RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 A8MUI8 341 aa18.3■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 H7C0C1 242 aa18.3■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 QSOX1O00391 747 aa18.3■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 ADAM10O14672 748 aa18.3■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 TTI1O43156 1089 aa18.3■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP18.3■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 GYPCP04921 128 aa18.3■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 COMTP21964 271 aa18.3■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 PSMB5P28074 263 aa18.3■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 ATP5OP48047 213 aa18.3■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 IST1P53990 364 aa18.3■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 PRPSAP1Q14558 356 aa18.3■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 ITIH4Q14624 930 aa18.3■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 MUM1Q2TAK8 710 aa18.3■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa18.3■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa18.3■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa18.3■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 FCRLBQ6BAA4 426 aa18.3■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 DNAAF3Q8N9W5 541 aa18.3■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 ARNT2Q9HBZ2 717 aa18.3■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 FAM169AQ9Y6X4 670 aa18.3■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 FAM221AA4D161 298 aa18.29■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 RASGRF2O14827 1237 aa18.29■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 OR56A5P0C7T3 313 aa18.29■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 ICAM2P13598 275 aa18.29■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 ABOP16442 354 aa18.29■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 TPH1P17752 444 aa18.29■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 IGFBP2P18065 325 aa18.29■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 CCR7P32248 378 aa18.29■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 SLC1A1P43005 524 aa18.29■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 HSF1Q00613 529 aa18.29■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM205Q6UW68 189 aa18.29■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 PACS1Q6VY07 963 aa18.29■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa18.29■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 CCDC50Q8IVM0 306 aa18.29■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 SLC22A15Q8IZD6 547 aa18.29■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 BEST3Q8N1M1 668 aa18.29■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 MDS2Q8NDY4 140 aa18.29■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 MIPEPQ99797 713 aa18.29■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 ABCA2Q9BZC7 2435 aa18.29■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 ASPDHA6ND91 283 aa18.28■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 E9PLN8 166 aa18.28■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 ASNA1O43681 348 aa18.28■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 MLYCDO95822 493 aa18.28■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 YBX1P67809 324 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 HSPA14Q0VDF9 509 aa18.28■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 TUBA3CQ13748 450 aa18.28■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 DSG2Q14126 1118 aa18.28■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 PRTGQ2VWP7 1150 aa18.28■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 TUBA3EQ6PEY2 450 aa18.28■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 CLEC17AQ6ZS10 378 aa18.28■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 RNF44Q7L0R7 432 aa18.28■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 SIAH3Q8IW03 269 aa18.28■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa18.28■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 CABS1Q96KC9 395 aa18.28■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 FRMD6Q96NE9 622 aa18.28■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 VKORC1Q9BQB6 163 aa18.28■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 TUBB6Q9BUF5 446 aa18.28■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 ANKRD10Q9NXR5 420 aa18.28■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 TEKT2Q9UIF3 430 aa18.28■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 SLC39A10Q9ULF5 831 aa18.28■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 PPT2Q9UMR5 302 aa18.28■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 HCFC1P51610 2035 aa18.28■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 SPG11Q96JI7 2443 aa18.28■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa18.27■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 RCCD1A6NED2 376 aa18.27■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 SPOPO43791 374 aa18.27■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 OR1I1O60431 355 aa18.27■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 AP2B1P63010 937 aa18.27■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 SYT16Q17RD7 645 aa18.27■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 FBXO42Q6P3S6 717 aa18.27■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 RHOT2Q8IXI1 618 aa18.27■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 AMER3Q8N944 861 aa18.27■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 STYXQ8WUJ0 223 aa18.27■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 SCMH1Q96GD3 660 aa18.27■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 TRIM51Q9BSJ1 452 aa18.27■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 C14orf105Q9NVL8 296 aa18.27■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 COQ3Q9NZJ6 369 aa18.27■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 CDC14AQ9UNH5 594 aa18.27■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 ASB1Q9Y576 335 aa18.27■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 KLK4Q9Y5K2 254 aa18.27■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 KRT87PA6NCN2 255 aa18.26■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 GPC4O75487 556 aa18.26■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 FAM155BO75949 473 aa18.26■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 SLCO2B1O94956 709 aa18.26■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 FKBP9O95302 570 aa18.26■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 KLK2P20151 261 aa18.26■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 MSNP26038 577 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 FOXN2P32314 431 aa18.26■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 CD96P40200 585 aa18.26■□□□□ 0.51
HOXD12-201ENST00000404162 SLC26A3P40879 764 aa18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.4 ms