RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486917.1

PRRT1-208, Transcript of proline rich transmembrane protein 1, human

TSL 5

Gene PRRT1, Length 620 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRRT1-208	ENST00000486917	ZNF282	Q9UDV7	671 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
PRRT1-208	ENST00000486917	GNPTG	Q9UJJ9	305 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PRRT1-208	ENST00000486917	ANAPC5	Q9UJX4	755 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PRRT1-208	ENST00000486917	C3orf18	Q9UK00	162 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PRRT1-208	ENST00000486917	TTC7A	Q9ULT0	858 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
PRRT1-208	ENST00000486917	RUVBL2	Q9Y230	463 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
PRRT1-208	ENST00000486917		A0A0U1RQJ8	604 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PRRT1-208	ENST00000486917		A0A1B0GUH1	482 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PRRT1-208	ENST00000486917		A0A1W2PQ72	361 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PRRT1-208	ENST00000486917	OR2A25	A4D2G3	310 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PRRT1-208	ENST00000486917		E7EVH7	732 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PRRT1-208	ENST00000486917	MAP2K7	O14733	419 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PRRT1-208	ENST00000486917	CD3EAP	O15446	510 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
PRRT1-208	ENST00000486917	HNRNPR	O43390	633 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
PRRT1-208	ENST00000486917	IFNB1	P01574	187 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PRRT1-208	ENST00000486917	COX6A1	P12074	109 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PRRT1-208	ENST00000486917	PRF1	P14222	555 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PRRT1-208	ENST00000486917	RPS3	P23396	243 aa	Known RBP eCLIP	13.59	□□□□□ -0.23
PRRT1-208	ENST00000486917	SOX11	P35716	441 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PRRT1-208	ENST00000486917	TDGF1P3	P51864	188 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PRRT1-208	ENST00000486917	YBX1	P67809	324 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
PRRT1-208	ENST00000486917	VWA2	Q5GFL6	755 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PRRT1-208	ENST00000486917	PTRHD1	Q6GMV3	140 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
PRRT1-208	ENST00000486917	KIAA1328	Q86T90	577 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PRRT1-208	ENST00000486917	PRUNE1	Q86TP1	453 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PRRT1-208	ENST00000486917	KBTBD2	Q8IY47	623 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PRRT1-208	ENST00000486917	SRRM1	Q8IYB3	904 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
PRRT1-208	ENST00000486917	PRSS58	Q8IYP2	241 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PRRT1-208	ENST00000486917	RAB42	Q8N4Z0	105 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PRRT1-208	ENST00000486917	PPHLN1	Q8NEY8	458 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
PRRT1-208	ENST00000486917	OR1N1	Q8NGS0	311 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PRRT1-208	ENST00000486917	MARVELD3	Q96A59	401 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PRRT1-208	ENST00000486917	C8orf44	Q96CB5	159 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PRRT1-208	ENST00000486917	RAB6B	Q9NRW1	208 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PRRT1-208	ENST00000486917	TREX1	Q9NSU2	369 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PRRT1-208	ENST00000486917	STOX2	Q9P2F5	926 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
PRRT1-208	ENST00000486917	ZC3H7B	Q9UGR2	993 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
PRRT1-208	ENST00000486917	MRFAP1	Q9Y605	127 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PRRT1-208	ENST00000486917	PCDH17	O14917	1159 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	KPNA5	O15131	536 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	JRK	O75564	520 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	USP1	O94782	785 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	APRT	P07741	180 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	PRR35	P0CG20	571 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	ERG	P11308	486 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	ETS1	P14921	441 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	CCNF	P41002	786 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	ZNF75D	P51815	510 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	EMP3	P54852	163 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	ARG2	P78540	354 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	FASTK	Q14296	549 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	MUM1	Q2TAK8	710 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	PRTG	Q2VWP7	1150 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	PCID2	Q5JVF3	399 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	FBXO42	Q6P3S6	717 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	CNST	Q6PJW8	725 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	NDUFAF7	Q7L592	441 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	OTOA	Q7RTW8	1153 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	LAPTM4B	Q86VI4	370 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	FJX1	Q86VR8	437 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	LRRC6	Q86X45	466 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	MPP5	Q8N3R9	675 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	GSDMB	Q8TAX9	411 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	BRIX1	Q8TDN6	353 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	TAAR6	Q96RI8	345 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	ZFYVE21	Q9BQ24	234 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	FRMD8P1	Q9BZ68	369 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	SYNPO2L	Q9H987	977 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	SPATA7	Q9P0W8	599 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	CAPN6	Q9Y6Q1	641 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	NCOA6	Q14686	2063 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	CACNA1C	Q13936	2221 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	SCN3A	Q9NY46	2000 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	NSG1	A0A0A6YYJ2	146 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	ARHGAP10	A1A4S6	786 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	MATN4	O95460	622 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	EIF2S1	P05198	315 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	FBL	P22087	321 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	FDXR	P22570	491 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	TNFSF10	P50591	281 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	GBX1	Q14549	363 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	NAA25	Q14CX7	972 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	INA	Q16352	499 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	CTSL3P	Q5NE16	218 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	SP5	Q6BEB4	398 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	TMEM139	Q8IV31	216 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	MAGEC3	Q8TD91	643 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	SKA2	Q8WVK7	121 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	NR4A3	Q92570	626 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	HAS2	Q92819	552 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	RELT	Q969Z4	430 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	MVB12A	Q96EY5	273 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	FOPNL	Q96NB1	174 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	DPH7	Q9BTV6	452 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	UNK	Q9C0B0	810 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	PLA2G3	Q9NZ20	509 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	PTGFRN	Q9P2B2	879 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	ZNF148	Q9UQR1	794 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	OTOG	Q6ZRI0	2925 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PRRT1-208	ENST00000486917	PDZD2	O15018	2839 aa		13.56	□□□□□ -0.24

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