RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa20.04■□□□□ 0.8
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LIMS1-208ENST00000428064 GOLGA8TH3BQL2 631 aa20.04■□□□□ 0.8
LIMS1-208ENST00000428064 MASP2O00187 686 aa20.04■□□□□ 0.8
LIMS1-208ENST00000428064 CBX6O95503 412 aa20.04■□□□□ 0.8
LIMS1-208ENST00000428064 PKMP14618 531 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
LIMS1-208ENST00000428064 CHRM3P20309 590 aa20.04■□□□□ 0.8
LIMS1-208ENST00000428064 HSD17B2P37059 387 aa20.04■□□□□ 0.8
LIMS1-208ENST00000428064 OR1D4P47884 311 aa20.04■□□□□ 0.8
LIMS1-208ENST00000428064 CARSP49589 748 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
LIMS1-208ENST00000428064 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
LIMS1-208ENST00000428064 ESPL1Q14674 2120 aa20.04■□□□□ 0.8
LIMS1-208ENST00000428064 CENPUQ71F23 418 aa20.04■□□□□ 0.8
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LIMS1-208ENST00000428064 SMPDL3AQ92484 453 aa20.04■□□□□ 0.8
LIMS1-208ENST00000428064 MVB12AQ96EY5 273 aa20.04■□□□□ 0.8
LIMS1-208ENST00000428064 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
LIMS1-208ENST00000428064 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
LIMS1-208ENST00000428064 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
LIMS1-208ENST00000428064 MAP10Q9P2G4 905 aa20.04■□□□□ 0.8
LIMS1-208ENST00000428064 CRYL1Q9Y2S2 319 aa20.04■□□□□ 0.8
LIMS1-208ENST00000428064 A0A0J9YVX5 310 aa20.03■□□□□ 0.8
LIMS1-208ENST00000428064 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa20.03■□□□□ 0.8
LIMS1-208ENST00000428064 MAGEB16A2A368 324 aa20.03■□□□□ 0.8
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF839A8K0R7 811 aa20.03■□□□□ 0.8
LIMS1-208ENST00000428064 ARHGEF33A8MVX0 844 aa20.03■□□□□ 0.8
LIMS1-208ENST00000428064 E5RI56 91 aa20.03■□□□□ 0.8
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LIMS1-208ENST00000428064 VPS26AO75436 327 aa20.03■□□□□ 0.8
LIMS1-208ENST00000428064 MED26O95402 600 aa20.03■□□□□ 0.8
LIMS1-208ENST00000428064 CATP04040 527 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
LIMS1-208ENST00000428064 RELAQ04206 551 aa20.03■□□□□ 0.8
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LIMS1-208ENST00000428064 RBBP7Q16576 425 aa20.03■□□□□ 0.8
LIMS1-208ENST00000428064 MUM1Q2TAK8 710 aa20.03■□□□□ 0.8
LIMS1-208ENST00000428064 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
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LIMS1-208ENST00000428064 KLHL38Q2WGJ6 581 aa20.03■□□□□ 0.8
LIMS1-208ENST00000428064 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa20.03■□□□□ 0.8
LIMS1-208ENST00000428064 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa20.03■□□□□ 0.8
LIMS1-208ENST00000428064 NEPROQ6NW34 567 aa20.03■□□□□ 0.8
LIMS1-208ENST00000428064 CUZD1Q86UP6 607 aa20.03■□□□□ 0.8
LIMS1-208ENST00000428064 LRRC8AQ8IWT6 810 aa20.03■□□□□ 0.8
LIMS1-208ENST00000428064 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
LIMS1-208ENST00000428064 OR11G2Q8NGC1 345 aa20.03■□□□□ 0.8
LIMS1-208ENST00000428064 AGAP4Q96P64 663 aa20.03■□□□□ 0.8
LIMS1-208ENST00000428064 PLCD4Q9BRC7 762 aa20.03■□□□□ 0.8
LIMS1-208ENST00000428064 DPH7Q9BTV6 452 aa20.03■□□□□ 0.8
LIMS1-208ENST00000428064 LHPPQ9H008 270 aa20.03■□□□□ 0.8
LIMS1-208ENST00000428064 SAMD15Q9P1V8 674 aa20.03■□□□□ 0.8
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
LIMS1-208ENST00000428064 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
LIMS1-208ENST00000428064 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
LIMS1-208ENST00000428064 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa20.02■□□□□ 0.8
LIMS1-208ENST00000428064 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa20.02■□□□□ 0.8
LIMS1-208ENST00000428064 AVILO75366 819 aa20.02■□□□□ 0.8
LIMS1-208ENST00000428064 CXCR5P32302 372 aa20.02■□□□□ 0.8
LIMS1-208ENST00000428064 CLCN7P51798 805 aa20.02■□□□□ 0.8
LIMS1-208ENST00000428064 OCA2Q04671 838 aa20.02■□□□□ 0.8
LIMS1-208ENST00000428064 NR6A1Q15406 480 aa20.02■□□□□ 0.8
LIMS1-208ENST00000428064 TTLL9Q3SXZ7 439 aa20.02■□□□□ 0.8
LIMS1-208ENST00000428064 ACSBG2Q5FVE4 666 aa20.02■□□□□ 0.8
LIMS1-208ENST00000428064 FBXO42Q6P3S6 717 aa20.02■□□□□ 0.8
LIMS1-208ENST00000428064 OR4N4Q8N0Y3 316 aa20.02■□□□□ 0.8
LIMS1-208ENST00000428064 RASGEF1CQ8N431 466 aa20.02■□□□□ 0.8
LIMS1-208ENST00000428064 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
LIMS1-208ENST00000428064 MCUQ8NE86 351 aa20.02■□□□□ 0.8
LIMS1-208ENST00000428064 STT3BQ8TCJ2 826 aa20.02■□□□□ 0.8
LIMS1-208ENST00000428064 KCNJ9Q92806 393 aa20.02■□□□□ 0.8
LIMS1-208ENST00000428064 C10orf90Q96M02 699 aa20.02■□□□□ 0.8
LIMS1-208ENST00000428064 CRB3Q9BUF7 120 aa20.02■□□□□ 0.8
LIMS1-208ENST00000428064 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
LIMS1-208ENST00000428064 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
LIMS1-208ENST00000428064 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
LIMS1-208ENST00000428064 GALPQ9UBC7 116 aa20.02■□□□□ 0.8
LIMS1-208ENST00000428064 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
LIMS1-208ENST00000428064 MAU2Q9Y6X3 613 aa20.02■□□□□ 0.8
LIMS1-208ENST00000428064 A0A1W2PQ72 361 aa20.01■□□□□ 0.79
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LIMS1-208ENST00000428064 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP20.01■□□□□ 0.79
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LIMS1-208ENST00000428064 RNF224P0DH78 156 aa20.01■□□□□ 0.79
LIMS1-208ENST00000428064 ERVK-10P10266 1014 aa20.01■□□□□ 0.79
LIMS1-208ENST00000428064 YBX1P67809 324 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
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LIMS1-208ENST00000428064 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
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LIMS1-208ENST00000428064 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
LIMS1-208ENST00000428064 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
LIMS1-208ENST00000428064 C4orf17Q53FE4 359 aa20.01■□□□□ 0.79
LIMS1-208ENST00000428064 ANKRD22Q5VYY1 191 aa20.01■□□□□ 0.79
LIMS1-208ENST00000428064 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF470Q6ECI4 717 aa20.01■□□□□ 0.79
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF425Q6IV72 752 aa20.01■□□□□ 0.79
LIMS1-208ENST00000428064 CASC4Q6P4E1 433 aa20.01■□□□□ 0.79
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