RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 PTGS2P35354 604 aa7.48□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 GCGRP47871 477 aa7.48□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 PMP22Q01453 160 aa7.48□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 OR1C1Q15619 314 aa7.48□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 EXT1Q16394 746 aa7.48□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 NDUFA9Q16795 377 aa7.48□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 BTBD16Q32M84 506 aa7.48□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 FBXW10Q5XX13 1052 aa7.48□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC9A4Q6AI14 798 aa7.48□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 SASS6Q6UVJ0 657 aa7.48□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 H2AFVQ71UI9 128 aa7.48□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 TAS2R42Q7RTR8 314 aa7.48□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 DOLPP1Q86YN1 238 aa7.48□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 PLD5Q8N7P1 536 aa7.48□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 MAGEC3Q8TD91 643 aa7.48□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 MCOLN3Q8TDD5 553 aa7.48□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa7.48□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 C18orf12Q96KH6 178 aa7.48□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 MRGPRX2Q96LB1 330 aa7.48□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 OLFM3Q96PB7 478 aa7.48□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 DMRTA2Q96SC8 542 aa7.48□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC6A16Q9GZN6 736 aa7.48□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF700Q9H0M5 742 aa7.48□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 KCNK13Q9HB14 408 aa7.48□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 ANO10Q9NW15 660 aa7.48□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 RSPH14Q9UHP6 348 aa7.48□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP7.48□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 ARL5AQ9Y689 179 aa7.48□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa7.47□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM90A27PA6NNH2 459 aa7.47□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 TFECO14948 347 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 SGTAO43765 313 aa7.47□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 STK10O94804 968 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 SLCO2B1O94956 709 aa7.47□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 ITGAMP11215 1152 aa7.47□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 MCM3P25205 808 aa7.47□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 ACRV1P26436 265 aa7.47□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 PKLRP30613 574 aa7.47□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 MC4RP32245 332 aa7.47□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 ARHGAP25P42331 645 aa7.47□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 CHRNA4P43681 627 aa7.47□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 AVPR1BP47901 424 aa7.47□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 AGTR2P50052 363 aa7.47□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 ITIH4Q14624 930 aa7.47□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 CDSNQ15517 529 aa7.47□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 ACER2Q5QJU3 275 aa7.47□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 GARNL3Q5VVW2 1013 aa7.47□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 PLAG1Q6DJT9 500 aa7.47□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC25A25Q6KCM7 469 aa7.47□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 CLEC9AQ6UXN8 241 aa7.47□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 CEP128Q6ZU80 1094 aa7.47□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa7.47□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa7.47□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM57AQ8TBR7 257 aa7.47□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 P3H4Q92791 437 aa7.47□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 ZDHHC16Q969W1 377 aa7.47□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 SCMH1Q96GD3 660 aa7.47□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 FRMD6Q96NE9 622 aa7.47□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF285Q96NJ3 590 aa7.47□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 FICDQ9BVA6 458 aa7.47□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 TGIF2Q9GZN2 237 aa7.47□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 KLHL1Q9NR64 748 aa7.47□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa7.47□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa7.46□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 HACD1B0YJ81 288 aa7.46□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa7.46□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 KRT1P04264 644 aa7.46□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 SERPING1P05155 500 aa7.46□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 CTSBP07858 339 aa7.46□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 SP1P08047 785 aa7.46□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 INHBBP09529 407 aa7.46□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 SKILP12757 684 aa7.46□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 PKMP14618 531 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 ACADLP28330 430 aa7.46□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 GRIA3P42263 894 aa7.46□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 DYNLT1P63172 113 aa7.46□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 XIAPP98170 497 aa7.46□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 PPP2R2BQ00005 443 aa7.46□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 TUBA3CQ13748 450 aa7.46□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 KEAP1Q14145 624 aa7.46□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 BRD3Q15059 726 aa7.46□□□□□ -1.22
PGGT1B-201ENST00000296642 NOMO1Q15155 1222 aa7.46□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms