RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 COPS7AQ9UBW8 275 aa20.63■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 Q9Y3F1 56 aa20.63■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 WRBO00258 174 aa20.63■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 TYROBPO43914 113 aa20.63■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 ALPIP09923 528 aa20.63■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 IL12BP29460 328 aa20.63■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 EMX2Q04743 252 aa20.63■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 CBLBQ13191 982 aa20.63■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 PIM3Q86V86 326 aa20.63■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 CILP2Q8IUL8 1156 aa20.63■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 RIT1Q92963 219 aa20.63■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 RNF39Q9H2S5 420 aa20.63■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 AASSQ9UDR5 926 aa20.63■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 MED31Q9Y3C7 131 aa20.63■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa20.62■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 MANBAO00462 879 aa20.62■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 SLC31A1O15431 190 aa20.62■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 EBLN1P0CF75 366 aa20.62■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 NDUFS1P28331 727 aa20.62■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 SLC13A2Q13183 592 aa20.62■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 GAL3ST4Q96RP7 486 aa20.62■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 YIPF1Q9Y548 306 aa20.62■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 SAP18O00422 153 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 TGFB1P01137 390 aa20.62■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 PYURFQ96I23 114 aa20.62■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 CCM2Q9BSQ5 444 aa20.62■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 CST11Q9H112 138 aa20.62■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 GKN1Q9NS71 199 aa20.62■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 C14orf105Q9NVL8 296 aa20.62■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 RIMKLBQ9ULI2 386 aa20.62■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 ATF6P18850 670 aa20.62■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 ACVR2AP27037 513 aa20.62■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 ACVRL1P37023 503 aa20.62■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 AVPR1BP47901 424 aa20.62■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 CDH15P55291 814 aa20.62■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 UFM1P61960 85 aa20.62■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 NUP54Q7Z3B4 507 aa20.62■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa20.62■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 CTPS2Q9NRF8 586 aa20.62■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 SLC22A14Q9Y267 594 aa20.62■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 TRBC2A0A5B9 178 aa20.62■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 DLDP09622 509 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 BNIP3Q12983 259 aa20.62■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 COLEC12Q5KU26 742 aa20.62■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 TUBA3EQ6PEY2 450 aa20.62■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 TSPEARQ8WU66 669 aa20.62■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 BIRC7Q96CA5 298 aa20.62■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 KCNC2Q96PR1 638 aa20.62■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 POPDC3Q9HBV1 291 aa20.62■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF224Q9NZL3 707 aa20.62■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 BAIAP2Q9UQB8 552 aa20.62■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 CACNA1FO60840 1977 aa20.62■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 H3BSA7 217 aa20.61■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 PEPDP12955 493 aa20.61■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 CLCN7P51798 805 aa20.61■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 TSPAN5P62079 268 aa20.61■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 CDK6Q00534 326 aa20.61■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 TUBA3CQ13748 450 aa20.61■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 LRRC73Q5JTD7 316 aa20.61■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 ZUFSPQ96AP4 578 aa20.61■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 MID1O15344 667 aa20.61■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 CCSER2Q9H7U1 834 aa20.61■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 TMLHEQ9NVH6 421 aa20.61■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 PHF24Q9UPV7 400 aa20.61■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 EPOP01588 193 aa20.61■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 OR9I1Q8NGQ6 314 aa20.61■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 CD99L2Q8TCZ2 262 aa20.61■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 CYP2S1Q96SQ9 504 aa20.61■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 LGR4Q9BXB1 951 aa20.61■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 FKBP7Q9Y680 259 aa20.61■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 CREG1O75629 220 aa20.61■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 RENP00797 406 aa20.61■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF30P17039 623 aa20.61■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 DCDC1P59894 354 aa20.61■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 SEMG2Q02383 582 aa20.61■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 LRRC32Q14392 662 aa20.61■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 LINGO2Q7L985 606 aa20.61■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 UBE2J2Q8N2K1 259 aa20.61■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 IL4I1Q96RQ9 567 aa20.61■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 LOC730098B7Z3J9 87 aa20.6■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 MCEMP1Q8IX19 187 aa20.6■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 WDR26Q9H7D7 661 aa20.6■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 IFT46Q9NQC8 304 aa20.6■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 MALT1Q9UDY8 824 aa20.6■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 TEX46H3BTG2 121 aa20.6■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 GATBO75879 557 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 TACSTD2P09758 323 aa20.6■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 PSKH1P11801 424 aa20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.3 ms