RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462743.1

HPS1-206, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene HPS1, Length 431 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-206ENST00000462743 CDKL4Q5MAI5 379 aa11.6□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 ICE2Q659A1 982 aa11.6□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 SUSD1Q6UWL2 747 aa11.6□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 RNF44Q7L0R7 432 aa11.6□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 TAX1BP1Q86VP1 789 aa11.6□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 TMEM126BQ8IUX1 230 aa11.6□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 GPR135Q8IZ08 494 aa11.6□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 OR56A3Q8NH54 315 aa11.6□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 ANKRD49Q8WVL7 239 aa11.6□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 FBXL8Q96CD0 374 aa11.6□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 MIPEPQ99797 713 aa11.6□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 PLCD4Q9BRC7 762 aa11.6□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 DPH7Q9BTV6 452 aa11.6□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 TXLNGYQ9BZA5 131 aa11.6□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 TMEM184CQ9NVA4 438 aa11.6□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 IKZF3Q9UKT9 509 aa11.6□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 NFU1Q9UMS0 254 aa11.6□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 KLHL20Q9Y2M5 609 aa11.6□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa11.59□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 CCDC189A1A4V9 331 aa11.59□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 HMX2A2RU54 273 aa11.59□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 FITM1A5D6W6 292 aa11.59□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 C21orf140B9A014 251 aa11.59□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 MEN1O00255 615 aa11.59□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 ZNF749O43361 778 aa11.59□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 CTSVO60911 334 aa11.59□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 OR2B3O76000 313 aa11.59□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 SYF2O95926 243 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 ABHD2P08910 425 aa11.59□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 RAB40ALP0C0E4 278 aa11.59□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 LIFP15018 202 aa11.59□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 NPPBP16860 134 aa11.59□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 WT1P19544 449 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 SAT1P21673 171 aa11.59□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 PSMB5P28074 263 aa11.59□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 CRABP2P29373 138 aa11.59□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 ARSFP54793 590 aa11.59□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 EMP3P54852 163 aa11.59□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 RAB10P61026 200 aa11.59□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 GPS2Q13227 327 aa11.59□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 NAE1Q13564 534 aa11.59□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 PPP1R3AQ16821 1122 aa11.59□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 RHBDD2Q6NTF9 364 aa11.59□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 LCTLQ6UWM7 567 aa11.59□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa11.59□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 VASH2Q86V25 355 aa11.59□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 PAQR7Q86WK9 346 aa11.59□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa11.59□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 DSELQ8IZU8 1212 aa11.59□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 CNPY4Q8N129 248 aa11.59□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa11.59□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 SLC44A1Q8WWI5 657 aa11.59□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP11.59□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 WBP1Q96G27 269 aa11.59□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 ACAT2Q9BWD1 397 aa11.59□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 GPR87Q9BY21 358 aa11.59□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 CAB39LQ9H9S4 337 aa11.59□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 CPNE5Q9HCH3 593 aa11.59□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 SLC6A20Q9NP91 592 aa11.59□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 PCMTD2Q9NV79 361 aa11.59□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa11.59□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 TAC3Q9UHF0 121 aa11.59□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 KCND3Q9UK17 655 aa11.59□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 ZFHX4Q86UP3 3567 aa11.59□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 LAMA5O15230 3695 aa11.58□□□□□ -0.55
HPS1-206ENST00000462743 MED13Q9UHV7 2174 aa11.58□□□□□ -0.56
HPS1-206ENST00000462743 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa11.58□□□□□ -0.56
HPS1-206ENST00000462743 CDC7O00311 574 aa11.58□□□□□ -0.56
HPS1-206ENST00000462743 FAM155BO75949 473 aa11.58□□□□□ -0.56
HPS1-206ENST00000462743 CAPN1P07384 714 aa11.58□□□□□ -0.56
HPS1-206ENST00000462743 RHOXF2BP0C7M4 288 aa11.58□□□□□ -0.56
HPS1-206ENST00000462743 CCDC166P0CW27 439 aa11.58□□□□□ -0.56
HPS1-206ENST00000462743 CD1DP15813 335 aa11.58□□□□□ -0.56
HPS1-206ENST00000462743 TCN2P20062 427 aa11.58□□□□□ -0.56
HPS1-206ENST00000462743 F8A1P23610 371 aa11.58□□□□□ -0.56
HPS1-206ENST00000462743 TNFRSF8P28908 595 aa11.58□□□□□ -0.56
HPS1-206ENST00000462743 HNMTP50135 292 aa11.58□□□□□ -0.56
HPS1-206ENST00000462743 CXADRP78310 365 aa11.58□□□□□ -0.56
HPS1-206ENST00000462743 MC1RQ01726 317 aa11.58□□□□□ -0.56
HPS1-206ENST00000462743 RHDQ02161 417 aa11.58□□□□□ -0.56
HPS1-206ENST00000462743 DNASE1L3Q13609 305 aa11.58□□□□□ -0.56
HPS1-206ENST00000462743 ZNF460Q14592 562 aa11.58□□□□□ -0.56
HPS1-206ENST00000462743 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa11.58□□□□□ -0.56
HPS1-206ENST00000462743 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP11.58□□□□□ -0.56
HPS1-206ENST00000462743 PPFIBP2Q8ND30 876 aa11.58□□□□□ -0.56
HPS1-206ENST00000462743 LRRN4CLQ8ND94 238 aa11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.5 ms