RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409435.5

SCN9A-202, Transcript of sodium voltage-gated channel alpha subunit 9, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene SCN9A, Length 5,967 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9A-202ENST00000409435 DRG2P55039 364 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
SCN9A-202ENST00000409435 ATAD3CQ5T2N8 411 aa7.13□□□□□ -1.27
SCN9A-202ENST00000409435 GPR107Q5VW38 600 aa7.13□□□□□ -1.27
SCN9A-202ENST00000409435 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
SCN9A-202ENST00000409435 SERPINA9Q86WD7 417 aa7.13□□□□□ -1.27
SCN9A-202ENST00000409435 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
SCN9A-202ENST00000409435 MCFD2Q8NI22 146 aa7.13□□□□□ -1.27
SCN9A-202ENST00000409435 STYXQ8WUJ0 223 aa7.13□□□□□ -1.27
SCN9A-202ENST00000409435 NSMCE2Q96MF7 247 aa7.13□□□□□ -1.27
SCN9A-202ENST00000409435 ZSWIM1Q9BR11 485 aa7.13□□□□□ -1.27
SCN9A-202ENST00000409435 RIBC2Q9H4K1 309 aa7.13□□□□□ -1.27
SCN9A-202ENST00000409435 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
SCN9A-202ENST00000409435 HCSTQ9UBK5 93 aa7.13□□□□□ -1.27
SCN9A-202ENST00000409435 ALG5Q9Y673 324 aa7.13□□□□□ -1.27
SCN9A-202ENST00000409435 CCDC187A0A096LP49 1063 aa7.12□□□□□ -1.27
SCN9A-202ENST00000409435 CIB4A0PJX0 185 aa7.12□□□□□ -1.27
SCN9A-202ENST00000409435 WASHC1A8K0Z3 465 aa7.12□□□□□ -1.27
SCN9A-202ENST00000409435 WASH3PC4AMC7 463 aa7.12□□□□□ -1.27
SCN9A-202ENST00000409435 KCNJ13O60928 360 aa7.12□□□□□ -1.27
SCN9A-202ENST00000409435 METTL18O95568 372 aa7.12□□□□□ -1.27
SCN9A-202ENST00000409435 MTM1Q13496 603 aa7.12□□□□□ -1.27
SCN9A-202ENST00000409435 VMACQ2NL98 169 aa7.12□□□□□ -1.27
SCN9A-202ENST00000409435 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SCN9A-202ENST00000409435 MROH9Q5TGP6 573 aa7.12□□□□□ -1.27
SCN9A-202ENST00000409435 TMEM198Q66K66 360 aa7.12□□□□□ -1.27
SCN9A-202ENST00000409435 FAM131AQ6UXB0 335 aa7.12□□□□□ -1.27
SCN9A-202ENST00000409435 WASH2PQ6VEQ5 465 aa7.12□□□□□ -1.27
SCN9A-202ENST00000409435 SLCO6A1Q86UG4 719 aa7.12□□□□□ -1.27
SCN9A-202ENST00000409435 HIPK1Q86Z02 1210 aa7.12□□□□□ -1.27
SCN9A-202ENST00000409435 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SCN9A-202ENST00000409435 SLC22A8Q8TCC7 542 aa7.12□□□□□ -1.27
SCN9A-202ENST00000409435 FUT8Q9BYC5 575 aa7.12□□□□□ -1.27
SCN9A-202ENST00000409435 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SCN9A-202ENST00000409435 PRDM6Q9NQX0 595 aa7.12□□□□□ -1.27
SCN9A-202ENST00000409435 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SCN9A-202ENST00000409435 PCDHGC3Q9UN70 934 aa7.12□□□□□ -1.27
SCN9A-202ENST00000409435 SRPK3Q9UPE1 567 aa7.12□□□□□ -1.27
SCN9A-202ENST00000409435 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SCN9A-202ENST00000409435 GLRA3O75311 464 aa7.12□□□□□ -1.27
SCN9A-202ENST00000409435 SNAPC5O75971 98 aa7.12□□□□□ -1.27
SCN9A-202ENST00000409435 HEXAP06865 529 aa7.12□□□□□ -1.27
SCN9A-202ENST00000409435 YES1P07947 543 aa7.12□□□□□ -1.27
SCN9A-202ENST00000409435 SPARCP09486 303 aa7.12□□□□□ -1.27
SCN9A-202ENST00000409435 ETS2P15036 469 aa7.12□□□□□ -1.27
SCN9A-202ENST00000409435 ITPKAP23677 461 aa7.12□□□□□ -1.27
SCN9A-202ENST00000409435 PDHA2P29803 388 aa7.12□□□□□ -1.27
SCN9A-202ENST00000409435 STK19P49842 368 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SCN9A-202ENST00000409435 SLC7A9P82251 487 aa7.12□□□□□ -1.27
SCN9A-202ENST00000409435 PTSQ03393 145 aa7.12□□□□□ -1.27
SCN9A-202ENST00000409435 C19orf57Q0VDD7 668 aa7.12□□□□□ -1.27
SCN9A-202ENST00000409435 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa7.12□□□□□ -1.27
SCN9A-202ENST00000409435 TCTE1Q5JU00 501 aa7.12□□□□□ -1.27
SCN9A-202ENST00000409435 C9orf64Q5T6V5 341 aa7.12□□□□□ -1.27
SCN9A-202ENST00000409435 OR5L2Q8NGL0 311 aa7.12□□□□□ -1.27
SCN9A-202ENST00000409435 OR10T2Q8NGX3 314 aa7.12□□□□□ -1.27
SCN9A-202ENST00000409435 ACTL9Q8TC94 416 aa7.12□□□□□ -1.27
SCN9A-202ENST00000409435 APOOQ9BUR5 198 aa7.12□□□□□ -1.27
SCN9A-202ENST00000409435 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa7.12□□□□□ -1.27
SCN9A-202ENST00000409435 ZNF350Q9GZX5 532 aa7.12□□□□□ -1.27
SCN9A-202ENST00000409435 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SCN9A-202ENST00000409435 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SCN9A-202ENST00000409435 HYKKA2RU49 373 aa7.12□□□□□ -1.27
SCN9A-202ENST00000409435 KLHL33A6NCF5 533 aa7.12□□□□□ -1.27
SCN9A-202ENST00000409435 M0QZQ0 153 aa7.12□□□□□ -1.27
SCN9A-202ENST00000409435 SERPINA3P01011 423 aa7.12□□□□□ -1.27
SCN9A-202ENST00000409435 YAP1P46937 504 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SCN9A-202ENST00000409435 FOXK2Q01167 660 aa7.12□□□□□ -1.27
SCN9A-202ENST00000409435 GRM7Q14831 915 aa7.12□□□□□ -1.27
SCN9A-202ENST00000409435 TLR1Q15399 786 aa7.12□□□□□ -1.27
SCN9A-202ENST00000409435 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SCN9A-202ENST00000409435 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SCN9A-202ENST00000409435 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa7.12□□□□□ -1.27
SCN9A-202ENST00000409435 OR4C6Q8NH72 309 aa7.12□□□□□ -1.27
SCN9A-202ENST00000409435 FIBINQ8TAL6 211 aa7.12□□□□□ -1.27
SCN9A-202ENST00000409435 STAG3L4Q8TBR4 150 aa7.12□□□□□ -1.27
SCN9A-202ENST00000409435 METTL6Q8TCB7 284 aa7.12□□□□□ -1.27
SCN9A-202ENST00000409435 ASB15Q8WXK1 588 aa7.12□□□□□ -1.27
SCN9A-202ENST00000409435 CLCC1Q96S66 551 aa7.12□□□□□ -1.27
SCN9A-202ENST00000409435 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa7.12□□□□□ -1.27
SCN9A-202ENST00000409435 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa7.12□□□□□ -1.27
SCN9A-202ENST00000409435 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa7.12□□□□□ -1.27
SCN9A-202ENST00000409435 A8MVJ9 347 aa7.12□□□□□ -1.27
SCN9A-202ENST00000409435 MATN3O15232 486 aa7.12□□□□□ -1.27
SCN9A-202ENST00000409435 PRODHO43272 600 aa7.12□□□□□ -1.27
SCN9A-202ENST00000409435 B4GALT2O60909 372 aa7.12□□□□□ -1.27
SCN9A-202ENST00000409435 CSO75390 466 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SCN9A-202ENST00000409435 REM1O75628 298 aa7.12□□□□□ -1.27
SCN9A-202ENST00000409435 TCEA3O75764 348 aa7.12□□□□□ -1.27
SCN9A-202ENST00000409435 FAM153BP0C7A2 387 aa7.12□□□□□ -1.27
SCN9A-202ENST00000409435 HSD17B3P37058 310 aa7.12□□□□□ -1.27
SCN9A-202ENST00000409435 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SCN9A-202ENST00000409435 CCR8P51685 355 aa7.12□□□□□ -1.27
SCN9A-202ENST00000409435 GNG2P59768 71 aa7.12□□□□□ -1.27
SCN9A-202ENST00000409435 NAE1Q13564 534 aa7.12□□□□□ -1.27
SCN9A-202ENST00000409435 HKDC1Q2TB90 917 aa7.12□□□□□ -1.27
SCN9A-202ENST00000409435 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SCN9A-202ENST00000409435 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SCN9A-202ENST00000409435 MPP5Q8N3R9 675 aa7.12□□□□□ -1.27
SCN9A-202ENST00000409435 PCDH19Q8TAB3 1148 aa7.12□□□□□ -1.27
SCN9A-202ENST00000409435 AGAP11Q8TF27 550 aa7.12□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.1 ms