-208ENST00000495423 MAGP20916 626 aa22.12■■□□□ 1.13
SIMC1-208ENST00000495423 GRNP28799 593 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms