RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384622.1

RNU6-540P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 540, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-540P, Length 101 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-540P-201ENST00000384622 C18orf63Q68DL7 685 aa-1.04□□□□□ -2.58
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RNU6-540P-201ENST00000384622 COL18A1P39060 1754 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-540P-201ENST00000384622 UNC13CQ8NB66 2214 aa-1.04□□□□□ -2.58
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RNU6-540P-201ENST00000384622 KNL1Q8NG31 2342 aa-1.05□□□□□ -2.58
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RNU6-540P-201ENST00000384622 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP-1.05□□□□□ -2.58
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RNU6-540P-201ENST00000384622 PRKAR2BP31323 418 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-540P-201ENST00000384622 FASLGP48023 281 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-540P-201ENST00000384622 THOP1P52888 689 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-540P-201ENST00000384622 NR1H2P55055 460 aa-1.05□□□□□ -2.58
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RNU6-540P-201ENST00000384622 CNTD1Q8N815 330 aa-1.05□□□□□ -2.58
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RNU6-540P-201ENST00000384622 NDST4Q9H3R1 872 aa-1.05□□□□□ -2.58
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RNU6-540P-201ENST00000384622 GJD2Q9UKL4 321 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-540P-201ENST00000384622 RAB23Q9ULC3 237 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-540P-201ENST00000384622 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-540P-201ENST00000384622 CLDN16Q9Y5I7 305 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-540P-201ENST00000384622 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa-1.05□□□□□ -2.58
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RNU6-540P-201ENST00000384622 DMDP11532 3685 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-540P-201ENST00000384622 TTC21AQ8NDW8 1320 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-540P-201ENST00000384622 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-540P-201ENST00000384622 ALPK3Q96L96 1907 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-540P-201ENST00000384622 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-540P-201ENST00000384622 A0A1B0GUA9 196 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-540P-201ENST00000384622 FAM149AA5PLN7 773 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-540P-201ENST00000384622 RRN3P2A6NIE6 340 aa-1.06□□□□□ -2.58
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