RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378546.8

FAAP20-202, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FAAP20, Length 729 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-202ENST00000378546 GRPEL1Q9HAV7 217 aa24.37■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 SLC6A20Q9NP91 592 aa24.37■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 CTSFQ9UBX1 484 aa24.37■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 TAC3Q9UHF0 121 aa24.37■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 NEU2Q9Y3R4 380 aa24.37■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 AGPSO00116 658 aa24.36■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 CCNDBP1O95273 360 aa24.36■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 ALBP02768 609 aa24.36■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 ITGA3P26006 1051 aa24.36■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 HSD17B2P37059 387 aa24.36■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 PNLIPRP1P54315 467 aa24.36■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 MPP1Q00013 466 aa24.36■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 MYBPC3Q14896 1274 aa24.36■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 ARHGAP19Q14CB8 494 aa24.36■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 NKG7Q16617 165 aa24.36■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 SLC6A19Q695T7 634 aa24.36■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 NEK10Q6ZWH5 1172 aa24.36■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 GIMAP7Q8NHV1 300 aa24.36■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 CABS1Q96KC9 395 aa24.36■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 ZNF285Q96NJ3 590 aa24.36■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 SLC30A3Q99726 388 aa24.36■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa24.36■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 C5AR2Q9P296 337 aa24.36■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 FBXL4Q9UKA2 621 aa24.36■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 SNX12Q9UMY4 172 aa24.36■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 KLK4Q9Y5K2 254 aa24.36■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 HECTD1Q9ULT8 2610 aa24.35■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 ANKRD12Q6UB98 2062 aa24.35■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa24.35■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa24.35■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 FITM1A5D6W6 292 aa24.35■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 MASP2O00187 686 aa24.35■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 MMP11P24347 488 aa24.35■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 MAGEA3P43357 314 aa24.35■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 RBBP7Q16576 425 aa24.35■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa24.35■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa24.35■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 COX15Q7KZN9 410 aa24.35■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 ADCK2Q7Z695 626 aa24.35■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 KCNMB4Q86W47 210 aa24.35■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 TMEM151BQ8IW70 566 aa24.35■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 OR4N4Q8N0Y3 316 aa24.35■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 FAM26EQ8N5C1 309 aa24.35■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 PPFIBP2Q8ND30 876 aa24.35■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 TM9SF4Q92544 642 aa24.35■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 PNPLA2Q96AD5 504 aa24.35■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 GPR21Q99679 349 aa24.35■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 FBXO5Q9UKT4 447 aa24.35■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 COMMD10Q9Y6G5 202 aa24.35■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 PCM1Q15154 2024 aa24.34■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 OR2A25A4D2G3 310 aa24.34■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 IPO13O94829 963 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 MPC1LP0DKB6 136 aa24.34■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 ERGP11308 486 aa24.34■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 PGAM1P18669 254 aa24.34■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 UQCRFS1P47985 274 aa24.34■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 YBX1P67809 324 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 OCA2Q04671 838 aa24.34■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 PTK6Q13882 451 aa24.34■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 MUM1Q2TAK8 710 aa24.34■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa24.34■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 ZNF549Q6P9A3 640 aa24.34■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 CPNE9Q8IYJ1 553 aa24.34■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP24.34■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 DTWD1Q8N5C7 304 aa24.34■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 INPP5DQ92835 1189 aa24.34■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 VPS50Q96JG6 964 aa24.34■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 SPSB2Q99619 263 aa24.34■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 SLC26A1Q9H2B4 701 aa24.34■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 ZNF304Q9HCX3 659 aa24.34■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 ANKMY1Q9P2S6 941 aa24.34■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 SMAPO00193 183 aa24.33■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 ZBTB14O43829 449 aa24.33■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 ALOX12BO75342 701 aa24.33■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 SLC16A8O95907 504 aa24.33■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 FBLP22087 321 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 GNLYP22749 145 aa24.33■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 ICE2Q659A1 982 aa24.33■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 PRMT9Q6P2P2 845 aa24.33■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 PRSS58Q8IYP2 241 aa24.33■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 GALNT11Q8NCW6 608 aa24.33■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 NACC2Q96BF6 587 aa24.33■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 SIGLEC10Q96LC7 697 aa24.33■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 PLCD4Q9BRC7 762 aa24.33■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 CRB3Q9BUF7 120 aa24.33■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
FAAP20-202ENST00000378546 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms