RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000303731.8

TRAPPC1-201, Transcript of trafficking protein particle complex 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC1, Length 811 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1-201ENST00000303731 PSMB5P28074 263 aa15.94■□□□□ 0.14
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TRAPPC1-201ENST00000303731 CARSP49589 748 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC1-201ENST00000303731 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP15.94■□□□□ 0.14
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TRAPPC1-201ENST00000303731 KLHL38Q2WGJ6 581 aa15.94■□□□□ 0.14
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TRAPPC1-201ENST00000303731 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC1-201ENST00000303731 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC1-201ENST00000303731 A0A0J9YVX5 310 aa15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC1-201ENST00000303731 ARHGEF33A8MVX0 844 aa15.93■□□□□ 0.14
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TRAPPC1-201ENST00000303731 ZSCAN12O43309 604 aa15.92■□□□□ 0.14
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TRAPPC1-201ENST00000303731 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
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TRAPPC1-201ENST00000303731 NAT8LQ8N9F0 302 aa15.91■□□□□ 0.14
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TRAPPC1-201ENST00000303731 ASB11Q8WXH4 323 aa15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC1-201ENST00000303731 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC1-201ENST00000303731 MIEF2Q96C03 454 aa15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC1-201ENST00000303731 CABS1Q96KC9 395 aa15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC1-201ENST00000303731 ACAT2Q9BWD1 397 aa15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC1-201ENST00000303731 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC1-201ENST00000303731 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC1-201ENST00000303731 GALPQ9UBC7 116 aa15.91■□□□□ 0.14
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