RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000309641.10

PDE4D-201, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,025 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-201ENST00000309641 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-201ENST00000309641 BRINP1O60477 761 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-201ENST00000309641 CTSVO60911 334 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-201ENST00000309641 KERAO60938 352 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-201ENST00000309641 SUPT3HO75486 399 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-201ENST00000309641 TIAF1O95411 115 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-201ENST00000309641 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-201ENST00000309641 MT-ND3P03897 115 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-201ENST00000309641 ANXA5P08758 320 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-201ENST00000309641 C1QTNF9P0C862 333 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-201ENST00000309641 JMJD7P0C870 316 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-201ENST00000309641 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-201ENST00000309641 HSD11B2P80365 405 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-201ENST00000309641 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-201ENST00000309641 RTP5Q14D33 572 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-201ENST00000309641 ACAP2Q15057 778 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-201ENST00000309641 ICE2Q659A1 982 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-201ENST00000309641 FIGLAQ6QHK4 219 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-201ENST00000309641 PLD3Q8IV08 490 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-201ENST00000309641 D2HGDHQ8N465 521 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-201ENST00000309641 RAB42Q8N4Z0 105 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-201ENST00000309641 USP7Q93009 1102 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-201ENST00000309641 SLC22A18Q96BI1 424 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-201ENST00000309641 MOCOSQ96EN8 888 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-201ENST00000309641 SLC46A1Q96NT5 459 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-201ENST00000309641 DPH7Q9BTV6 452 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-201ENST00000309641 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-201ENST00000309641 ACSS2Q9NR19 701 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-201ENST00000309641 FOXJ2Q9P0K8 574 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-201ENST00000309641 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-201ENST00000309641 EMCNQ9ULC0 261 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-201ENST00000309641 SLC22A14Q9Y267 594 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-201ENST00000309641 BTRCQ9Y297 605 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-201ENST00000309641 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-201ENST00000309641 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-201ENST00000309641 AK5Q9Y6K8 562 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-201ENST00000309641 DSPP15924 2871 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-201ENST00000309641 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-201ENST00000309641 H7BY64 318 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-201ENST00000309641 ERLIN1O75477 346 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-201ENST00000309641 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-201ENST00000309641 KRT4P19013 534 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-201ENST00000309641 HSD17B2P37059 387 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-201ENST00000309641 GABRA4P48169 554 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-201ENST00000309641 HSPA7P48741 367 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-201ENST00000309641 CDKL1Q00532 357 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-201ENST00000309641 KRT71Q3SY84 523 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-201ENST00000309641 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-201ENST00000309641 CCDC91Q7Z6B0 441 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-201ENST00000309641 TRABD2AQ86V40 505 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-201ENST00000309641 PDPRQ8NCN5 879 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-201ENST00000309641 RHEBL1Q8TAI7 183 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-201ENST00000309641 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-201ENST00000309641 GRAMD1AQ96CP6 724 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-201ENST00000309641 SCYL1Q96KG9 808 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-201ENST00000309641 TSNARE1Q96NA8 513 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-201ENST00000309641 PRAP1Q96NZ9 151 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-201ENST00000309641 TMEM109Q9BVC6 243 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-201ENST00000309641 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-201ENST00000309641 NRSN2Q9GZP1 204 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-201ENST00000309641 PPCSQ9HAB8 311 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-201ENST00000309641 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-201ENST00000309641 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-201ENST00000309641 FGF21Q9NSA1 209 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-201ENST00000309641 SLC39A1Q9NY26 324 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-201ENST00000309641 LGALS13Q9UHV8 139 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-201ENST00000309641 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-201ENST00000309641 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-201ENST00000309641 TARM1B6A8C7 271 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-201ENST00000309641 PRAMEF4O60810 478 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-201ENST00000309641 WDR47O94967 919 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-201ENST00000309641 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-201ENST00000309641 CAPNS1P04632 268 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-201ENST00000309641 COL6A2P12110 1019 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF28P17035 718 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-201ENST00000309641 EPORP19235 508 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-201ENST00000309641 CMPK1P30085 196 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-201ENST00000309641 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-201ENST00000309641 SLC6A12P48065 614 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-201ENST00000309641 ARL4DP49703 201 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-201ENST00000309641 MC2RQ01718 297 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-201ENST00000309641 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-201ENST00000309641 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-201ENST00000309641 TUBB3Q13509 450 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-201ENST00000309641 CASP8Q14790 479 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-201ENST00000309641 PFKFB4Q16877 469 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-201ENST00000309641 CATSPEREQ5SY80 951 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-201ENST00000309641 CEP85LQ5SZL2 805 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-201ENST00000309641 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-201ENST00000309641 FAM219BQ5XKK7 198 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-201ENST00000309641 FRMPD2BQ6IN97 320 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-201ENST00000309641 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-201ENST00000309641 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-201ENST00000309641 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF740Q8NDX6 193 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-201ENST00000309641 OR1L3Q8NH93 324 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-201ENST00000309641 NEIL2Q969S2 332 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-201ENST00000309641 PHF21BQ96EK2 531 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-201ENST00000309641 SPNS1Q9H2V7 528 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-201ENST00000309641 PDE7BQ9NP56 450 aa8.73□□□□□ -1.01
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