RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296026.4

CXCL3-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CXCL3, Length 1,075 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3-201ENST00000296026 YBX1P67809 324 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
CXCL3-201ENST00000296026 KLC1Q07866 573 aa18.73■□□□□ 0.59
CXCL3-201ENST00000296026 TYSND1Q2T9J0 566 aa18.73■□□□□ 0.59
CXCL3-201ENST00000296026 RNF44Q7L0R7 432 aa18.73■□□□□ 0.59
CXCL3-201ENST00000296026 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
CXCL3-201ENST00000296026 DNAJB14Q8TBM8 379 aa18.73■□□□□ 0.59
CXCL3-201ENST00000296026 STT3BQ8TCJ2 826 aa18.73■□□□□ 0.59
CXCL3-201ENST00000296026 LPGAT1Q92604 370 aa18.73■□□□□ 0.59
CXCL3-201ENST00000296026 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
CXCL3-201ENST00000296026 C5orf34Q96MH7 638 aa18.73■□□□□ 0.59
CXCL3-201ENST00000296026 MESP1Q9BRJ9 268 aa18.73■□□□□ 0.59
CXCL3-201ENST00000296026 DPH7Q9BTV6 452 aa18.73■□□□□ 0.59
CXCL3-201ENST00000296026 CRB3Q9BUF7 120 aa18.73■□□□□ 0.59
CXCL3-201ENST00000296026 ACAT2Q9BWD1 397 aa18.73■□□□□ 0.59
CXCL3-201ENST00000296026 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
CXCL3-201ENST00000296026 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa18.73■□□□□ 0.59
CXCL3-201ENST00000296026 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa18.73■□□□□ 0.59
CXCL3-201ENST00000296026 DOCK10Q96BY6 2186 aa18.72■□□□□ 0.59
CXCL3-201ENST00000296026 OR2A25A4D2G3 310 aa18.72■□□□□ 0.59
CXCL3-201ENST00000296026 PFDN6O15212 129 aa18.72■□□□□ 0.59
CXCL3-201ENST00000296026 CLDN1O95832 211 aa18.72■□□□□ 0.59
CXCL3-201ENST00000296026 FGGP02679 453 aa18.72■□□□□ 0.59
CXCL3-201ENST00000296026 COL8A1P27658 744 aa18.72■□□□□ 0.59
CXCL3-201ENST00000296026 CMPK1P30085 196 aa18.72■□□□□ 0.59
CXCL3-201ENST00000296026 CARSP49589 748 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
CXCL3-201ENST00000296026 OCA2Q04671 838 aa18.72■□□□□ 0.59
CXCL3-201ENST00000296026 Q0VFX4 171 aa18.72■□□□□ 0.59
CXCL3-201ENST00000296026 GBX1Q14549 363 aa18.72■□□□□ 0.59
CXCL3-201ENST00000296026 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
CXCL3-201ENST00000296026 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
CXCL3-201ENST00000296026 PRMT9Q6P2P2 845 aa18.72■□□□□ 0.59
CXCL3-201ENST00000296026 LRRC8BQ6P9F7 803 aa18.72■□□□□ 0.59
CXCL3-201ENST00000296026 PRSS58Q8IYP2 241 aa18.72■□□□□ 0.59
CXCL3-201ENST00000296026 MAIP1Q8WWC4 291 aa18.72■□□□□ 0.59
CXCL3-201ENST00000296026 MIEF2Q96C03 454 aa18.72■□□□□ 0.59
CXCL3-201ENST00000296026 CNDP1Q96KN2 507 aa18.72■□□□□ 0.59
CXCL3-201ENST00000296026 TCF12Q99081 682 aa18.72■□□□□ 0.59
CXCL3-201ENST00000296026 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa18.72■□□□□ 0.59
CXCL3-201ENST00000296026 EPS8L2Q9H6S3 715 aa18.72■□□□□ 0.59
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
CXCL3-201ENST00000296026 SOX13Q9UN79 622 aa18.72■□□□□ 0.59
CXCL3-201ENST00000296026 CRYL1Q9Y2S2 319 aa18.72■□□□□ 0.59
CXCL3-201ENST00000296026 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa18.71■□□□□ 0.59
CXCL3-201ENST00000296026 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa18.71■□□□□ 0.59
CXCL3-201ENST00000296026 H3BMM5 538 aa18.71■□□□□ 0.59
CXCL3-201ENST00000296026 ESR1P03372 595 aa18.71■□□□□ 0.59
CXCL3-201ENST00000296026 ZGLP1P0C6A0 271 aa18.71■□□□□ 0.59
CXCL3-201ENST00000296026 ERVK-10P10266 1014 aa18.71■□□□□ 0.59
CXCL3-201ENST00000296026 TPSB2P20231 275 aa18.71■□□□□ 0.59
CXCL3-201ENST00000296026 CHRM3P20309 590 aa18.71■□□□□ 0.59
CXCL3-201ENST00000296026 ATP5DP30049 168 aa18.71■□□□□ 0.59
CXCL3-201ENST00000296026 CDK16Q00536 496 aa18.71■□□□□ 0.59
CXCL3-201ENST00000296026 NAA25Q14CX7 972 aa18.71■□□□□ 0.59
CXCL3-201ENST00000296026 TPSAB1Q15661 275 aa18.71■□□□□ 0.59
CXCL3-201ENST00000296026 MUM1Q2TAK8 710 aa18.71■□□□□ 0.59
CXCL3-201ENST00000296026 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
CXCL3-201ENST00000296026 FBXO42Q6P3S6 717 aa18.71■□□□□ 0.59
CXCL3-201ENST00000296026 SUSD1Q6UWL2 747 aa18.71■□□□□ 0.59
CXCL3-201ENST00000296026 KCNMB4Q86W47 210 aa18.71■□□□□ 0.59
CXCL3-201ENST00000296026 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa18.71■□□□□ 0.59
CXCL3-201ENST00000296026 OR9A1PQ8NGU1 263 aa18.71■□□□□ 0.59
CXCL3-201ENST00000296026 COG1Q8WTW3 980 aa18.71■□□□□ 0.59
CXCL3-201ENST00000296026 GALPQ9UBC7 116 aa18.71■□□□□ 0.59
CXCL3-201ENST00000296026 ARHGEF33A8MVX0 844 aa18.7■□□□□ 0.58
CXCL3-201ENST00000296026 MAP2K7O14733 419 aa18.7■□□□□ 0.58
CXCL3-201ENST00000296026 HPP00738 406 aa18.7■□□□□ 0.58
CXCL3-201ENST00000296026 ERGP11308 486 aa18.7■□□□□ 0.58
CXCL3-201ENST00000296026 ACPPP15309 386 aa18.7■□□□□ 0.58
CXCL3-201ENST00000296026 OGNP20774 298 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
CXCL3-201ENST00000296026 FBLP22087 321 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
CXCL3-201ENST00000296026 TSFMP43897 325 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
CXCL3-201ENST00000296026 TERF1P54274 439 aa18.7■□□□□ 0.58
CXCL3-201ENST00000296026 ADARP55265 1226 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
CXCL3-201ENST00000296026 CDC16Q13042 620 aa18.7■□□□□ 0.58
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
CXCL3-201ENST00000296026 KLHL38Q2WGJ6 581 aa18.7■□□□□ 0.58
CXCL3-201ENST00000296026 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa18.7■□□□□ 0.58
CXCL3-201ENST00000296026 ACSBG2Q5FVE4 666 aa18.7■□□□□ 0.58
CXCL3-201ENST00000296026 VWA2Q5GFL6 755 aa18.7■□□□□ 0.58
CXCL3-201ENST00000296026 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
CXCL3-201ENST00000296026 ISLR2Q6UXK2 745 aa18.7■□□□□ 0.58
CXCL3-201ENST00000296026 LINC00696Q6ZRV3 163 aa18.7■□□□□ 0.58
CXCL3-201ENST00000296026 SMPDL3AQ92484 453 aa18.7■□□□□ 0.58
CXCL3-201ENST00000296026 C8orf44Q96CB5 159 aa18.7■□□□□ 0.58
CXCL3-201ENST00000296026 CABS1Q96KC9 395 aa18.7■□□□□ 0.58
CXCL3-201ENST00000296026 C10orf90Q96M02 699 aa18.7■□□□□ 0.58
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF160Q9HCG1 818 aa18.7■□□□□ 0.58
CXCL3-201ENST00000296026 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
CXCL3-201ENST00000296026 LZTFL1Q9NQ48 299 aa18.7■□□□□ 0.58
CXCL3-201ENST00000296026 C3orf18Q9UK00 162 aa18.7■□□□□ 0.58
CXCL3-201ENST00000296026 TEX15Q9BXT5 2789 aa18.7■□□□□ 0.58
CXCL3-201ENST00000296026 E5RI56 91 aa18.69■□□□□ 0.58
CXCL3-201ENST00000296026 H0YGG7 62 aa18.69■□□□□ 0.58
CXCL3-201ENST00000296026 AVILO75366 819 aa18.69■□□□□ 0.58
CXCL3-201ENST00000296026 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
CXCL3-201ENST00000296026 KLHL18O94889 574 aa18.69■□□□□ 0.58
CXCL3-201ENST00000296026 PKMP14618 531 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
CXCL3-201ENST00000296026 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP18.69■□□□□ 0.58
CXCL3-201ENST00000296026 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP18.69■□□□□ 0.58
CXCL3-201ENST00000296026 MFAP5Q13361 173 aa18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.2 ms