RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 A0A1B0GUH1 482 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 SMAPO00193 183 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 ERLIN1O75477 346 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 OR2B3O76000 313 aa11.23□□□□□ -0.61
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PRAME-210ENST00000442481 FAM153CQ494X1 144 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa11.23□□□□□ -0.61
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PRAME-210ENST00000442481 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
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PRAME-210ENST00000442481 P4HTMQ9NXG6 502 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 CRYL1Q9Y2S2 319 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 MAGEB16A2A368 324 aa11.22□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 CCDC151A5D8V7 595 aa11.22□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 E5RI56 91 aa11.22□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 SPTBP11277 2137 aa11.22□□□□□ -0.61
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PRAME-210ENST00000442481 PGAM1P18669 254 aa11.22□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 OGNP20774 298 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
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PRAME-210ENST00000442481 ARL4CP56559 192 aa11.22□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 HIF1AQ16665 826 aa11.22□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 LONRF1Q17RB8 773 aa11.22□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 ZNF789Q5FWF6 425 aa11.22□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa11.22□□□□□ -0.61
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PRAME-210ENST00000442481 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa11.22□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 TLDC1Q6P9B6 456 aa11.22□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 CENPUQ71F23 418 aa11.22□□□□□ -0.61
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PRAME-210ENST00000442481 AMIGO1Q86WK6 493 aa11.22□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP11.22□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP11.22□□□□□ -0.613e-8■■■□□ 17.3
PRAME-210ENST00000442481 OR52E1Q8NGJ3 308 aa11.22□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP11.22□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 DLG3Q92796 817 aa11.22□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 PCSK5Q92824 1860 aa11.22□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 AGAP4Q96P64 663 aa11.22□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 GBP5Q96PP8 586 aa11.22□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa11.22□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 NRTNQ99748 197 aa11.22□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa11.22□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 EPS8L2Q9H6S3 715 aa11.22□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 SAYSD1Q9NPB0 183 aa11.22□□□□□ -0.61
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PRAME-210ENST00000442481 AGPSO00116 658 aa11.21□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
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PRAME-210ENST00000442481 USP1O94782 785 aa11.21□□□□□ -0.61
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PRAME-210ENST00000442481 ITGAXP20702 1163 aa11.21□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP11.21□□□□□ -0.615e-44■■■□□ 15.1
PRAME-210ENST00000442481 SHMT2P34897 504 aa11.21□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 MAGEA3P43357 314 aa11.21□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 TSFMP43897 325 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 CTBP1Q13363 440 aa11.21□□□□□ -0.61
PRAME-210ENST00000442481 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
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