RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430930.5

TNS1-207, Transcript of tensin 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNS1, Length 5,900 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-207ENST00000430930 PRAMEF10O60809 474 aa12.79□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 PFKMP08237 780 aa12.79□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 AHCYP23526 432 aa12.79□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 MAGEA11P43364 429 aa12.79□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 SMSP52788 366 aa12.79□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 CRB2Q5IJ48 1285 aa12.79□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 ZBTB46Q86UZ6 589 aa12.79□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 GRPEL2Q8TAA5 225 aa12.79□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 KCTD7Q96MP8 289 aa12.79□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 HBEGFQ99075 208 aa12.79□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa12.79□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 PHF24Q9UPV7 400 aa12.79□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 PIK3C2AO00443 1686 aa12.79□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 MANBAO00462 879 aa12.78□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 EBLN1P0CF75 366 aa12.78□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 FOXN2P32314 431 aa12.78□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 TSPAN5P62079 268 aa12.78□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 CHRNA6Q15825 494 aa12.78□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 OLFML1Q6UWY5 402 aa12.78□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa12.78□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 CERS4Q9HA82 394 aa12.78□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 SDHAF3Q9NRP4 125 aa12.78□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 AASSQ9UDR5 926 aa12.78□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP12.78□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 M0R2N6 131 aa12.78□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP12.78□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 H1F0P07305 194 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 ACTR1BP42025 376 aa12.78□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 ACTR1AP61163 376 aa12.78□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 RPS24P62847 133 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 RAB30Q15771 203 aa12.78□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP12.78□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 DCAF12L1Q5VU92 463 aa12.78□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP12.78□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa12.78□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa12.78□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 SETD6Q8TBK2 473 aa12.78□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 EBF4Q9BQW3 602 aa12.78□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa12.78□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 MATN2O00339 956 aa12.78□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 OAS1P00973 400 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 SEMA3AQ14563 771 aa12.78□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 SATL1Q86VE3 508 aa12.78□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 TMEM17Q86X19 198 aa12.78□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 LGI4Q8N135 537 aa12.78□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP12.78□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 PMEPA1Q969W9 287 aa12.78□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 SHDQ96IW2 340 aa12.78□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 DPYSL5Q9BPU6 564 aa12.78□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 GIN1Q9NXP7 522 aa12.78□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 ZNF726A6NNF4 738 aa12.78□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 C9J4A7 227 aa12.78□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 SERINC3Q13530 473 aa12.78□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 ENPP2Q13822 863 aa12.78□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 GPR153Q6NV75 609 aa12.78□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 ZNF783Q6ZMS7 281 aa12.78□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 OR2L3Q8NG85 312 aa12.78□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 SLC22A4Q9H015 551 aa12.78□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 RNF121Q9H920 327 aa12.78□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP12.78□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 LTN1O94822 1766 aa12.78□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 PEPDP12955 493 aa12.78□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 ACP5P13686 325 aa12.78□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 ECHS1P30084 290 aa12.78□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 MXD1Q05195 221 aa12.78□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 INCA1Q0VD86 236 aa12.78□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 UBXN2BQ14CS0 331 aa12.78□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 EPGNQ6UW88 154 aa12.78□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 TPRG1Q6ZUI0 275 aa12.78□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa12.78□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 TP53INP1Q96A56 240 aa12.78□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 MOAP1Q96BY2 351 aa12.78□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP12.78□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 SYT17Q9BSW7 474 aa12.78□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP12.78□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 TAS2R1Q9NYW7 299 aa12.78□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 NR2E1Q9Y466 385 aa12.78□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 WASHC1A8K0Z3 465 aa12.77□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 WASH3PC4AMC7 463 aa12.77□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 NDUFS4O43181 175 aa12.77□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 ENTPD6O75354 484 aa12.77□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 ADH1BP00325 375 aa12.77□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 MAP3K8P41279 467 aa12.77□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 DNAJB13P59910 316 aa12.77□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 VLDLRP98155 873 aa12.77□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 GANABQ14697 944 aaKnown RBP12.77□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP12.77□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP12.77□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 WASH2PQ6VEQ5 465 aa12.77□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 SUN3Q8TAQ9 357 aa12.77□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 PNPLA2Q96AD5 504 aa12.77□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 HSD3B7Q9H2F3 369 aa12.77□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 PRDM4Q9UKN5 801 aa12.77□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP12.77□□□□□ -0.36
TNS1-207ENST00000430930 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa12.77□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50 ms