RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416322.5

CLDN12-204, Transcript of claudin 12, humanhuman

TSL 5

Gene CLDN12, Length 1,163 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN12-204ENST00000416322 PTPN4P29074 926 aa9.29□□□□□ -0.92
CLDN12-204ENST00000416322 SOX11P35716 441 aa9.29□□□□□ -0.92
CLDN12-204ENST00000416322 CDKN2DP55273 166 aa9.29□□□□□ -0.92
CLDN12-204ENST00000416322 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
CLDN12-204ENST00000416322 GRB7Q14451 532 aa9.29□□□□□ -0.92
CLDN12-204ENST00000416322 SLC9A5Q14940 896 aa9.29□□□□□ -0.92
CLDN12-204ENST00000416322 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
CLDN12-204ENST00000416322 OR2L3Q8NG85 312 aa9.29□□□□□ -0.92
CLDN12-204ENST00000416322 DENND1AQ8TEH3 1009 aa9.29□□□□□ -0.92
CLDN12-204ENST00000416322 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
CLDN12-204ENST00000416322 ASB11Q8WXH4 323 aa9.29□□□□□ -0.92
CLDN12-204ENST00000416322 DLG3Q92796 817 aa9.29□□□□□ -0.92
CLDN12-204ENST00000416322 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
CLDN12-204ENST00000416322 RUFY1Q96T51 708 aa9.29□□□□□ -0.92
CLDN12-204ENST00000416322 DPH7Q9BTV6 452 aa9.29□□□□□ -0.92
CLDN12-204ENST00000416322 YIPF2Q9BWQ6 316 aa9.29□□□□□ -0.92
CLDN12-204ENST00000416322 GPR87Q9BY21 358 aa9.29□□□□□ -0.92
CLDN12-204ENST00000416322 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
CLDN12-204ENST00000416322 STARD5Q9NSY2 213 aa9.29□□□□□ -0.92
CLDN12-204ENST00000416322 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
CLDN12-204ENST00000416322 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
CLDN12-204ENST00000416322 SRPK3Q9UPE1 567 aa9.29□□□□□ -0.92
CLDN12-204ENST00000416322 POLHQ9Y253 713 aa9.29□□□□□ -0.92
CLDN12-204ENST00000416322 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
CLDN12-204ENST00000416322 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa9.29□□□□□ -0.92
CLDN12-204ENST00000416322 PADI2Q9Y2J8 665 aa9.29□□□□□ -0.92
CLDN12-204ENST00000416322 VWA7Q9Y334 891 aa9.29□□□□□ -0.92
CLDN12-204ENST00000416322 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa9.29□□□□□ -0.92
CLDN12-204ENST00000416322 BPTFQ12830 3046 aa9.28□□□□□ -0.92
CLDN12-204ENST00000416322 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa9.28□□□□□ -0.92
CLDN12-204ENST00000416322 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa9.28□□□□□ -0.92
CLDN12-204ENST00000416322 ESYT3A0FGR9 886 aa9.28□□□□□ -0.92
CLDN12-204ENST00000416322 CTAGE15A4D2H0 777 aa9.28□□□□□ -0.92
CLDN12-204ENST00000416322 RNF223E7ERA6 249 aa9.28□□□□□ -0.92
CLDN12-204ENST00000416322 MYO1CO00159 1063 aa9.28□□□□□ -0.92
CLDN12-204ENST00000416322 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP9.28□□□□□ -0.92
CLDN12-204ENST00000416322 PIAS1O75925 651 aa9.28□□□□□ -0.92
CLDN12-204ENST00000416322 GUCA1CO95843 209 aa9.28□□□□□ -0.92
CLDN12-204ENST00000416322 CTAGE8P0CG41 777 aa9.28□□□□□ -0.92
CLDN12-204ENST00000416322 SFTPCP11686 197 aa9.28□□□□□ -0.92
CLDN12-204ENST00000416322 SSTR1P30872 391 aa9.28□□□□□ -0.92
CLDN12-204ENST00000416322 ARSFP54793 590 aa9.28□□□□□ -0.92
CLDN12-204ENST00000416322 DCDP81605 110 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
CLDN12-204ENST00000416322 GUCY2DQ02846 1103 aa9.28□□□□□ -0.92
CLDN12-204ENST00000416322 NFATC3Q12968 1075 aa9.28□□□□□ -0.92
CLDN12-204ENST00000416322 GBX1Q14549 363 aa9.28□□□□□ -0.92
CLDN12-204ENST00000416322 GRM7Q14831 915 aa9.28□□□□□ -0.92
CLDN12-204ENST00000416322 ARHGAP19Q14CB8 494 aa9.28□□□□□ -0.92
CLDN12-204ENST00000416322 CYP2A13Q16696 494 aa9.28□□□□□ -0.92
CLDN12-204ENST00000416322 TCTE1Q5JU00 501 aa9.28□□□□□ -0.92
CLDN12-204ENST00000416322 STEAP4Q687X5 459 aa9.28□□□□□ -0.92
CLDN12-204ENST00000416322 DUPD1Q68J44 220 aa9.28□□□□□ -0.92
CLDN12-204ENST00000416322 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa9.28□□□□□ -0.92
CLDN12-204ENST00000416322 TTLL10Q6ZVT0 673 aa9.28□□□□□ -0.92
CLDN12-204ENST00000416322 FRA10AC1Q70Z53 315 aa9.28□□□□□ -0.92
CLDN12-204ENST00000416322 CTAGE6Q86UF2 777 aa9.28□□□□□ -0.92
CLDN12-204ENST00000416322 CNTN4Q8IWV2 1026 aa9.28□□□□□ -0.92
CLDN12-204ENST00000416322 CTAGE4Q8IX94 777 aa9.28□□□□□ -0.92
CLDN12-204ENST00000416322 DSELQ8IZU8 1212 aa9.28□□□□□ -0.92
CLDN12-204ENST00000416322 DNAJC22Q8N4W6 341 aa9.28□□□□□ -0.92
CLDN12-204ENST00000416322 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
CLDN12-204ENST00000416322 SLC38A9Q8NBW4 561 aa9.28□□□□□ -0.92
CLDN12-204ENST00000416322 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa9.28□□□□□ -0.92
CLDN12-204ENST00000416322 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
CLDN12-204ENST00000416322 IFT81Q8WYA0 676 aa9.28□□□□□ -0.92
CLDN12-204ENST00000416322 SEC14L1Q92503 715 aa9.28□□□□□ -0.92
CLDN12-204ENST00000416322 TTC9Q92623 222 aa9.28□□□□□ -0.92
CLDN12-204ENST00000416322 ZUFSPQ96AP4 578 aa9.28□□□□□ -0.92
CLDN12-204ENST00000416322 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
CLDN12-204ENST00000416322 CABS1Q96KC9 395 aa9.28□□□□□ -0.92
CLDN12-204ENST00000416322 CCDC138Q96M89 665 aa9.28□□□□□ -0.92
CLDN12-204ENST00000416322 EGFL8Q99944 293 aa9.28□□□□□ -0.92
CLDN12-204ENST00000416322 C17orf62Q9BQA9 187 aa9.28□□□□□ -0.92
CLDN12-204ENST00000416322 ATG10Q9H0Y0 220 aa9.28□□□□□ -0.92
CLDN12-204ENST00000416322 PARVBQ9HBI1 364 aa9.28□□□□□ -0.92
CLDN12-204ENST00000416322 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
CLDN12-204ENST00000416322 PCMTD2Q9NV79 361 aa9.28□□□□□ -0.92
CLDN12-204ENST00000416322 ARL15Q9NXU5 204 aa9.28□□□□□ -0.92
CLDN12-204ENST00000416322 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
CLDN12-204ENST00000416322 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
CLDN12-204ENST00000416322 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa9.28□□□□□ -0.92
CLDN12-204ENST00000416322 CHD6Q8TD26 2715 aa9.28□□□□□ -0.92
CLDN12-204ENST00000416322 CACNA1GO43497 2377 aa9.28□□□□□ -0.92
CLDN12-204ENST00000416322 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa9.27□□□□□ -0.92
CLDN12-204ENST00000416322 SDK2Q58EX2 2172 aa9.27□□□□□ -0.92
CLDN12-204ENST00000416322 TARM1B6A8C7 271 aa9.27□□□□□ -0.93
CLDN12-204ENST00000416322 E7ESA3 106 aa9.27□□□□□ -0.93
CLDN12-204ENST00000416322 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
CLDN12-204ENST00000416322 HCRTR1O43613 425 aa9.27□□□□□ -0.93
CLDN12-204ENST00000416322 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
CLDN12-204ENST00000416322 GABRB3P28472 473 aa9.27□□□□□ -0.93
CLDN12-204ENST00000416322 OTX2P32243 289 aa9.27□□□□□ -0.93
CLDN12-204ENST00000416322 MAGEA4P43358 317 aa9.27□□□□□ -0.93
CLDN12-204ENST00000416322 PGGT1BP53609 377 aa9.27□□□□□ -0.93
CLDN12-204ENST00000416322 POLE2P56282 527 aa9.27□□□□□ -0.93
CLDN12-204ENST00000416322 SP140Q13342 867 aa9.27□□□□□ -0.93
CLDN12-204ENST00000416322 NAE1Q13564 534 aa9.27□□□□□ -0.93
CLDN12-204ENST00000416322 USP10Q14694 798 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
CLDN12-204ENST00000416322 SLMAPQ14BN4 828 aa9.27□□□□□ -0.93
CLDN12-204ENST00000416322 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.6 ms