RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 MICAL3Q7RTP6 2002 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 C17orf102A2RUQ5 167 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 TOR1BO14657 336 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ACSL4O60488 711 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 IL6P05231 212 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 OCM2P0CE71 109 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 FMO4P31512 558 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 OCA2Q04671 838 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 RGS21Q2M5E4 152 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 RFX4Q33E94 735 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 RNLSQ5VYX0 342 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 RFLNAQ6ZTI6 216 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 OR56A4Q8NGH8 313 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 HASPINQ8TF76 798 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 LINGO1Q96FE5 620 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 WDFY2Q96P53 400 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 GPRC5BQ9NZH0 403 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 NBNO60934 754 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 EBLN1P0CF75 366 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 NPRL3Q12980 569 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 SLAMF1Q13291 335 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 MIB1Q86YT6 1006 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 NXPE1Q8N323 547 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ARL10Q8N8L6 244 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 TRIM62Q9BVG3 475 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC25A19Q9HC21 320 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 DGKBQ9Y6T7 804 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 A0A075B6Q4 140 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 GLTPD2A6NH11 291 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 GPX5O75715 221 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 LGI1O95970 557 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 HLA-DQB1P01920 261 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 MSH3P20585 1137 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 LPOP22079 712 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 IDSP22304 550 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 KCNK10P57789 538 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 OR2T5Q6IEZ7 315 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 KLHL17Q6TDP4 642 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 VRK3Q8IV63 474 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 TERB1Q8NA31 727 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 OR2T29Q8NH02 315 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ITFG1Q8TB96 612 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 TTPALQ9BTX7 342 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 SYNPO2LQ9H987 977 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 SACM1LQ9NTJ5 587 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ELOVL7A1L3X0 281 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM88BA6NKF7 163 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ERVH48-1M5A8F1 160 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 PAMP19021 973 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 MTHFRP42898 656 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 IL2P60568 153 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 DNASE1L3Q13609 305 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 NR2C2APQ86WQ0 139 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 DDHD1Q8NEL9 900 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 METTL6Q8TCB7 284 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 GPR152Q8TDT2 470 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 MYO19Q96H55 970 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 OPALINQ96PE5 141 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ZIC5Q96T25 663 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 CENPOQ9BU64 300 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 COMMD8Q9NX08 183 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 HELZP42694 1942 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 SZT2Q5T011 3432 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 CKAP5Q14008 2032 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 MAN1A2O60476 641 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 SUPT3HO75486 399 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 SOD1P00441 154 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 BPIP17213 487 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 DDX5P17844 614 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 GNPDA1P46926 289 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 NEK2P51955 445 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 PRKCDQ05655 676 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 EFEMP1Q12805 493 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 CERS6Q6ZMG9 384 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 TAS1R1Q7RTX1 841 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa3.51□□□□□ -1.85
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