RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283628.9

UBP1-201, Transcript of upstream binding protein 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene UBP1, Length 2,074 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1-201ENST00000283628 NUAK1O60285 661 aa27.21■■□□□ 1.95
UBP1-201ENST00000283628 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP27.21■■□□□ 1.95
UBP1-201ENST00000283628 GABARAPO95166 117 aa27.21■■□□□ 1.95
UBP1-201ENST00000283628 PRPS1L1P21108 318 aa27.21■■□□□ 1.95
UBP1-201ENST00000283628 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP27.21■■□□□ 1.95
UBP1-201ENST00000283628 NEK2P51955 445 aa27.21■■□□□ 1.95
UBP1-201ENST00000283628 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP27.21■■□□□ 1.95
UBP1-201ENST00000283628 SP140Q13342 867 aa27.21■■□□□ 1.95
UBP1-201ENST00000283628 ERICH5Q6P6B1 374 aa27.21■■□□□ 1.95
UBP1-201ENST00000283628 CYP4Z1Q86W10 505 aa27.21■■□□□ 1.95
UBP1-201ENST00000283628 CNIH3Q8TBE1 160 aa27.21■■□□□ 1.95
UBP1-201ENST00000283628 SCRN2Q96FV2 425 aa27.21■■□□□ 1.95
UBP1-201ENST00000283628 CPQQ9Y646 472 aa27.21■■□□□ 1.95
UBP1-201ENST00000283628 PRMT3O60678 531 aa27.2■■□□□ 1.95
UBP1-201ENST00000283628 ZNF682O95780 498 aa27.2■■□□□ 1.95
UBP1-201ENST00000283628 MPC1LP0DKB6 136 aa27.2■■□□□ 1.95
UBP1-201ENST00000283628 AMD1P17707 334 aa27.2■■□□□ 1.95
UBP1-201ENST00000283628 B4GALNT1Q00973 533 aa27.2■■□□□ 1.95
UBP1-201ENST00000283628 KCNC4Q03721 635 aa27.2■■□□□ 1.95
UBP1-201ENST00000283628 ZNF846Q147U1 533 aa27.2■■□□□ 1.95
UBP1-201ENST00000283628 DUOXA1Q1HG43 343 aa27.2■■□□□ 1.95
UBP1-201ENST00000283628 KDM4DQ6B0I6 523 aa27.2■■□□□ 1.95
UBP1-201ENST00000283628 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP27.2■■□□□ 1.95
UBP1-201ENST00000283628 MCOLN3Q8TDD5 553 aa27.2■■□□□ 1.95
UBP1-201ENST00000283628 ASB11Q8WXH4 323 aa27.2■■□□□ 1.95
UBP1-201ENST00000283628 APIPQ96GX9 242 aa27.2■■□□□ 1.95
UBP1-201ENST00000283628 FCRL1Q96LA6 429 aa27.2■■□□□ 1.95
UBP1-201ENST00000283628 TOX2Q96NM4 488 aa27.2■■□□□ 1.95
UBP1-201ENST00000283628 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP27.2■■□□□ 1.95
UBP1-201ENST00000283628 SLC22A1O15245 554 aa27.2■■□□□ 1.94
UBP1-201ENST00000283628 SLC16A5O15375 505 aa27.2■■□□□ 1.94
UBP1-201ENST00000283628 FTH1P02794 183 aa27.2■■□□□ 1.94
UBP1-201ENST00000283628 ZXDBP98169 803 aa27.2■■□□□ 1.94
UBP1-201ENST00000283628 TLE2Q04725 743 aa27.2■■□□□ 1.94
UBP1-201ENST00000283628 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP27.2■■□□□ 1.94
UBP1-201ENST00000283628 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa27.2■■□□□ 1.94
UBP1-201ENST00000283628 CARD16Q5EG05 197 aa27.2■■□□□ 1.94
UBP1-201ENST00000283628 MPP7Q5T2T1 576 aa27.2■■□□□ 1.94
UBP1-201ENST00000283628 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa27.2■■□□□ 1.94
UBP1-201ENST00000283628 LRRC66Q68CR7 880 aa27.2■■□□□ 1.94
UBP1-201ENST00000283628 USP45Q70EL2 814 aa27.2■■□□□ 1.94
UBP1-201ENST00000283628 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP27.2■■□□□ 1.94
UBP1-201ENST00000283628 ZBTB46Q86UZ6 589 aa27.2■■□□□ 1.94
UBP1-201ENST00000283628 RORBQ92753 470 aa27.2■■□□□ 1.94
UBP1-201ENST00000283628 DUSP21Q9H596 190 aa27.2■■□□□ 1.94
UBP1-201ENST00000283628 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP27.2■■□□□ 1.94
UBP1-201ENST00000283628 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP27.2■■□□□ 1.94
UBP1-201ENST00000283628 PPIL1Q9Y3C6 166 aa27.2■■□□□ 1.94
UBP1-201ENST00000283628 FUOMA2VDF0 154 aa27.19■■□□□ 1.94
UBP1-201ENST00000283628 CLDN25C9JDP6 229 aa27.19■■□□□ 1.94
UBP1-201ENST00000283628 PRRG1O14668 218 aa27.19■■□□□ 1.94
UBP1-201ENST00000283628 XYLBO75191 536 aa27.19■■□□□ 1.94
UBP1-201ENST00000283628 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
UBP1-201ENST00000283628 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
UBP1-201ENST00000283628 ZNF33BQ06732 778 aa27.19■■□□□ 1.94
UBP1-201ENST00000283628 PTCHD3Q3KNS1 767 aa27.19■■□□□ 1.94
UBP1-201ENST00000283628 TRIM60Q495X7 471 aa27.19■■□□□ 1.94
UBP1-201ENST00000283628 DGKKQ5KSL6 1271 aa27.19■■□□□ 1.94
UBP1-201ENST00000283628 FRG2Q64ET8 278 aa27.19■■□□□ 1.94
UBP1-201ENST00000283628 OR4F3Q6IEY1 312 aa27.19■■□□□ 1.94
UBP1-201ENST00000283628 NOXRED1Q6NXP6 359 aa27.19■■□□□ 1.94
UBP1-201ENST00000283628 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP27.19■■□□□ 1.94
UBP1-201ENST00000283628 FRG2BQ96QU4 278 aa27.19■■□□□ 1.94
UBP1-201ENST00000283628 HMG20AQ9NP66 347 aa27.19■■□□□ 1.94
UBP1-201ENST00000283628 EXD2Q9NVH0 621 aa27.19■■□□□ 1.94
UBP1-201ENST00000283628 SCN3BQ9NY72 215 aa27.19■■□□□ 1.94
UBP1-201ENST00000283628 ABCG2Q9UNQ0 655 aa27.19■■□□□ 1.94
UBP1-201ENST00000283628 COL4A6Q14031 1691 aa27.18■■□□□ 1.94
UBP1-201ENST00000283628 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
UBP1-201ENST00000283628 MITFO75030 526 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
UBP1-201ENST00000283628 SEMG1P04279 462 aa27.18■■□□□ 1.94
UBP1-201ENST00000283628 UGT2B4P06133 528 aa27.18■■□□□ 1.94
UBP1-201ENST00000283628 FPR1P21462 350 aa27.18■■□□□ 1.94
UBP1-201ENST00000283628 EPHB3P54753 998 aa27.18■■□□□ 1.94
UBP1-201ENST00000283628 LMAN2Q12907 356 aa27.18■■□□□ 1.94
UBP1-201ENST00000283628 SLC14A1Q13336 389 aa27.18■■□□□ 1.94
UBP1-201ENST00000283628 VMACQ2NL98 169 aa27.18■■□□□ 1.94
UBP1-201ENST00000283628 NIPAL1Q6NVV3 410 aa27.18■■□□□ 1.94
UBP1-201ENST00000283628 IGFN1Q86VF2 1251 aa27.18■■□□□ 1.94
UBP1-201ENST00000283628 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
UBP1-201ENST00000283628 APOLD1Q96LR9 279 aa27.18■■□□□ 1.94
UBP1-201ENST00000283628 APOL4Q9BPW4 351 aa27.18■■□□□ 1.94
UBP1-201ENST00000283628 RIBC2Q9H4K1 309 aa27.18■■□□□ 1.94
UBP1-201ENST00000283628 NECTIN3Q9NQS3 549 aa27.18■■□□□ 1.94
UBP1-201ENST00000283628 DNAJC11Q9NVH1 559 aa27.18■■□□□ 1.94
UBP1-201ENST00000283628 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa27.18■■□□□ 1.94
UBP1-201ENST00000283628 XPNPEP2O43895 674 aa27.18■■□□□ 1.94
UBP1-201ENST00000283628 SOD2P04179 222 aa27.18■■□□□ 1.94
UBP1-201ENST00000283628 PORP16435 677 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
UBP1-201ENST00000283628 ACVR2AP27037 513 aa27.18■■□□□ 1.94
UBP1-201ENST00000283628 OPRL1P41146 370 aa27.18■■□□□ 1.94
UBP1-201ENST00000283628 DAPP51397 102 aa27.18■■□□□ 1.94
UBP1-201ENST00000283628 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
UBP1-201ENST00000283628 SLC35A2P78381 396 aa27.18■■□□□ 1.94
UBP1-201ENST00000283628 GTF2H3Q13889 308 aa27.18■■□□□ 1.94
UBP1-201ENST00000283628 NEK5Q6P3R8 708 aa27.18■■□□□ 1.94
UBP1-201ENST00000283628 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa27.18■■□□□ 1.94
UBP1-201ENST00000283628 GALNT5Q7Z7M9 940 aa27.18■■□□□ 1.94
UBP1-201ENST00000283628 CPXM2Q8N436 756 aa27.18■■□□□ 1.94
UBP1-201ENST00000283628 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms