RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411000.1

RNU6-172P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 172, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-172P, Length 93 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-172P-201ENST00000411000 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 C2orf66Q6UXQ4 117 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 UNC5DQ6UXZ4 953 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 DET1Q7L5Y6 550 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 MIER2Q8N344 545 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZBTB2Q8N680 514 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 ANKRD42Q8N9B4 389 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 RAET1EQ8TD07 263 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 TSKUQ8WUA8 353 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 STARD8Q92502 1023 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 KCNJ9Q92806 393 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 NINJ1Q92982 152 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 FBXL8Q96CD0 374 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM218AQ96MZ4 157 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 PLEKHF1Q96S99 279 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 EYA3Q99504 573 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 MXRA8Q9BRK3 442 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 THAP2Q9H0W7 228 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 AS3MTQ9HBK9 375 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 G6PC2Q9NQR9 355 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 SACM1LQ9NTJ5 587 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 STK32BQ9NY57 414 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 CDH9Q9ULB4 789 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 CACNA1AO00555 2505 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 PPIAL4EA0A075B759 164 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 A8MUU9 505 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 ISM1B1AKI9 464 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 PPIAL4DF5H284 164 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 E2F3O00716 465 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 WDR46O15213 610 aaKnown RBP-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 SOCS1O15524 211 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 PCDHGA12O60330 932 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 GLRA3O75311 464 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 TAF5LO75529 589 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 KRT38O76015 456 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 FSTL3O95633 263 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 ADAP00813 363 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 ADORA3P0DMS8 318 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 PPIAL4FP0DN26 164 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 THRBP10828 461 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 ETFAP13804 333 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 SELEP16581 610 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 PTPN2P17706 415 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 AGAP20933 346 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 VAMP1P23763 118 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLC7A1P30825 629 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 SHMT1P34896 483 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 GJC1P36383 396 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLC1A4P43007 532 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 NSFP46459 744 aaKnown RBP-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 BRCC3P46736 316 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 VCPP55072 806 aaKnown RBP-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 SQSTM1Q13501 440 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 ITPK1Q13572 414 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 FBXO43Q4G163 708 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 SBK1Q52WX2 424 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 RAP1GAP2Q684P5 730 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 PGM2L1Q6PCE3 622 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 TBC1D10CQ8IV04 446 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 NIM1KQ8IY84 436 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 CRYBG2Q8N1P7 616 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 PAF1Q8N7H5 531 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 L3MBTL4Q8NA19 623 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 ACBD4Q8NC06 268 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 NPEPL1Q8NDH3 523 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR5M8Q8NGP6 311 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 UBXN4Q92575 508 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 C11orf52Q96A22 123 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM20AQ96MK3 541 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 CASD1Q96PB1 797 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 PRAM1Q96QH2 718 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLC22A12Q96S37 553 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM167BQ9BTA0 163 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 TEKT3Q9BXF9 490 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 STRADBQ9C0K7 418 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 CPVLQ9H3G5 476 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 NDST4Q9H3R1 872 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 CUEDC2Q9H467 287 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 CCDC134Q9H6E4 229 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 PDE11AQ9HCR9 933 aa-1.29□□□□□ -2.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.4 ms