RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460766.5

IMP4-208, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene IMP4, Length 2,379 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-208ENST00000460766 GALNT10Q86SR1 603 aa19.87■□□□□ 0.77
IMP4-208ENST00000460766 TANKQ92844 425 aa19.87■□□□□ 0.77
IMP4-208ENST00000460766 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa19.87■□□□□ 0.77
IMP4-208ENST00000460766 SLC46A2Q9BY10 475 aa19.87■□□□□ 0.77
IMP4-208ENST00000460766 ABCG2Q9UNQ0 655 aa19.87■□□□□ 0.77
IMP4-208ENST00000460766 CCL26Q9Y258 94 aa19.87■□□□□ 0.77
IMP4-208ENST00000460766 MYO1GB0I1T2 1018 aa19.86■□□□□ 0.77
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IMP4-208ENST00000460766 SLC1A7O00341 560 aa19.86■□□□□ 0.77
IMP4-208ENST00000460766 BCL10O95999 233 aa19.86■□□□□ 0.77
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IMP4-208ENST00000460766 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa19.86■□□□□ 0.77
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IMP4-208ENST00000460766 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP19.86■□□□□ 0.77
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IMP4-208ENST00000460766 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP19.85■□□□□ 0.77
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IMP4-208ENST00000460766 hCG_2039718K7EN88 272 aa19.85■□□□□ 0.77
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IMP4-208ENST00000460766 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa19.84■□□□□ 0.77
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IMP4-208ENST00000460766 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP19.84■□□□□ 0.77
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IMP4-208ENST00000460766 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP19.84■□□□□ 0.77
IMP4-208ENST00000460766 IL1RAPQ9NPH3 570 aa19.84■□□□□ 0.77
IMP4-208ENST00000460766 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP19.84■□□□□ 0.77
IMP4-208ENST00000460766 VPS29Q9UBQ0 182 aa19.84■□□□□ 0.77
IMP4-208ENST00000460766 FBXO10Q9UK96 956 aa19.84■□□□□ 0.77
IMP4-208ENST00000460766 MAGEB17A8MXT2 336 aa19.84■□□□□ 0.77
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