RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466596.5

HS3ST3B1-202, Transcript of heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 3B1, humanhuman

TSL 2

Gene HS3ST3B1, Length 2,808 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS3ST3B1-202ENST00000466596 RTP2Q5QGT7 225 aa14.58□□□□□ -0.08
HS3ST3B1-202ENST00000466596 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
HS3ST3B1-202ENST00000466596 FKBP9P1Q75LS8 142 aa14.58□□□□□ -0.08
HS3ST3B1-202ENST00000466596 HORMAD1Q86X24 394 aa14.58□□□□□ -0.08
HS3ST3B1-202ENST00000466596 GALNT13Q8IUC8 556 aa14.58□□□□□ -0.08
HS3ST3B1-202ENST00000466596 SLC38A4Q969I6 547 aa14.58□□□□□ -0.08
HS3ST3B1-202ENST00000466596 APOL4Q9BPW4 351 aa14.58□□□□□ -0.08
HS3ST3B1-202ENST00000466596 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa14.58□□□□□ -0.08
HS3ST3B1-202ENST00000466596 COPS4Q9BT78 406 aa14.58□□□□□ -0.08
HS3ST3B1-202ENST00000466596 CDADC1Q9BWV3 514 aa14.58□□□□□ -0.08
HS3ST3B1-202ENST00000466596 ITPAQ9BY32 194 aa14.58□□□□□ -0.08
HS3ST3B1-202ENST00000466596 PDFQ9HBH1 243 aa14.58□□□□□ -0.08
HS3ST3B1-202ENST00000466596 LRTM1Q9HBL6 345 aa14.58□□□□□ -0.08
HS3ST3B1-202ENST00000466596 SERHLQ9NQF3 203 aa14.58□□□□□ -0.08
HS3ST3B1-202ENST00000466596 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
HS3ST3B1-202ENST00000466596 SNX8Q9Y5X2 465 aa14.58□□□□□ -0.08
HS3ST3B1-202ENST00000466596 C2orf81A6NN90 581 aa14.58□□□□□ -0.08
HS3ST3B1-202ENST00000466596 LOC730098B7Z3J9 87 aa14.58□□□□□ -0.08
HS3ST3B1-202ENST00000466596 CYP7B1O75881 506 aa14.58□□□□□ -0.08
HS3ST3B1-202ENST00000466596 OTCP00480 354 aa14.58□□□□□ -0.08
HS3ST3B1-202ENST00000466596 IGHA2P01877 340 aa14.58□□□□□ -0.08
HS3ST3B1-202ENST00000466596 ALPIP09923 528 aa14.58□□□□□ -0.08
HS3ST3B1-202ENST00000466596 SLC19A1P41440 591 aa14.58□□□□□ -0.08
HS3ST3B1-202ENST00000466596 GZMMP51124 257 aa14.58□□□□□ -0.08
HS3ST3B1-202ENST00000466596 FAM214AQ32MH5 1076 aa14.58□□□□□ -0.08
HS3ST3B1-202ENST00000466596 PLEKHG6Q3KR16 790 aa14.58□□□□□ -0.08
HS3ST3B1-202ENST00000466596 CYP27C1Q4G0S4 372 aa14.58□□□□□ -0.08
HS3ST3B1-202ENST00000466596 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
HS3ST3B1-202ENST00000466596 FAM151BQ6UXP7 276 aa14.58□□□□□ -0.08
HS3ST3B1-202ENST00000466596 PRSS48Q7RTY5 328 aa14.58□□□□□ -0.08
HS3ST3B1-202ENST00000466596 SNX20Q7Z614 316 aa14.58□□□□□ -0.08
HS3ST3B1-202ENST00000466596 ENTHD1Q8IYW4 607 aa14.58□□□□□ -0.08
HS3ST3B1-202ENST00000466596 TPD52L3Q96J77 140 aa14.58□□□□□ -0.08
HS3ST3B1-202ENST00000466596 BCL7BQ9BQE9 202 aa14.58□□□□□ -0.08
HS3ST3B1-202ENST00000466596 CENPOQ9BU64 300 aa14.58□□□□□ -0.08
HS3ST3B1-202ENST00000466596 CLMPQ9H6B4 373 aa14.58□□□□□ -0.08
HS3ST3B1-202ENST00000466596 ERVK13-1Q9NX77 482 aa14.58□□□□□ -0.08
HS3ST3B1-202ENST00000466596 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
HS3ST3B1-202ENST00000466596 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
HS3ST3B1-202ENST00000466596 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa14.57□□□□□ -0.08
HS3ST3B1-202ENST00000466596 RGS14O43566 566 aa14.57□□□□□ -0.08
HS3ST3B1-202ENST00000466596 IDH3BO43837 385 aa14.57□□□□□ -0.08
HS3ST3B1-202ENST00000466596 ULK1O75385 1050 aa14.57□□□□□ -0.08
HS3ST3B1-202ENST00000466596 COL6A1P12109 1028 aa14.57□□□□□ -0.08
HS3ST3B1-202ENST00000466596 GNPDA1P46926 289 aa14.57□□□□□ -0.08
HS3ST3B1-202ENST00000466596 CLCN7P51798 805 aa14.57□□□□□ -0.08
HS3ST3B1-202ENST00000466596 TIGD6Q17RP2 521 aa14.57□□□□□ -0.08
HS3ST3B1-202ENST00000466596 CACHD1Q5VU97 1274 aa14.57□□□□□ -0.08
HS3ST3B1-202ENST00000466596 NXNL2Q5VZ03 156 aa14.57□□□□□ -0.08
HS3ST3B1-202ENST00000466596 LINC00299Q6ZSB3 139 aa14.57□□□□□ -0.08
HS3ST3B1-202ENST00000466596 EBPLQ9BY08 206 aa14.57□□□□□ -0.08
HS3ST3B1-202ENST00000466596 CIPCQ9C0C6 399 aa14.57□□□□□ -0.08
HS3ST3B1-202ENST00000466596 FBXO44Q9H4M3 255 aa14.57□□□□□ -0.08
HS3ST3B1-202ENST00000466596 RUBCNLQ9H714 662 aa14.57□□□□□ -0.08
HS3ST3B1-202ENST00000466596 NUDT4Q9NZJ9 180 aa14.57□□□□□ -0.08
HS3ST3B1-202ENST00000466596 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa14.57□□□□□ -0.08
HS3ST3B1-202ENST00000466596 STX7O15400 261 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
HS3ST3B1-202ENST00000466596 OAZ2O95190 189 aa14.57□□□□□ -0.08
HS3ST3B1-202ENST00000466596 TWF1Q12792 350 aa14.57□□□□□ -0.08
HS3ST3B1-202ENST00000466596 CALHM3Q86XJ0 350 aa14.57□□□□□ -0.08
HS3ST3B1-202ENST00000466596 IFNL1Q8IU54 200 aa14.57□□□□□ -0.08
HS3ST3B1-202ENST00000466596 LACC1Q8IV20 430 aa14.57□□□□□ -0.08
HS3ST3B1-202ENST00000466596 PAF1Q8N7H5 531 aa14.57□□□□□ -0.08
HS3ST3B1-202ENST00000466596 TET1Q8NFU7 2136 aa14.57□□□□□ -0.08
HS3ST3B1-202ENST00000466596 CEP44Q9C0F1 390 aa14.57□□□□□ -0.08
HS3ST3B1-202ENST00000466596 TNKS2Q9H2K2 1166 aa14.57□□□□□ -0.08
HS3ST3B1-202ENST00000466596 WWOXQ9NZC7 414 aa14.57□□□□□ -0.08
HS3ST3B1-202ENST00000466596 MTMR11A4FU01 709 aa14.56□□□□□ -0.08
HS3ST3B1-202ENST00000466596 FAM220BPB1ANY3 271 aa14.56□□□□□ -0.08
HS3ST3B1-202ENST00000466596 KMOO15229 486 aa14.56□□□□□ -0.08
HS3ST3B1-202ENST00000466596 TLL1O43897 1013 aa14.56□□□□□ -0.08
HS3ST3B1-202ENST00000466596 KLKB1P03952 638 aa14.56□□□□□ -0.08
HS3ST3B1-202ENST00000466596 IL6P05231 212 aa14.56□□□□□ -0.08
HS3ST3B1-202ENST00000466596 LPOP22079 712 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
HS3ST3B1-202ENST00000466596 GKP32189 559 aa14.56□□□□□ -0.08
HS3ST3B1-202ENST00000466596 CTSKP43235 329 aa14.56□□□□□ -0.08
HS3ST3B1-202ENST00000466596 ARHGDIAP52565 204 aa14.56□□□□□ -0.08
HS3ST3B1-202ENST00000466596 DSC1Q08554 894 aa14.56□□□□□ -0.08
HS3ST3B1-202ENST00000466596 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
HS3ST3B1-202ENST00000466596 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa14.56□□□□□ -0.08
HS3ST3B1-202ENST00000466596 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
HS3ST3B1-202ENST00000466596 P3H2Q8IVL5 708 aa14.56□□□□□ -0.08
HS3ST3B1-202ENST00000466596 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa14.56□□□□□ -0.08
HS3ST3B1-202ENST00000466596 PEX13Q92968 403 aa14.56□□□□□ -0.08
HS3ST3B1-202ENST00000466596 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
HS3ST3B1-202ENST00000466596 SH3GL1Q99961 368 aa14.56□□□□□ -0.08
HS3ST3B1-202ENST00000466596 KCNS3Q9BQ31 491 aa14.56□□□□□ -0.08
HS3ST3B1-202ENST00000466596 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
HS3ST3B1-202ENST00000466596 RNF38Q9H0F5 515 aa14.56□□□□□ -0.08
HS3ST3B1-202ENST00000466596 MMP27Q9H306 513 aa14.56□□□□□ -0.08
HS3ST3B1-202ENST00000466596 MAGIXQ9H6Y5 334 aa14.56□□□□□ -0.08
HS3ST3B1-202ENST00000466596 PARVBQ9HBI1 364 aa14.56□□□□□ -0.08
HS3ST3B1-202ENST00000466596 SLC6A14Q9UN76 642 aa14.56□□□□□ -0.08
HS3ST3B1-202ENST00000466596 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa14.56□□□□□ -0.08
HS3ST3B1-202ENST00000466596 PRSS21Q9Y6M0 314 aa14.56□□□□□ -0.08
HS3ST3B1-202ENST00000466596 CLDN24A6NM45 220 aa14.56□□□□□ -0.08
HS3ST3B1-202ENST00000466596 DRGXA6NNA5 263 aa14.56□□□□□ -0.08
HS3ST3B1-202ENST00000466596 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
HS3ST3B1-202ENST00000466596 EPOP01588 193 aa14.56□□□□□ -0.08
HS3ST3B1-202ENST00000466596 ATF6P18850 670 aa14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.5 ms