RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379599.6

NHLRC3-201, Transcript of NHL repeat containing 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NHLRC3, Length 3,275 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC3-201ENST00000379599 ADAM28Q9UKQ2 775 aa8.3□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 COQ4Q9Y3A0 265 aa8.3□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 MAST2Q6P0Q8 1798 aa8.3□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 USP54Q70EL1 1684 aa8.3□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa8.3□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa8.3□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 ARGFXA6NJG6 315 aa8.3□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 TULP3O75386 442 aa8.3□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 TOXO94900 526 aa8.3□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 CXCL14O95715 111 aa8.3□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 HMGCRP04035 888 aa8.3□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 PRKAR1AP10644 381 aa8.3□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 TGM4P49221 684 aa8.3□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 MAN2A2P49641 1150 aa8.3□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 PRMT2P55345 433 aa8.3□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 RNF4P78317 190 aa8.3□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 DEFA6Q01524 100 aa8.3□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 MXD1Q05195 221 aa8.3□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 DUSP4Q13115 394 aa8.3□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 SEC23BQ15437 767 aa8.3□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 SSX2Q16385 188 aa8.3□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 AP5B1Q2VPB7 878 aa8.3□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 KLHL26Q53HC5 615 aa8.3□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa8.3□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 SLC27A4Q6P1M0 643 aa8.3□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 SCYL2Q6P3W7 929 aa8.3□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 MOB2Q70IA6 237 aa8.3□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 LRRC8DQ7L1W4 858 aa8.3□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 RAB11FIP2Q7L804 512 aa8.3□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 OVCH2Q7RTZ1 564 aa8.3□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 FAM217AQ8IXS0 508 aa8.3□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 PGBD3Q8N328 593 aa8.3□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 FAM86B1Q8N7N1 296 aa8.3□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 ZNF675Q8TD23 568 aa8.3□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 NR4A3Q92570 626 aa8.3□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 LRRC46Q96FV0 321 aa8.3□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 RNF157Q96PX1 679 aa8.3□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 P2RY13Q9BPV8 354 aa8.3□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 PTDSS2Q9BVG9 487 aa8.3□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 REG4Q9BYZ8 158 aa8.3□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 PIGUQ9H490 435 aa8.3□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa8.3□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 SPHK1Q9NYA1 384 aa8.3□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 SEC14L4Q9UDX3 406 aa8.3□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 DLEC1Q9Y238 1755 aa8.29□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 TJP1Q07157 1748 aa8.29□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 ANKRD28O15084 1053 aa8.29□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 FOSP01100 380 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 ANXA6P08133 673 aa8.29□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 SBK3P0C264 359 aa8.29□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 PFKLP17858 780 aa8.29□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 MAGEA3P43357 314 aa8.29□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 P2RY4P51582 365 aa8.29□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 CHAF1BQ13112 559 aa8.29□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 SLC25A25Q6KCM7 469 aa8.29□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 ENPP6Q6UWR7 440 aa8.29□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 GCNT7Q6ZNI0 430 aa8.29□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 SSX9Q7RTT3 188 aa8.29□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 CLEC14AQ86T13 490 aa8.29□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 CUZD1Q86UP6 607 aa8.29□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa8.29□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 OR1M1Q8NGA1 313 aa8.29□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 SLC13A3Q8WWT9 602 aa8.29□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 KIAA1191Q96A73 305 aa8.29□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 RAB7BQ96AH8 199 aa8.29□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 MOGAT1Q96PD6 335 aa8.29□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 MYOCQ99972 504 aa8.29□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 TRMOQ9BU70 441 aa8.29□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 SLC29A3Q9BZD2 475 aa8.29□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa8.29□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 SMPD4Q9NXE4 827 aa8.29□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 KCMF1Q9P0J7 381 aa8.29□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 NDRG3Q9UGV2 375 aa8.29□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 UTS2RQ9UKP6 389 aa8.29□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa8.29□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 ASB4Q9Y574 426 aa8.29□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa8.29□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 TNS3Q68CZ2 1445 aa8.29□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 RGPD2P0DJD1 1756 aa8.29□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa8.29□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 A0A1B0GWJ7 208 aa8.29□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 PER2O15055 1255 aa8.29□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 SLC16A6O15403 523 aa8.29□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 CLN5O75503 358 aa8.29□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 MYL3P08590 195 aa8.29□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 RGS6P49758 472 aa8.29□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 TKTL1P51854 596 aa8.29□□□□□ -1.08
NHLRC3-201ENST00000379599 CRISP3P54108 245 aa8.29□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms