RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319359.7

ELL3-201, Transcript of elongation factor for RNA polymerase II 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ELL3, Length 2,352 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3-201ENST00000319359 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa21.11■□□□□ 0.97
ELL3-201ENST00000319359 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
ELL3-201ENST00000319359 RGS4P49798 205 aa21.1■□□□□ 0.97
ELL3-201ENST00000319359 ARHGDIAP52565 204 aa21.1■□□□□ 0.97
ELL3-201ENST00000319359 CXCR4P61073 352 aa21.1■□□□□ 0.97
ELL3-201ENST00000319359 LINC00299Q6ZSB3 139 aa21.1■□□□□ 0.97
ELL3-201ENST00000319359 TRIB2Q92519 343 aa21.1■□□□□ 0.97
ELL3-201ENST00000319359 TPD52L3Q96J77 140 aa21.1■□□□□ 0.97
ELL3-201ENST00000319359 KCNC2Q96PR1 638 aa21.1■□□□□ 0.97
ELL3-201ENST00000319359 NTMT1Q9BV86 223 aa21.1■□□□□ 0.97
ELL3-201ENST00000319359 TRPS1Q9UHF7 1281 aa21.1■□□□□ 0.97
ELL3-201ENST00000319359 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa21.1■□□□□ 0.97
ELL3-201ENST00000319359 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa21.1■□□□□ 0.97
ELL3-201ENST00000319359 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
ELL3-201ENST00000319359 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
ELL3-201ENST00000319359 ENGP17813 658 aa21.1■□□□□ 0.97
ELL3-201ENST00000319359 ATF6P18850 670 aa21.1■□□□□ 0.97
ELL3-201ENST00000319359 CRISP3P54108 245 aa21.1■□□□□ 0.97
ELL3-201ENST00000319359 DEPDC1Q5TB30 811 aa21.1■□□□□ 0.97
ELL3-201ENST00000319359 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
ELL3-201ENST00000319359 CARNMT1Q8N4J0 409 aa21.1■□□□□ 0.97
ELL3-201ENST00000319359 SVOPQ8N4V2 548 aa21.1■□□□□ 0.97
ELL3-201ENST00000319359 ZBTB2Q8N680 514 aa21.1■□□□□ 0.97
ELL3-201ENST00000319359 ELMO1Q92556 727 aa21.1■□□□□ 0.97
ELL3-201ENST00000319359 APOLD1Q96LR9 279 aa21.1■□□□□ 0.97
ELL3-201ENST00000319359 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
ELL3-201ENST00000319359 LHX3Q9UBR4 397 aa21.1■□□□□ 0.97
ELL3-201ENST00000319359 AIREO43918 545 aa21.09■□□□□ 0.97
ELL3-201ENST00000319359 STK16O75716 305 aa21.09■□□□□ 0.97
ELL3-201ENST00000319359 CLDN9O95484 217 aa21.09■□□□□ 0.97
ELL3-201ENST00000319359 COL6A1P12109 1028 aa21.09■□□□□ 0.97
ELL3-201ENST00000319359 IL1RNP18510 177 aa21.09■□□□□ 0.97
ELL3-201ENST00000319359 FPR1P21462 350 aa21.09■□□□□ 0.97
ELL3-201ENST00000319359 AQP1P29972 269 aa21.09■□□□□ 0.97
ELL3-201ENST00000319359 HMGCLP35914 325 aa21.09■□□□□ 0.97
ELL3-201ENST00000319359 NUDT6P53370 316 aa21.09■□□□□ 0.97
ELL3-201ENST00000319359 ZNF404Q494X3 552 aa21.09■□□□□ 0.97
ELL3-201ENST00000319359 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
ELL3-201ENST00000319359 SIGLEC11Q96RL6 698 aa21.09■□□□□ 0.97
ELL3-201ENST00000319359 EHD1Q9H4M9 534 aa21.09■□□□□ 0.97
ELL3-201ENST00000319359 IL26Q9NPH9 171 aa21.09■□□□□ 0.97
ELL3-201ENST00000319359 ASIC5Q9NY37 505 aa21.09■□□□□ 0.97
ELL3-201ENST00000319359 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
ELL3-201ENST00000319359 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa21.09■□□□□ 0.97
ELL3-201ENST00000319359 KCNK5O95279 499 aa21.09■□□□□ 0.97
ELL3-201ENST00000319359 DNTTP04053 509 aa21.09■□□□□ 0.97
ELL3-201ENST00000319359 NUDT7P0C024 238 aa21.09■□□□□ 0.97
ELL3-201ENST00000319359 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa21.09■□□□□ 0.97
ELL3-201ENST00000319359 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
ELL3-201ENST00000319359 DGKAP23743 735 aa21.09■□□□□ 0.97
ELL3-201ENST00000319359 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
ELL3-201ENST00000319359 SLC19A1P41440 591 aa21.09■□□□□ 0.97
ELL3-201ENST00000319359 SLC11A2P49281 568 aa21.09■□□□□ 0.97
ELL3-201ENST00000319359 NPRL3Q12980 569 aa21.09■□□□□ 0.97
ELL3-201ENST00000319359 GPRC6AQ5T6X5 926 aa21.09■□□□□ 0.97
ELL3-201ENST00000319359 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
ELL3-201ENST00000319359 ZZZ3Q8IYH5 903 aa21.09■□□□□ 0.97
ELL3-201ENST00000319359 CLECL1Q8IZS7 167 aa21.09■□□□□ 0.97
ELL3-201ENST00000319359 ITPAQ9BY32 194 aa21.09■□□□□ 0.97
ELL3-201ENST00000319359 TMEM184CQ9NVA4 438 aa21.09■□□□□ 0.97
ELL3-201ENST00000319359 RNF6Q9Y252 685 aa21.09■□□□□ 0.97
ELL3-201ENST00000319359 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa21.09■□□□□ 0.97
ELL3-201ENST00000319359 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa21.08■□□□□ 0.97
ELL3-201ENST00000319359 ILVBLA1L0T0 632 aa21.08■□□□□ 0.97
ELL3-201ENST00000319359 METTL15A6NJ78 407 aa21.08■□□□□ 0.97
ELL3-201ENST00000319359 A6NL46 340 aa21.08■□□□□ 0.97
ELL3-201ENST00000319359 M0R129 80 aa21.08■□□□□ 0.97
ELL3-201ENST00000319359 DSCR3O14972 297 aa21.08■□□□□ 0.97
ELL3-201ENST00000319359 CLDN11O75508 207 aa21.08■□□□□ 0.97
ELL3-201ENST00000319359 CLDN7O95471 211 aa21.08■□□□□ 0.97
ELL3-201ENST00000319359 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
ELL3-201ENST00000319359 PCYT1AP49585 367 aa21.08■□□□□ 0.97
ELL3-201ENST00000319359 NFATC2Q13469 925 aa21.08■□□□□ 0.97
ELL3-201ENST00000319359 PLEKHG6Q3KR16 790 aa21.08■□□□□ 0.97
ELL3-201ENST00000319359 SPATC1Q76KD6 591 aa21.08■□□□□ 0.97
ELL3-201ENST00000319359 PTOV1Q86YD1 416 aa21.08■□□□□ 0.97
ELL3-201ENST00000319359 CDC26Q8NHZ8 85 aa21.08■□□□□ 0.97
ELL3-201ENST00000319359 LINC01599Q8WXQ3 324 aa21.08■□□□□ 0.97
ELL3-201ENST00000319359 SLC38A4Q969I6 547 aa21.08■□□□□ 0.97
ELL3-201ENST00000319359 DNMT3LQ9UJW3 386 aa21.08■□□□□ 0.97
ELL3-201ENST00000319359 A0A1W2PQ67 120 aa21.08■□□□□ 0.96
ELL3-201ENST00000319359 CLIC1O00299 241 aa21.08■□□□□ 0.96
ELL3-201ENST00000319359 YY2O15391 372 aa21.08■□□□□ 0.96
ELL3-201ENST00000319359 SSX4O60224 188 aa21.08■□□□□ 0.96
ELL3-201ENST00000319359 WDR47O94967 919 aa21.08■□□□□ 0.96
ELL3-201ENST00000319359 SEMG1P04279 462 aa21.08■□□□□ 0.96
ELL3-201ENST00000319359 KDELR2P33947 212 aa21.08■□□□□ 0.96
ELL3-201ENST00000319359 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.96
ELL3-201ENST00000319359 VMACQ2NL98 169 aa21.08■□□□□ 0.96
ELL3-201ENST00000319359 LRIT3Q3SXY7 679 aa21.08■□□□□ 0.96
ELL3-201ENST00000319359 ZNF621Q6ZSS3 439 aa21.08■□□□□ 0.96
ELL3-201ENST00000319359 SYTL1Q8IYJ3 562 aa21.08■□□□□ 0.96
ELL3-201ENST00000319359 COPS4Q9BT78 406 aa21.08■□□□□ 0.96
ELL3-201ENST00000319359 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.96
ELL3-201ENST00000319359 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa21.08■□□□□ 0.96
ELL3-201ENST00000319359 AGAP5A6NIR3 686 aa21.07■□□□□ 0.96
ELL3-201ENST00000319359 CLDN24A6NM45 220 aa21.07■□□□□ 0.96
ELL3-201ENST00000319359 SLC38A8A6NNN8 435 aa21.07■□□□□ 0.96
ELL3-201ENST00000319359 SNPHO15079 494 aa21.07■□□□□ 0.96
ELL3-201ENST00000319359 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.7 ms