RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000382998.8

CTIF-202, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 4,407 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-202ENST00000382998 CDT1Q9H211 546 aa13.4□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 C3orf18Q9UK00 162 aa13.4□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 TGOLN2O43493 480 aa13.4□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 LILRB3O75022 631 aa13.4□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 IPO13O94829 963 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 RPS9P46781 194 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 TPI1P60174 286 aa13.4□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 MBTD1Q05BQ5 628 aa13.4□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 EFEMP1Q12805 493 aa13.4□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 ZNF697Q5TEC3 545 aa13.4□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 ACDQ96AP0 544 aa13.4□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 RCN3Q96D15 328 aa13.4□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 SLC30A2Q9BRI3 323 aa13.4□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 SUCNR1Q9BXA5 334 aa13.4□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 RBCK1Q9BYM8 510 aa13.4□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 TBC1D24Q9ULP9 559 aa13.4□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa13.4□□□□□ -0.26
CTIF-202ENST00000382998 ACOD1A6NK06 481 aa13.4□□□□□ -0.27
CTIF-202ENST00000382998 MID1O15344 667 aa13.4□□□□□ -0.27
CTIF-202ENST00000382998 ATG7O95352 703 aa13.4□□□□□ -0.27
CTIF-202ENST00000382998 CD36P16671 472 aa13.4□□□□□ -0.27
CTIF-202ENST00000382998 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.27
CTIF-202ENST00000382998 MAGEB1P43366 347 aa13.4□□□□□ -0.27
CTIF-202ENST00000382998 MARCKSL1P49006 195 aa13.4□□□□□ -0.27
CTIF-202ENST00000382998 GPR176Q14439 515 aa13.4□□□□□ -0.27
CTIF-202ENST00000382998 SSX7Q7RTT5 188 aa13.4□□□□□ -0.27
CTIF-202ENST00000382998 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.27
CTIF-202ENST00000382998 ZFP14Q9HCL3 533 aa13.4□□□□□ -0.27
CTIF-202ENST00000382998 CISHQ9NSE2 258 aa13.4□□□□□ -0.27
CTIF-202ENST00000382998 COMMD9Q9P000 198 aa13.4□□□□□ -0.27
CTIF-202ENST00000382998 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.27
CTIF-202ENST00000382998 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa13.4□□□□□ -0.27
CTIF-202ENST00000382998 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa13.39□□□□□ -0.27
CTIF-202ENST00000382998 OR5K4A6NMS3 321 aa13.39□□□□□ -0.27
CTIF-202ENST00000382998 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
CTIF-202ENST00000382998 ABCB7O75027 752 aa13.39□□□□□ -0.27
CTIF-202ENST00000382998 PSME3P61289 254 aa13.39□□□□□ -0.27
CTIF-202ENST00000382998 CCNIQ14094 377 aa13.39□□□□□ -0.27
CTIF-202ENST00000382998 LEXMQ3ZCV2 418 aa13.39□□□□□ -0.27
CTIF-202ENST00000382998 SLC39A12Q504Y0 691 aa13.39□□□□□ -0.27
CTIF-202ENST00000382998 AGKQ53H12 422 aa13.39□□□□□ -0.27
CTIF-202ENST00000382998 PLPP4Q5VZY2 271 aa13.39□□□□□ -0.27
CTIF-202ENST00000382998 YIPF7Q8N8F6 280 aa13.39□□□□□ -0.27
CTIF-202ENST00000382998 DZANK1Q9NVP4 752 aa13.39□□□□□ -0.27
CTIF-202ENST00000382998 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
CTIF-202ENST00000382998 WDR4P57081 412 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
CTIF-202ENST00000382998 C1DQ13901 141 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
CTIF-202ENST00000382998 ATG9BQ674R7 924 aa13.39□□□□□ -0.27
CTIF-202ENST00000382998 ZNF781Q8N8C0 355 aa13.39□□□□□ -0.27
CTIF-202ENST00000382998 ANKLE1Q8NAG6 615 aa13.39□□□□□ -0.27
CTIF-202ENST00000382998 ADIPOR1Q96A54 375 aa13.39□□□□□ -0.27
CTIF-202ENST00000382998 ADAM28Q9UKQ2 775 aa13.39□□□□□ -0.27
CTIF-202ENST00000382998 GPR34Q9UPC5 381 aa13.39□□□□□ -0.27
CTIF-202ENST00000382998 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa13.39□□□□□ -0.27
CTIF-202ENST00000382998 PLIN4Q96Q06 1357 aa13.39□□□□□ -0.27
CTIF-202ENST00000382998 ARVCFO00192 962 aa13.39□□□□□ -0.27
CTIF-202ENST00000382998 ADAM10O14672 748 aa13.39□□□□□ -0.27
CTIF-202ENST00000382998 CXCL14O95715 111 aa13.39□□□□□ -0.27
CTIF-202ENST00000382998 ADRB2P07550 413 aa13.39□□□□□ -0.27
CTIF-202ENST00000382998 PKN3Q6P5Z2 889 aa13.39□□□□□ -0.27
CTIF-202ENST00000382998 SLC24A5Q71RS6 500 aa13.39□□□□□ -0.27
CTIF-202ENST00000382998 SPATC1Q76KD6 591 aa13.39□□□□□ -0.27
CTIF-202ENST00000382998 TPRA1Q86W33 373 aa13.39□□□□□ -0.27
CTIF-202ENST00000382998 SLC34A3Q8N130 599 aa13.39□□□□□ -0.27
CTIF-202ENST00000382998 FEZF2Q8TBJ5 459 aa13.39□□□□□ -0.27
CTIF-202ENST00000382998 TMEM80Q96HE8 168 aa13.39□□□□□ -0.27
CTIF-202ENST00000382998 SPACA1Q9HBV2 294 aa13.39□□□□□ -0.27
CTIF-202ENST00000382998 NDRG3Q9UGV2 375 aa13.39□□□□□ -0.27
CTIF-202ENST00000382998 EI24O14681 340 aa13.38□□□□□ -0.27
CTIF-202ENST00000382998 PTAFRP25105 342 aa13.38□□□□□ -0.27
CTIF-202ENST00000382998 GJA5P36382 358 aa13.38□□□□□ -0.27
CTIF-202ENST00000382998 SLC1A6P48664 564 aa13.38□□□□□ -0.27
CTIF-202ENST00000382998 CYP27C1Q4G0S4 372 aa13.38□□□□□ -0.27
CTIF-202ENST00000382998 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
CTIF-202ENST00000382998 PAQR7Q86WK9 346 aa13.38□□□□□ -0.27
CTIF-202ENST00000382998 PRSS58Q8IYP2 241 aa13.38□□□□□ -0.27
CTIF-202ENST00000382998 RTKNQ9BST9 563 aa13.38□□□□□ -0.27
CTIF-202ENST00000382998 OPA3Q9H6K4 179 aa13.38□□□□□ -0.27
CTIF-202ENST00000382998 STUB1Q9UNE7 303 aa13.38□□□□□ -0.27
CTIF-202ENST00000382998 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
CTIF-202ENST00000382998 PI15O43692 258 aa13.38□□□□□ -0.27
CTIF-202ENST00000382998 TOXO94900 526 aa13.38□□□□□ -0.27
CTIF-202ENST00000382998 HTR2AP28223 471 aa13.38□□□□□ -0.27
CTIF-202ENST00000382998 VLDLRP98155 873 aa13.38□□□□□ -0.27
CTIF-202ENST00000382998 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
CTIF-202ENST00000382998 MAP4K3Q8IVH8 894 aa13.38□□□□□ -0.27
CTIF-202ENST00000382998 GPR65Q8IYL9 337 aa13.38□□□□□ -0.27
CTIF-202ENST00000382998 BBS1Q8NFJ9 593 aa13.38□□□□□ -0.27
CTIF-202ENST00000382998 OR10H5Q8NGA6 315 aa13.38□□□□□ -0.27
CTIF-202ENST00000382998 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
CTIF-202ENST00000382998 RAD51AP1Q96B01 352 aa13.38□□□□□ -0.27
CTIF-202ENST00000382998 FUNDC2Q9BWH2 189 aa13.38□□□□□ -0.27
CTIF-202ENST00000382998 NPAP1Q9NZP6 1156 aa13.38□□□□□ -0.27
CTIF-202ENST00000382998 INVSQ9Y283 1065 aa13.38□□□□□ -0.27
CTIF-202ENST00000382998 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa13.38□□□□□ -0.27
CTIF-202ENST00000382998 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.8 ms