RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459758.5

TTLL3-222, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 555 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-222	ENST00000459758	CPPED1	Q9BRF8	314 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	PCBD2	Q9H0N5	130 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	RPF2	Q9H7B2	306 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	KAT8	Q9H7Z6	458 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	CAAP1	Q9H8G2	361 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	SFXN1	Q9H9B4	322 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	TIMMDC1	Q9NPL8	285 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	DCAF13	Q9NV06	445 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	SPATA6	Q9NWH7	488 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	WBP1L	Q9NX94	342 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	USE1	Q9NZ43	259 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	GDE1	Q9NZC3	331 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	AHSP	Q9NZD4	102 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	VAPA	Q9P0L0	249 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	LIMD1	Q9UGP4	676 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	BTNL2	Q9UIR0	455 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	SLC22A14	Q9Y267	594 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	FADS3	Q9Y5Q0	445 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	WNT6	Q9Y6F9	365 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	TCF20	Q9UGU0	1960 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758		A0A0U1RQS6	177 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	TRIM64C	A6NLI5	447 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	TTC34	A8MYJ7	566 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758		C9JVG2	144 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758		G3V2T6	193 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	FOXE1	O00358	373 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	KPNA3	O00505	521 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	PI15	O43692	258 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	LZTS3	O60299	673 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	PGM3	O95394	542 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	CST1	P01037	141 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	CYP17A1	P05093	508 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	TFAP2A	P05549	437 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	CISD3	P0C7P0	127 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	CKMT2	P17540	419 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	SDC1	P18827	310 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	CXCR2	P25025	360 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	OXTR	P30559	389 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	ETV3	P41162	512 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	EIF2D	P41214	584 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	MTHFR	P42898	656 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	DGKQ	P52824	942 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	ARSF	P54793	590 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	MTPN	P58546	118 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	PFN3	P60673	137 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	VEZF1	Q14119	521 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	GK3P	Q14409	553 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	ARHGAP19	Q14CB8	494 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	EML3	Q32P44	896 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	HNRNPA1L2	Q32P51	320 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	LARP7	Q4G0J3	582 aa	Known RBP eCLIP	11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	TMEM240	Q5SV17	173 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	CCNYL2	Q5T2Q4	361 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	GPR141	Q7Z602	305 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	GRASP	Q7Z6J2	395 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	CALHM3	Q86XJ0	350 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	CPA6	Q8N4T0	437 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	FAM47B	Q8NA70	645 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	SETD9	Q8NE22	299 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	OR10A6	Q8NH74	314 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	OR5K1	Q8NHB7	308 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF420	Q8TAQ5	688 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	CYGB	Q8WWM9	190 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	SMG7	Q92540	1137 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	FIG4	Q92562	907 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	HHIP	Q96QV1	700 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	SEPHS2	Q99611	448 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	CDCA3	Q99618	268 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	SLC29A1	Q99808	456 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	PAIP1	Q9H074	479 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	SGK2	Q9HBY8	427 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	TRIM39	Q9HCM9	518 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	HPS4	Q9NQG7	708 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	STOX2	Q9P2F5	926 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF282	Q9UDV7	671 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNHIT2	Q9UHR6	403 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	CD84	Q9UIB8	345 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	PCDHGB4	Q9UN71	923 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	AK5	Q9Y6K8	562 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	MGAT4D	A6NG13	374 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	TRIM64	A6NGJ6	449 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	ARHGEF33	A8MVX0	844 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	MAGEB17	A8MXT2	336 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	EI24	O14681	340 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	TSPAN6	O43657	245 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	KDM1A	O60341	852 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	DFNA5	O60443	496 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	TPST1	O60507	370 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	DPM1	O60762	260 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	KCNJ13	O60928	360 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	CREG1	O75629	220 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	RFPL2	O75678	378 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	FKBP9	O95302	570 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	THRB	P10828	461 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	COX7A2	P14406	83 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	ATP6V1B1	P15313	513 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	NCK1	P16333	377 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	EPOR	P19235	508 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	PTX3	P26022	381 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	TEAD1	P28347	426 aa		11.16	□□□□□ -0.62

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