RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380298.2

SLC22A23-201, Transcript of solute carrier family 22 member 23, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC22A23, Length 1,574 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A23-201ENST00000380298 SLC22A9Q8IVM8 553 aa26.53■■□□□ 1.84
SLC22A23-201ENST00000380298 CCDC63Q8NA47 563 aa26.53■■□□□ 1.84
SLC22A23-201ENST00000380298 KLHL6Q8WZ60 621 aa26.53■■□□□ 1.84
SLC22A23-201ENST00000380298 CCDC126Q96EE4 140 aa26.53■■□□□ 1.84
SLC22A23-201ENST00000380298 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa26.53■■□□□ 1.84
SLC22A23-201ENST00000380298 STRADBQ9C0K7 418 aa26.53■■□□□ 1.84
SLC22A23-201ENST00000380298 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
SLC22A23-201ENST00000380298 ABCF3Q9NUQ8 709 aa26.53■■□□□ 1.84
SLC22A23-201ENST00000380298 KLK4Q9Y5K2 254 aa26.53■■□□□ 1.84
SLC22A23-201ENST00000380298 KCNE2Q9Y6J6 123 aa26.53■■□□□ 1.84
SLC22A23-201ENST00000380298 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
SLC22A23-201ENST00000380298 SPEGQ15772 3267 aa26.52■■□□□ 1.84
SLC22A23-201ENST00000380298 A8MT66 165 aa26.52■■□□□ 1.84
SLC22A23-201ENST00000380298 HGSO14964 777 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
SLC22A23-201ENST00000380298 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP26.52■■□□□ 1.841e-11■■■■■ 36.1
SLC22A23-201ENST00000380298 WDR47O94967 919 aa26.52■■□□□ 1.84
SLC22A23-201ENST00000380298 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
SLC22A23-201ENST00000380298 GDF5P43026 501 aa26.52■■□□□ 1.84
SLC22A23-201ENST00000380298 LSSP48449 732 aa26.52■■□□□ 1.84
SLC22A23-201ENST00000380298 ZYG11AQ6WRX3 759 aa26.52■■□□□ 1.84
SLC22A23-201ENST00000380298 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa26.52■■□□□ 1.84
SLC22A23-201ENST00000380298 ZUFSPQ96AP4 578 aa26.52■■□□□ 1.84
SLC22A23-201ENST00000380298 PHF21BQ96EK2 531 aa26.52■■□□□ 1.84
SLC22A23-201ENST00000380298 PPM1MQ96MI6 270 aa26.52■■□□□ 1.84
SLC22A23-201ENST00000380298 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa26.52■■□□□ 1.84
SLC22A23-201ENST00000380298 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
SLC22A23-201ENST00000380298 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa26.51■■□□□ 1.83
SLC22A23-201ENST00000380298 A8MU76 341 aa26.51■■□□□ 1.83
SLC22A23-201ENST00000380298 TM9SF1O15321 606 aa26.51■■□□□ 1.83
SLC22A23-201ENST00000380298 DLX3O60479 287 aa26.51■■□□□ 1.83
SLC22A23-201ENST00000380298 MYL2P10916 166 aa26.51■■□□□ 1.83
SLC22A23-201ENST00000380298 HRH2P25021 359 aa26.51■■□□□ 1.83
SLC22A23-201ENST00000380298 AGTR2P50052 363 aa26.51■■□□□ 1.83
SLC22A23-201ENST00000380298 CLDN6P56747 220 aa26.51■■□□□ 1.83
SLC22A23-201ENST00000380298 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa26.51■■□□□ 1.83
SLC22A23-201ENST00000380298 TRIM73Q86UV7 250 aa26.51■■□□□ 1.83
SLC22A23-201ENST00000380298 C17orf64Q86WR6 236 aa26.51■■□□□ 1.83
SLC22A23-201ENST00000380298 ESAMQ96AP7 390 aa26.51■■□□□ 1.83
SLC22A23-201ENST00000380298 FAM111AQ96PZ2 611 aa26.51■■□□□ 1.83
SLC22A23-201ENST00000380298 OR4K3Q96R72 315 aa26.51■■□□□ 1.83
SLC22A23-201ENST00000380298 CAPS2Q9BXY5 557 aa26.51■■□□□ 1.83
SLC22A23-201ENST00000380298 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa26.51■■□□□ 1.83
SLC22A23-201ENST00000380298 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
SLC22A23-201ENST00000380298 DNAJC11Q9NVH1 559 aa26.51■■□□□ 1.83
SLC22A23-201ENST00000380298 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa26.5■■□□□ 1.83
SLC22A23-201ENST00000380298 G3V2L1 256 aa26.5■■□□□ 1.83
SLC22A23-201ENST00000380298 K7EPI3 171 aa26.5■■□□□ 1.83
SLC22A23-201ENST00000380298 MAP3K7O43318 606 aa26.5■■□□□ 1.83
SLC22A23-201ENST00000380298 CPA3P15088 417 aa26.5■■□□□ 1.83
SLC22A23-201ENST00000380298 ST6GAL1P15907 406 aa26.5■■□□□ 1.83
SLC22A23-201ENST00000380298 FBXO48Q5FWF7 155 aa26.5■■□□□ 1.83
SLC22A23-201ENST00000380298 ARMC2Q8NEN0 867 aa26.5■■□□□ 1.83
SLC22A23-201ENST00000380298 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
SLC22A23-201ENST00000380298 SLC41A2Q96JW4 573 aa26.5■■□□□ 1.83
SLC22A23-201ENST00000380298 KCNK9Q9NPC2 374 aa26.5■■□□□ 1.83
SLC22A23-201ENST00000380298 GPRC5BQ9NZH0 403 aa26.5■■□□□ 1.83
SLC22A23-201ENST00000380298 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
SLC22A23-201ENST00000380298 ANKMY1Q9P2S6 941 aa26.5■■□□□ 1.83
SLC22A23-201ENST00000380298 SLC17A7Q9P2U7 560 aa26.5■■□□□ 1.83
SLC22A23-201ENST00000380298 COPG2Q9UBF2 871 aa26.5■■□□□ 1.83
SLC22A23-201ENST00000380298 OPTCQ9UBM4 332 aa26.5■■□□□ 1.83
SLC22A23-201ENST00000380298 DYRK1BQ9Y463 629 aa26.5■■□□□ 1.83
SLC22A23-201ENST00000380298 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
SLC22A23-201ENST00000380298 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
SLC22A23-201ENST00000380298 GRIA3P42263 894 aa26.5■■□□□ 1.83
SLC22A23-201ENST00000380298 HSD11B2P80365 405 aa26.5■■□□□ 1.83
SLC22A23-201ENST00000380298 FAM20CQ8IXL6 584 aa26.5■■□□□ 1.83
SLC22A23-201ENST00000380298 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa26.5■■□□□ 1.83
SLC22A23-201ENST00000380298 AGBL5Q8NDL9 886 aa26.5■■□□□ 1.83
SLC22A23-201ENST00000380298 RCBTB1Q8NDN9 531 aa26.5■■□□□ 1.83
SLC22A23-201ENST00000380298 BTRCQ9Y297 605 aa26.5■■□□□ 1.83
SLC22A23-201ENST00000380298 ZWINTO95229 277 aa26.49■■□□□ 1.83
SLC22A23-201ENST00000380298 PVRP15151 417 aa26.49■■□□□ 1.83
SLC22A23-201ENST00000380298 NELFEP18615 380 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
SLC22A23-201ENST00000380298 MAGP20916 626 aa26.49■■□□□ 1.83
SLC22A23-201ENST00000380298 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP26.49■■□□□ 1.836e-7■■■■■ 27.9
SLC22A23-201ENST00000380298 ARL4DP49703 201 aa26.49■■□□□ 1.83
SLC22A23-201ENST00000380298 SLC18A1P54219 525 aa26.49■■□□□ 1.83
SLC22A23-201ENST00000380298 PRKAA2P54646 552 aa26.49■■□□□ 1.83
SLC22A23-201ENST00000380298 CDC16Q13042 620 aa26.49■■□□□ 1.83
SLC22A23-201ENST00000380298 FIGLAQ6QHK4 219 aa26.49■■□□□ 1.83
SLC22A23-201ENST00000380298 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa26.49■■□□□ 1.83
SLC22A23-201ENST00000380298 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
SLC22A23-201ENST00000380298 TCTN2Q96GX1 697 aa26.49■■□□□ 1.83
SLC22A23-201ENST00000380298 CMKLR1Q99788 373 aa26.49■■□□□ 1.83
SLC22A23-201ENST00000380298 DPH7Q9BTV6 452 aa26.49■■□□□ 1.83
SLC22A23-201ENST00000380298 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa26.49■■□□□ 1.83
SLC22A23-201ENST00000380298 SNX7Q9UNH6 387 aa26.49■■□□□ 1.83
SLC22A23-201ENST00000380298 ASB1Q9Y576 335 aa26.49■■□□□ 1.83
SLC22A23-201ENST00000380298 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
SLC22A23-201ENST00000380298 GNAZP19086 355 aa26.48■■□□□ 1.83
SLC22A23-201ENST00000380298 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
SLC22A23-201ENST00000380298 PIK3CGP48736 1102 aa26.48■■□□□ 1.83
SLC22A23-201ENST00000380298 SEPHS1P49903 392 aa26.48■■□□□ 1.83
SLC22A23-201ENST00000380298 YBX1P67809 324 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
SLC22A23-201ENST00000380298 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP26.48■■□□□ 1.836e-6■■■■□ 20.5
SLC22A23-201ENST00000380298 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
SLC22A23-201ENST00000380298 PDK4Q16654 411 aa26.48■■□□□ 1.83
SLC22A23-201ENST00000380298 TTMPQ5BVD1 217 aa26.48■■□□□ 1.83
SLC22A23-201ENST00000380298 SLC5A11Q8WWX8 675 aa26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.7 ms